Identificação de regiões codificantes de proteína através da transformada modificada de Morlet (2005)
- Authors:
- Autor USP: CHALCO, JESUS PASCUAL MENA - IME
- Unidade: IME
- Sigla do Departamento: MAC
- Assunto: COMPUTAÇÃO GRÁFICA
- Agências de fomento:
- Language: Português
- Abstract: Um tópico importante na análise de seqüências biológicas é a busca de genes, ou seja, a identificação de regiões codificantes de proteínas. Esta identificaçõ permite posterior procura de significado, descrição e categorização biológica do organismo analisado. Atualmente, vários métodos combinam reconhecimento de padrões com conhecimento coletado de conjuntos de treinamento ou de comparações com banco de dados genômicos. Entretanto, a acurácia desses métodos está ainda longe do satisfatório. Novos métodos de processamento de seqüências de DNA e de identificação de genes podem ser criados através da busca por conteúdo (search-by-content). O padrão periódico de DNA em regiões codificantes de proteína, denominada periodicidade de três bases, vem sendo considerado uma propriedade dessas regiões. As técnicas de processamento digital de sinais fornecem uma base robusta para a identificação de regiões com periodicidade de três bases. Nesta dissertação, são apresentadaos um pipeline bioinformático, os conceitos básicos da identificação genômica e métodos de processamento digital de sinais utilizados para a identificação de regiões codificantes de proteínas. Introduzimos um novo método para a identificação dessas regiões, baseado na transformada proposta, denominada Transformada Modificada de Morlet. Apresentamos vários resultados experimentais obtidos a partir de seqüências de DNA sintéticas e reais. As principais contribuições do trabalho consistem nodesenvolvimento de um pipeline bioinformático para projetos genoma e na criação de um método de identificação de regiões codificantes onde a periodicidade de três bases seja latente. O método apresenta desempenho superior e vantagens importantes em comparação ao método tradicional baseado na transformada de Fourier de tempo reduzido
- Imprenta:
- Data da defesa: 19.10.2005
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ABNT
MENA-CHALCO, Jesús Pascual. Identificação de regiões codificantes de proteína através da transformada modificada de Morlet. 2005. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2005. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-05062007-115359/. Acesso em: 28 dez. 2025. -
APA
Mena-Chalco, J. P. (2005). Identificação de regiões codificantes de proteína através da transformada modificada de Morlet (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-05062007-115359/ -
NLM
Mena-Chalco JP. Identificação de regiões codificantes de proteína através da transformada modificada de Morlet [Internet]. 2005 ;[citado 2025 dez. 28 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-05062007-115359/ -
Vancouver
Mena-Chalco JP. Identificação de regiões codificantes de proteína através da transformada modificada de Morlet [Internet]. 2005 ;[citado 2025 dez. 28 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-05062007-115359/ - Reconstrução de faces 3D através de espaços de componentes principais
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