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Uma abordagem genômica para o entendimento do crescimento fastidioso de Leifsonia xyli subsp. xyli (2006)

  • Authors:
  • Autor USP: ROSA, DANIEL DIAS - ESALQ
  • Unidade: ESALQ
  • Sigla do Departamento: LEF
  • Subjects: BACTÉRIAS GRAM-POSITIVAS; CANA-DE-AÇÚCAR; EXPRESSÃO GÊNICA; GENES; MEIOS DE CULTURA; RAQUITISMO DAS SOQUEIRAS
  • Language: Português
  • Abstract: A cana-de-açúcar (Saccharum officinarum L.) é uma das mais importantes culturas agrícolas. Cultivada em mais de 127 países, a cultura se apresenta como um dos alicerces para a socioeconomia e cultura de muitas regiões do Brasil e do mundo. Sua produtividade depende de diversos fatores, sendo esses atendidos pela intensa hibridação interespecífica visando principalmente à obtenção de cultivares mais produtivas, precoces e resistentes a diversos tipos de estresses. Entre os estresses, os causados por microorganismos são os mais relevantes e, dentre estes, destaca-se o agente causal da doença raquitismo da soqueira da cana-de-açúcar, a bactéria Leifsonia xyli subsp. xyli (Lxx). O estudo mais aprofundado sobre esta relação patógenohospedeiro é difícil, visto que Lxx é uma bactéria fastidiosa de difícil cultivo. O sequenciamento completo de seu genoma abriu a oportunidade de se entender às causas fisiológicas da dificuldade do seu cultivo. Assim, os objetivos deste trabalho foram otimizar um meio de cultura para Lxx com base em análise de vias metabólicas importantes e estudar a expressão diferencial de seus genes quando esta é cultivada na presença e ausência de metionina. Análises bioinformáticas do genoma de Lxx indicaram que esta está apta a utilizar diversas fontes de carbono, de vitaminas, de ferro e aminoácidos. De fato, dentre as fontes de carbono testadas verificou-se o crescimento de Lxx utilizando manose, frutose e galactose, embora em menoreficiência do que glicose. Observou-se também a utilização das vitaminas cobalamina, tiamina, biotina e complexo vitamínico de Nitsch, sendo que o acréscimo destes elementos resultou numa maior taxa de crescimento de Lxx. Verificou-se também que Lxx está apta a utilizar citrato, sulfato e cloreto de ferro como fontes deste metal, mas em menor eficiência que quando comparada a hemina bovina. Com estes resultados, verificamos ) que a adição do aminoácido metionina (1 g/L) e das vitaminas D-biotina (0,01 g/L) e cloreto de tiamina (0,01 g/L) obtém-se um desenvolvimento mais acelerado, em média 30%. Na análise da expressão gênica na presença da metionina, verificou-se uma regulação diferencial de 114 genes, sendo que destes 95 foram regulados positivamente e 19 negativamente. Os resultados indicam que Lxx necessita de metionina e que ela utiliza esse aminoácido como uma possível fonte de nitrogênio. Indicaram também que maior crescimento na presença de metionina está relacionado a uma regulação gênica positiva de genes do metabolismo central
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 02.10.2006
  • Acesso à fonte
    How to cite
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    • ABNT

      ROSA, Daniel Dias; CAMARGO, Luis Eduardo Aranha. Uma abordagem genômica para o entendimento do crescimento fastidioso de Leifsonia xyli subsp. xyli. 2006.Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2006. Disponível em: < http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-16112006-095127/ >.
    • APA

      Rosa, D. D., & Camargo, L. E. A. (2006). Uma abordagem genômica para o entendimento do crescimento fastidioso de Leifsonia xyli subsp. xyli. Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-16112006-095127/
    • NLM

      Rosa DD, Camargo LEA. Uma abordagem genômica para o entendimento do crescimento fastidioso de Leifsonia xyli subsp. xyli [Internet]. 2006 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-16112006-095127/
    • Vancouver

      Rosa DD, Camargo LEA. Uma abordagem genômica para o entendimento do crescimento fastidioso de Leifsonia xyli subsp. xyli [Internet]. 2006 ;Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11135/tde-16112006-095127/

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