Caracterização da estrutura do gene do microRNA miR 223: um microRNA amplamente expresso em células hematopoéticas (2006)
- Authors:
- Autor USP: KODAMA, KELSON ROBERTO - FMRP
- Unidade: FMRP
- Sigla do Departamento: RGE
- Assunto: NEOPLASIAS (GENÉTICA)
- Language: Português
- Abstract: Os dados iniciais deste trabalho foram gerados a partir de análises computacionais (in silico) preliminares. Foi realizada a anotação dos grupos gênicos (clustrers) oriundos de um banco de seqüências ORESTES de leucemia mielóide crônica (LMC) e leucemia mielóide aguda (LMA). Uma das análises identificou um cluster de três ORESTES alinhando em Xq12, com a possibilidade de se tratar de um novo gene, em uma etapa posterior, foram desenhados primers nas extremidades da região de predição para a validação experimental por meio de RT-PCR. Com o seqüenciamento dos fragmentos gerados a partir do RT -PCR foram identificadas duas formas alternativas do gene. Foi encontrada uma homologia com seis seqüências de primatas depositadas no genebank denominadas miR-223, com identidade absoluta de 37 nucleotídeos contendo a região referente ao microRNA maduro. Os microRNAs são uma família de pequenos (em torno de 22 nucleotídeos) RNAs não codificadores de proteínas encontrados em diferentes organismos. Esses pequenos RNAs atuam regulando negativamente a expressão gênica no nível pós-transcrição. Os microRNAs têm papel importante em diversas vias regulatórias, incluindo o controle do desenvolvimento, diferenciação de células hematopoéticas, apoptose, proliferação celular e organogênese. A análise da estrutura secundária mostrou o Harpin-Stem Loop, estrutura característica do pré-microRNA. A validação experimental usando PCR em tempo real detectou a presença do microRNAmaduro em medula óssea normal, baço e leucemias agudas e crônicas, e ausência em outros tecidos. O PCR em tempo-real dos transcritos primários, usando sondas específicas para as duas isoformas, demonstrou uma expressão mais elevada em uma delas. Usando o método de RACE (Rápida Amplificação das Extremidades do cDNA) foi definida a região 5' e 3' do gene do microRNA miR-223. Neste trabalho nós caracterizamos a estrutura do gene do microRNA miR-223 e demonstramos que este gene é gerador do microRNA miR-223
- Imprenta:
- Publisher place: Ribeirão Preto
- Date published: 2006
- Data da defesa: 06.06.2006
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ABNT
KODAMA, Kelson Roberto. Caracterização da estrutura do gene do microRNA miR 223: um microRNA amplamente expresso em células hematopoéticas. 2006. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2006. . Acesso em: 27 set. 2024. -
APA
Kodama, K. R. (2006). Caracterização da estrutura do gene do microRNA miR 223: um microRNA amplamente expresso em células hematopoéticas (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. -
NLM
Kodama KR. Caracterização da estrutura do gene do microRNA miR 223: um microRNA amplamente expresso em células hematopoéticas. 2006 ;[citado 2024 set. 27 ] -
Vancouver
Kodama KR. Caracterização da estrutura do gene do microRNA miR 223: um microRNA amplamente expresso em células hematopoéticas. 2006 ;[citado 2024 set. 27 ]
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