Identificação de interações proteína-proteína envolvendo os produtos dos loci hrp, vir e rpf do fitopatógeno Xanthomonas axonopodis pv. citri (2004)
- Authors:
- Autor USP: ALEGRIA, MARCOS CASTANHEIRA - IQ
- Unidade: IQ
- Sigla do Departamento: QBQ
- Subjects: GENOMAS (ESTUDO); FITOPATÓGENOS; XANTHOMONAS (ESTUDO); BIOLOGIA MOLECULAR VEGETAL
- Language: Português
- Abstract: O Cancro Cítrico, um dos mais graves problemas fitossanitários da citricultura atual, é uma doença causada pelo fitopatógeno Xanthomonas axonopodis pv. citri (Xac) Um estudo funcional do genoma de Xac foi iniciado com o intuito de identificar interações proteína-proteína envolvidas em processos de patogenicidade de Xac. Através da utilização do sistema duplo-híbrido de levedura, baseado nos domínios de ligação ao DNA e ativação da transcrição do GAL4, nós analisamos os principais componentes dos mecanismos de patogenicidade de Xac, incluindo o Sistema de Secreção do Tipo III (TTSS), Sistema de Secreção do Tipo IV (TFSS) e Sistema de "Quorum Sensing" composto pelas proteínas Rpf. Componentes desses sistemas foram utilizados como iscas na triagem de uma biblioteca genômica de Xac. O TTSS é codificado pelos genes denominados hrp ("hypersensitive response and pathogenicity"), hrc ("hrp conserved") e hpa ("hrp associated") localizados no locus hrp do cromossomo de Xac. Esse sistema de secreção é capaz de translocar proteínas efetoras do citoplasma bacteriano para o interior da célula hospedeira. Nossos resultados mostraram novas interações proteínaproteína entre componentes do próprio TTSS além de associações específicas com uma proteína hipotética: 1) HrpG, um regulador de resposta de um sistema de dois componentes responsável pela expressão dos genes hrp, e XAC0095, uma proteína hipotética encontrada apenas em Xanthomonas spp; 2) HpaA, uma proteínasecretada pelo TTSS, HpaB e o domínio C-terminal da HrcV; 3) HrpB1, HrpD6 e HrpW, 4) HrpB2 e HrcU e 5) interações homotrópicas envolvendo a ATPase HrcN. Em Xac, foram encontrados dois loci vir que codificam proteínas que possuem similaridade com componentes do TFSS envolvido em processos de conjugação/secreção bacteriana: TFSS-plasmídeo localizado no plasmídeo pXAC64 e TFSS-cromossomo localizado no cromossomo de Xac. O TFSSplasmídeo, o qual possui maior similaridade ) com sistemas de conjugação, mostrou interações envolvendo proteínas cujos genes estão localizados na mesma região do plasmídeo pXAC64: 1) interação homotrópica da TrwA; 2) XACb0032 e XACb0033; 3) interações homotrópicas da proteína XACb0035; 4) VirB1 e VirB9; 5) XACb0042 e VirB6; 6) XACb0043 e XACb0021b. O TFSS-cromossomo apresentou interações envolvendo as proteínas: 1) VirD4 e um grupo de 12 proteínas que contém similaridade entre si, incluindo XAC2609 cujo gene encontra-se no loeus vir, 2) XAC2609 e XAC2610; 3) Interações homotrópicas da VirB11; 4) XAC2622 e VirB9. A análise do sistema de "Quorum-Sensing" composto pelas proteínas Rpf mostrou interações envolvendo componentes do próprio sistema: 1) RpfC e RpfF; 2) RpfC e RpfG; 3) interações homotrópicas da RpfF; 4) RpfC e CmfA, uma proteína similar a Cmf de Dietyostelium diseoideum que, neste organismo, é fundamental para processos de "quorum-sensing". As interações proteína-proteína encontradas permitiram-nos entender melhor acomposição, organização e regulação dos fatores envolvidos na patogenicidade de Xac
- Imprenta:
- Data da defesa: 24.09.2004
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ABNT
ALEGRIA, Marcos Castanheira. Identificação de interações proteína-proteína envolvendo os produtos dos loci hrp, vir e rpf do fitopatógeno Xanthomonas axonopodis pv. citri. 2004. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2004. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-22082016-162740/. Acesso em: 21 out. 2024. -
APA
Alegria, M. C. (2004). Identificação de interações proteína-proteína envolvendo os produtos dos loci hrp, vir e rpf do fitopatógeno Xanthomonas axonopodis pv. citri (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-22082016-162740/ -
NLM
Alegria MC. Identificação de interações proteína-proteína envolvendo os produtos dos loci hrp, vir e rpf do fitopatógeno Xanthomonas axonopodis pv. citri [Internet]. 2004 ;[citado 2024 out. 21 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-22082016-162740/ -
Vancouver
Alegria MC. Identificação de interações proteína-proteína envolvendo os produtos dos loci hrp, vir e rpf do fitopatógeno Xanthomonas axonopodis pv. citri [Internet]. 2004 ;[citado 2024 out. 21 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-22082016-162740/
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