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Identificação de genes por comparação de seqüências (2005)

  • Authors:
  • USP affiliated author: ADI, SAID SADIQUE - IME
  • School: IME
  • Sigla do Departamento: MAC
  • Subject: ALGORITMOS E ESTRUTURAS DE DADOS
  • Language: Português
  • Abstract: Com os avanços das técnicas de sequenciamento das moléculas de DNA, nos deparamos atualmente com um número expressivo de seqüências genômicas a serem analisadas. Dentre as várias informações de interesse guardadas em uma seqüência desse tipo está a localização de cada um de seus genes. O problema da identificação de genes em seqüências eucarióticas continua em aberto mesmo após os avanços obtidos com o desenvolvimento de métodos e ferramentas computacionais dedicadas a ele. Nesse trabalho propomos três heurísticas distintas para a tarefa de localização dos genes em uma seqüência de DNA eucariótica. Todas elas se baseiam na comparação de duas ou mais seqüências genômicas. A primneira dessas heurísticas trata a tarefa de identificar os genes em uma seqüência de interesse comparando-a com uma seqüência de cDNA. Isso é feito por meio da busca por um alinhamento especial entre duas seqüências denominado alinhamento spliced. Na segunda heurística, abordamos o problema do alinhamento sintênico entre duas seqüências e sua aplicação na tarefa de identificação de genes. Por último, temos uma heurística que trata o problema da identificação de genes seguindo uma nova abordagem. Nela, várias seqüências genômicas são comparadas na busca pelos seus genes. A precisão de cada um dos nossos programas compara-se àquelas de outros programas de predição descritos na literatura.
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 25.05.2005
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    • ABNT

      ADI, Said Sadique. Identificação de genes por comparação de seqüências. 2005. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2005. Disponível em: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-20210729-141959/. Acesso em: 18 ago. 2022.
    • APA

      Adi, S. S. (2005). Identificação de genes por comparação de seqüências (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-20210729-141959/
    • NLM

      Adi SS. Identificação de genes por comparação de seqüências [Internet]. 2005 ;[citado 2022 ago. 18 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-20210729-141959/
    • Vancouver

      Adi SS. Identificação de genes por comparação de seqüências [Internet]. 2005 ;[citado 2022 ago. 18 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/45/45134/tde-20210729-141959/


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