Dinâmica conformacional de peptídeos: um estudo por fluorescência (2004)
- Authors:
- Autor USP: SOUZA, EDUARDO SÉRGIO DE - IF
- Unidade: IF
- Sigla do Departamento: FGE
- Subjects: BIOFÍSICA; ESPECTROSCOPIA MOLECULAR; PEPTÍDEOS; POLISSACARÍDEOS; ENERGIA (TRANSFERÊNCIA); LUMINESCÊNCIA
- Language: Português
- Abstract: Realizamos estudos, por espectroscopia de fluorescência de estado estacionário e resolvida no tempo, de dinâmica conformacional de três famílias de peptídeos: o terminal carboxílico do peptídeo neuroendócrino (7B2CT); o peptídeo estimulador do melanócito ('alfa'-MSH); e os peptídeos derivados da sequência consensual de peptídeos que se ligam a heparina (peptídeo Cardin). Utilizamos os métodos de fluorescência baseados na supressão da emissão do fluoróforo presente no peptídeo, tanto por interação colisional com um supressor como por transferência de energia para um grupo aceitador presente no peptídeo. No segundo caso, dentro da hipótese de que diferentes conformações do peptídeo estão presentes durante o decaimento da fluorescência, supusemos que o decaimento da intensidade era modulado por uma função de distribuição de distâncias doador-aceitador, f(r). Foi desenvolvido um procedimento computacional usando o programa CONTIN, para recuperar, a partir dos dados de fluorescência resolvida no tempo, a distribuição de distância entre o doador e o aceitador presente nos peptídeos. A metodologia se mostrou útil para obter informações quantitativas sobre a dinâmica conformacional dos peptídeos, sua dependência com o solvente e sua interação com outras moléculas presentes no meio. O peptídeo 7B2CT e seus análogos A12 e A18 foram estudados pela fluorescência da tirosina, presente na posição cinco na sequência de aminoácidos. Não houve diferenças significativas nodecaimento da intensidade, no decaimento da anisotropia e na supressão por iodeto entre os três peptídeos, que pudessem ser correlacionados com as diferenças observadas na inibição da pro-hormone convertase 2 (PC2). O peptídeo 'alfa'-MSH e seu análogo mais potente [Nle(4), D-Phe(7)] 'alfa'-MSH (NDP-alfa'-MSH), que contém o resíduo fluorescente triptofano, foram modificados no seu terminal amino com o grupo ácido amino benzóico (Abz), e foram estudados por ) métodos de fluorescência. Observamos transferência de energia entre o resíduo triptofano, atuando como doador, e o aceitador o-Abz. Verificamos a uma ampla distribuição de distâncias Trp-o-Abz para o 'alfa'-MSH em água, enquanto três populações de distâncias foram observadas para o análogo modificado NDP-'alfa'-MSH em água, indicando estados com conformações distintas para o peptídeo sintético, comparado com o hormônio nativo. Medidas em trifluoroetanol resultaram em duas populações de distâncias, tanto para o hormônio nativo como para o hormônio análogo, refletindo a diminuição, induzida pelo solvente, das conformações disponíveis para os peptídeos. Os peptídeos Cardin foram estudados na presença de heprarina, de micelas de SDS e na mistura TFE/água. O grupo fluorescente Abz foi incorporado no terminal amino e o grupo aceitador etilenodiamina-N-[2,4-dinitrtofenil] (Eddnp) foi incorporado ao terminal carboxílico dos peptídeos. A distribuição de distâncias entre as extremidades, recuperadas dos dados defluorescência resolvida no tempo, indicaram a presença de conformações estendidas em solução aquosa e a ocorrência de conformações compactadas na interação com heparina e SDS ou em soluções com TFE. As distâncias entre as extremidades recuperadas foram maiores que aquelas esperadas para os peptídeos na conformação hélica alfa, sugerindo a ocorrência de estruturas dobradas além da hélice alfa. A metodologia da transferência de energia se mostrou útil para os estudos de dinâmica de peptídeos em solução
- Imprenta:
- Data da defesa: 05.11.2004
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ABNT
SOUZA, Eduardo Sérgio de. Dinâmica conformacional de peptídeos: um estudo por fluorescência. 2004. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2004. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/43/43134/tde-31082012-131116/. Acesso em: 03 mar. 2026. -
APA
Souza, E. S. de. (2004). Dinâmica conformacional de peptídeos: um estudo por fluorescência (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/43/43134/tde-31082012-131116/ -
NLM
Souza ES de. Dinâmica conformacional de peptídeos: um estudo por fluorescência [Internet]. 2004 ;[citado 2026 mar. 03 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/43/43134/tde-31082012-131116/ -
Vancouver
Souza ES de. Dinâmica conformacional de peptídeos: um estudo por fluorescência [Internet]. 2004 ;[citado 2026 mar. 03 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/43/43134/tde-31082012-131116/
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