Uso do método de reamostragem bootstrap para validação da ordem de marcadores em mapas genéticos (2004)
- Authors:
- Autor USP: GARCIA, ANTONIO AUGUSTO FRANCO - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Subjects: MAPEAMENTO GENÉTICO; INFERÊNCIA ESTATÍSTICA
- Language: Português
- Abstract: Avaliar o comportamento do método de reamostragem bootstrap para validação da ordem de marcadores em mapas genéticos. Material e métodos: Foi desenvolvido um software para ordenação de marcadores através dos métodos Seriation e Rapid Chain Delineation - RCD, complementados pelo algoritmo Ripple, e para realização das análises bootstrap. Utilizou-se um conjunto de dados reais, em que 103 camundongos, derivados de um retrocruzamento, foram genotipados para 14 marcadores codominantes, com ordem conhecida. As análises bootstrap consistiram na obtenção de 1000 amostras dos indivíduos originais, com reposição. Para cada amostra, os locos foram ordenados e um mapa construído. Resultados: Em todas as situações avaliadas, os resultados foram bastante semelhantes, sendo as ordens obtidas próximas àquela previamente conhecida. A Porcentagem de Ordem Correta, obtida pelo bootstrap, teve valor de cerca de 0.85, sendo as regiões de menor confiabilidade aquelas em que os marcadores estavam mais próximos. Isto indica que a ordem original apresenta confiabilidade alta, o que aumenta a segurança de estudos como o mapeamento de QTLs. O algoritmo RCD apresentou maior influência de aleatoriedade, sendo recomendada maior cautela em seu uso. Conclusões: Os algoritmos de ordenação apresentaram comportamentos semelhantes e o Ripple mostrou que pode melhorar a estimativa da ordem. O método bootstrap pode ser usado em situações reais para validação da ordem dos marcadores
- Imprenta:
- Source:
- Título: Agropecuária; resumos
- Conference titles: Simpósio Internacional de Iniciação Cientifica da Universidade de São Paulo
-
ABNT
MARGARIDO, G. R. A. et al. Uso do método de reamostragem bootstrap para validação da ordem de marcadores em mapas genéticos. 2004, Anais.. São Paulo: USP, 2004. . Acesso em: 03 dez. 2025. -
APA
Margarido, G. R. A., Mollinari, M., Pastina, M. M., & Garcia, A. A. F. (2004). Uso do método de reamostragem bootstrap para validação da ordem de marcadores em mapas genéticos. In Agropecuária; resumos. São Paulo: USP. -
NLM
Margarido GRA, Mollinari M, Pastina MM, Garcia AAF. Uso do método de reamostragem bootstrap para validação da ordem de marcadores em mapas genéticos. Agropecuária; resumos. 2004 ;[citado 2025 dez. 03 ] -
Vancouver
Margarido GRA, Mollinari M, Pastina MM, Garcia AAF. Uso do método de reamostragem bootstrap para validação da ordem de marcadores em mapas genéticos. Agropecuária; resumos. 2004 ;[citado 2025 dez. 03 ] - Obtenção dos estimadores de máxima verossimilhança das distâncias entre locos com distorção nas segregações em cana-de-açúcar
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