Construção de um mapa de ligação de maracujazeiro amarelo (passiflora edulis sims. F. Flavicarpa deg.) Baseado em marcadores microssatélites e aflp (2005)
- Authors:
- USP affiliated authors: GARCIA, ANTONIO AUGUSTO FRANCO - ESALQ ; VIEIRA, MARIA LUCIA CARNEIRO - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Subjects: MARACUJÁ; MARCADOR MOLECULAR
- Language: Português
- Abstract: Desenvolver um software que permitisse a realização das análises de ligação em espécies alógamas segundo metodologia de Wu et al. (2002). Construir um mapa para o maracujá-amarelo, utilizando dados de marcadores microssatélites e AFLP. Material e/ou métodos: Foi desenvolvido um software, em linguagem R, para realização da análise de dois pontos mencionada. Adicionalmente, foram adaptadas funções para ordenação de marcadores através dos métodos Seriation e Rapid Chain Delineation. A fim de se testar seu funcionamento, foi simulado um conjunto de dados, em que 100 indivíduos de uma espécie monóica e diplóide, derivados de um cruzamento entre parentais heterozigóticos, foram genotipados para 5 marcadores com diferentes padrões de segregação, com ordem conhecida. As funções foram aplicadas nesses marcadores e os resultados comparados com o esperado teórico. Resultados: As funções realizaram corretamente as análises, gerando estimativas das frações de recombinação e das verossimilhanças para os quatro possíveis arranjos alélicos (fases de ligação) entre dois marcadores. A análise dos 5 marcadores mostrou que a ordem foi corretamente estimada. De acordo com o esperado, algumas combinações de marcadores não são informativas do ponto de vista genético. Conclusões: Todas as funções funcionaram adequadamente e podem ser aplicadas em dados reais. A construção do mapa do maracujá será conduzida pelo pós-graduando E. J. de Oliveira, como parte de sua tese de doutorado
- Imprenta:
- Source:
- Título: Agropecuária; resumos
- Conference titles: Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo
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ABNT
MARGARIDO, G. R. A. e OLIVEIRA, E. J. de e GARCIA, Antonio Augusto Franco. Construção de um mapa de ligação de maracujazeiro amarelo (passiflora edulis sims. F. Flavicarpa deg.) Baseado em marcadores microssatélites e aflp. 2005, Anais.. São Paulo: USP, 2005. . Acesso em: 29 dez. 2025. -
APA
Margarido, G. R. A., Oliveira, E. J. de, & Garcia, A. A. F. (2005). Construção de um mapa de ligação de maracujazeiro amarelo (passiflora edulis sims. F. Flavicarpa deg.) Baseado em marcadores microssatélites e aflp. In Agropecuária; resumos. São Paulo: USP. -
NLM
Margarido GRA, Oliveira EJ de, Garcia AAF. Construção de um mapa de ligação de maracujazeiro amarelo (passiflora edulis sims. F. Flavicarpa deg.) Baseado em marcadores microssatélites e aflp. Agropecuária; resumos. 2005 ;[citado 2025 dez. 29 ] -
Vancouver
Margarido GRA, Oliveira EJ de, Garcia AAF. Construção de um mapa de ligação de maracujazeiro amarelo (passiflora edulis sims. F. Flavicarpa deg.) Baseado em marcadores microssatélites e aflp. Agropecuária; resumos. 2005 ;[citado 2025 dez. 29 ] - Desenvolvimento da bacteriose causada por Xanthomonas campestris pv. passiflora em maracujá-amarelo: implicações nas análises de QRL
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