Obtenção da fração de recombinação e da fase de ligação entre locos de marcadores moleculares em cana-de-açúcar, usando o programa Joinmap (2004)
- Authors:
- USP affiliated authors: FIGUEIRA, ANTONIO VARGAS DE OLIVEIRA - CENA ; GARCIA, ANTONIO AUGUSTO FRANCO - ESALQ
- Schools: CENA; ESALQ
- Subjects: MARCADOR MOLECULAR; CANA-DE-AÇÚCAR
- Language: Português
- Abstract: A cana-de-açúcar, por ser uma espécie poliplóide, apresenta grande complexidade genômica. Uma das dificuldades adicionais para o mapeamento genético dessa espécie, é o fato de as fases de ligação entre os marcadores serem inicialmente desconhecidas. Entretanto, existem diversas metodologias estatísticas que permitem a estimativa dessas fases de ligação (associação ou repulsão). Nesse contexto, o presente trabalho teve por objetivo, primeiramente, identificar os grupos de ligação e a fase de ligação entre marcadores RFLP, SSR e AFLP localizados num mesmo cromossomo, e posteriormente, construir o mapa genético para a população em estudo, através do programa JoinMap. Os dados utilizados são referentes a uma progênie F1 proveniente do cruzamento entre duas variedades comerciais de cana-de-açúcar (SP 80-180 x SP 80-4966). Definiu-se frequência de recombinação 0,5 e LOD 5, como sendo os melhores critérios para a formação dos grupos de ligação, em virtude do elevado número de marcas (1118). As distâncias de mapeamento, expressas em centiMorgans (cM), foram calculadas com base na frequência de recombinação por meio da função de Kosambi. Ao final da etapa de mapeamento, foi obtido um mapa genético com 98 cromossomos, que apresentou comprimento total de 1331,09 cM, comprimento médio de 13,6 cM , número médio de 2,21 marcas por grupo num total de 217 marcas agrupadas e uma distância média entre locos de 6,13 cM
- Imprenta:
- Source:
- Título do periódico: Agropecuária; resumos
- Conference title: Simpósio Internacional de Iniciação Cientifica da Universidade de São Paulo
-
ABNT
PASTINA, M. M. et al. Obtenção da fração de recombinação e da fase de ligação entre locos de marcadores moleculares em cana-de-açúcar, usando o programa Joinmap. 2004, Anais.. São Paulo: USP, 2004. . Acesso em: 04 jul. 2022. -
APA
Pastina, M. M., Meza, A. N., Kido, E. A., Souza, A. P. de, Figueira, A. V. de O., Ulian, E. C., & Garcia, A. A. F. (2004). Obtenção da fração de recombinação e da fase de ligação entre locos de marcadores moleculares em cana-de-açúcar, usando o programa Joinmap. In Agropecuária; resumos. São Paulo: USP. -
NLM
Pastina MM, Meza AN, Kido EA, Souza AP de, Figueira AV de O, Ulian EC, Garcia AAF. Obtenção da fração de recombinação e da fase de ligação entre locos de marcadores moleculares em cana-de-açúcar, usando o programa Joinmap. Agropecuária; resumos. 2004 ;[citado 2022 jul. 04 ] -
Vancouver
Pastina MM, Meza AN, Kido EA, Souza AP de, Figueira AV de O, Ulian EC, Garcia AAF. Obtenção da fração de recombinação e da fase de ligação entre locos de marcadores moleculares em cana-de-açúcar, usando o programa Joinmap. Agropecuária; resumos. 2004 ;[citado 2022 jul. 04 ] - Functional integrated genetic linkage map based on EST-markers for a sugarcane (Saccharum spp.) commercial cross
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