Análise da variabilidade nucleotídica de complexos do vírus da tristeza dos citros (2004)
- Authors:
- Autor USP: CAMARGO, LUIS EDUARDO ARANHA - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Subjects: VÍRUS DE PLANTAS; CITRICULTURA
- Language: Português
- Abstract: Quantificar o grau de polimorfismo, em nível de sequência nucleotídica, dentro de complexos de vírus da tristeza dos citros isolados de plantas irmãs com e sem sintomas de morte súbita. Material e/ou métodos: Complexos virais foram isolados de plantas sadias e doentes de laranja pêra enxertadas em limão cravo. Oligonucleotídeos homólogos a região que codifica a proteína p479 do vírus foram utilizados para amplificar um fragmento de 455 pb pela técnica da transcriptase-reversa - PCR. O cDNA foi clonado em plasmídio e transformado em E.coli. Insertos foram sequenciados e analisados pelos programas Phred/Phrap/Consed BLAST. Sequências de uma mesma planta foram comparadas, considerando-se as bases com qualidade Phrap>20. Em seguida, sequências entre complexos foram comparadas para distingui-los baseando-se em polimorfismos de sequência. Resultados: Foram sequenciados 192 insertos de duas plantas doentes (96 de cada) e 96 de uma planta sadia. A qualidade das sequências foi considerada satisfatória, uma vez que 70% das mesmas apresentaram ao menos 100 bases com qualidade superior a 20. Análise de identidade das sequências, confirmou se tratar da região genômica do vírus da tristeza. Análises intra e inter complexos revelaram inúmeros polimorfismos. Conclusões: Polimorfismos de sequência nucleotídica são frequentes na região genômica analisada.Devido a sua abundância, podem ser utilizados como marcadores para diferenciar complexos de plantas distintas
- Imprenta:
- Source:
- Título do periódico: Agropecuária; resumos
- Conference titles: Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo
-
ABNT
OTTONI, J. R. et al. Análise da variabilidade nucleotídica de complexos do vírus da tristeza dos citros. 2004, Anais.. São Paulo: USP, 2004. . Acesso em: 18 set. 2024. -
APA
Ottoni, J. R., Malvas, C. C., Rosa, D. D., Cintra, V., & Camargo, L. E. A. (2004). Análise da variabilidade nucleotídica de complexos do vírus da tristeza dos citros. In Agropecuária; resumos. São Paulo: USP. -
NLM
Ottoni JR, Malvas CC, Rosa DD, Cintra V, Camargo LEA. Análise da variabilidade nucleotídica de complexos do vírus da tristeza dos citros. Agropecuária; resumos. 2004 ;[citado 2024 set. 18 ] -
Vancouver
Ottoni JR, Malvas CC, Rosa DD, Cintra V, Camargo LEA. Análise da variabilidade nucleotídica de complexos do vírus da tristeza dos citros. Agropecuária; resumos. 2004 ;[citado 2024 set. 18 ] - Estimativas de danos em milho ocasinados pela antracnose de colmo
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