Estudo comparativo da expressão gênica nos órgãos vegetativos e reprodutivos de Nicotina tabacum (2005)
- Authors:
- Autor USP: QUIAPIM, ANDREA CARLA - FFCLRP
- Unidade: FFCLRP
- Sigla do Departamento: 592
- Subjects: GENÉTICA VEGETAL; FISIOLOGIA VEGETAL; REPRODUÇÃO VEGETAL
- Language: Português
- Abstract: O pistilo é um órgão de importância central na reprodução de plantas e, portanto, faz-se necessário um melhor conhecimento deste órgão e do seu funcionamento. No processo de reprodução, o pistilo exerce duas funções principais: a produção do gametófito feminino (ou saco embrionário) e a discriminação entre os diferentes tipos de grãos de pólen recebidos. Esta segunda função, exercida pelos tecidos especializados do estigma (zona secretória) e estilete (tecido transmissor), é responsável pelo sucesso do processo de polinização. O objetivo geral deste trabalho é comparar a expressão gênica no estigma/estilete e nos diferentes órgãos vegetativos, estabelecendo a base para o estudo das funções destes genes na reprodução das plantas. Para alcançar este objetivo, foi construída uma biblioteca de cDNAs de estigmas/estiletes de Nicotiana tabacum, com um total de 15.360 clones de cDNA, dos quais 12.480 clones foram sequenciados a partir da extremidade 5', para gerar ESTs (etiquetas de sequências expressas). Após análise de qualidade pelo Programa Phred/Phrap/Consed, foram gerados 10.637 ESTs válidos e estas informações foram organizadas em um banco de dados (http://143.107.203.68/Mhelena/default.html) denominado TOBESTs. Os ESTs foram clusterizados pelo programa CAP3, que resultou na identificação de 4.930 transcritos putativos (ou genes), sendo 1.671 "contigs" e 3.259 "singlets". Estes transcritos foram categorizados em: metabolismo celular; metabolismo de proteínas;metabolismo de RNA; divisão celular e síntese de DNA; estrutura e função celular; resposta a estresses, proteínas hipotéticas; proteínas desconhecidas; e proteínas sem categoria definida (miscelânea). Foram selecionados 616 "singlets" e 176 "contigs", que foram rearranjados em placas de 96 poços ("macroarray"), totalizando 792 genes em análise. Estes clones foram aplicados em quadruplicata em membranas de náilon, que foram hibridadas com 2 sondas de ... cDNA preparadas a partir de estigmas/estiletes e órgãos vegetativos (raiz, caule, folha, sépalas e pétalas). A partir dessa análise foram identificados 24 clones mais expressos em estigmas/estiletes. Dois destes clones foram analisados por RT-PCR em tempo real, confirmando a expressão preferencial em estigmas/estiletes. Para um melhor entendimento da origem e evolução da espécie Nicotiana tabacum foi feita uma comparação das seqüências de três genes do pistilo (AGPNa3, STIG1 e TTS1), com as seqüências destes genes nas possíveis espécies ancestrais (Nicotiana sylvestris e Nicotiana tomentosiformis)
- Imprenta:
- Publisher place: Ribeirão Preto
- Date published: 2005
- Data da defesa: 31.03.2005
-
ABNT
QUIAPIM, Andréa Carla. Estudo comparativo da expressão gênica nos órgãos vegetativos e reprodutivos de Nicotina tabacum. 2005. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2005. . Acesso em: 27 dez. 2025. -
APA
Quiapim, A. C. (2005). Estudo comparativo da expressão gênica nos órgãos vegetativos e reprodutivos de Nicotina tabacum (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. -
NLM
Quiapim AC. Estudo comparativo da expressão gênica nos órgãos vegetativos e reprodutivos de Nicotina tabacum. 2005 ;[citado 2025 dez. 27 ] -
Vancouver
Quiapim AC. Estudo comparativo da expressão gênica nos órgãos vegetativos e reprodutivos de Nicotina tabacum. 2005 ;[citado 2025 dez. 27 ] - Caracterização do gene da pectina acetilesterase específica do pistilo de Nicotiana tabacum L. (Solanaceae)
- Uma nova DEAD-box RNA helicase de plantas associada a fatores de transcrição
- Silencing of a pectin acetylesterase (PAE) gene highly expressed in tobacco pistils negatively affects pollen tube growth
- The Nicotiana tabacum CDKG;2 is involved in flowering, transcription, splicing and cell cycle control
- SCI1 expression in Nicotiana tabacum floral meristems is regulated by the transcription factors WUSCHEL, aintegumenta-like6 and agamous
- SCI1, a flower regulator of cell proliferation, and its partners NtCDKG2 and NtRH35 interact with the splicing machinery
- A novel plant DEAD-box RNA helicase associated with transcription factors
- Unveiling the movement of RanBP1 during the cell cycle and its interaction with a Cyclin-Dependent Kinase (CDK) in plants
- SCI1 (stigma/style cell-cycle inhibitor 1) and its interaction partner, NtDDX41, are new plant spliceosome-associated factors
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