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Estudo evolutivo de espécies e híbridos de cana-de-açúcar por análise comparativa com outras espécies da família Poaceae (Arroz, milho, sorgo e trigo) utilizando regiões do genoma cloroplastidial (2004)

  • Authors:
  • Autor USP: MELOTTO-PASSARIN, DANILA MONTEWKA - ESALQ
  • Unidade: ESALQ
  • Sigla do Departamento: LCB
  • Subjects: CANA-DE-AÇÚCAR; CLOROPLASTOS VEGETAIS; EVOLUÇÃO VEGETAL; FILOGENIA; MELHORAMENTO GENÉTICO VEGETAL; POLIMORFISMO; NUCLEOTÍDEOS (SEQUÊNCIA)
  • Language: Português
  • Abstract: Nos últimos anos, o sequenciamento de nucleotideos do genoma cloroplastidial esta sendo utilizado como uma eficienteferramenta para estudar a evolução em plantas superiores. O complexo sequenciamento do genoma cloroplastidial (plastoma) de cana-de-açúcar (Saccharum officinarum) revelou uma moelcula circular fechada de 141.182 pb.. Este plastoma contém um par de regiões invertidas repetidas (IRa e IRb), separadas por uma região de cópia unica pequena (SSC) e uma regiao de copia unica grande (LSC). Os genes do cloroplasto tem sido muito utilizados para reconstruir a filogenia em especies relacionadas. Para contribuir com a qualidade de informação disponivel para a reconstrução filogenetica, multiplas regioes do cloroplasto tem sido analisadas, incluindo genes e espacadores intergenicos. O DNA cloroplastidial (ptDNA) tem a caracteristica de ser muito conservado entre as especies de plantas, o que o torna apropriado para os estudos filogeneticos em varios niveis taxonomicos. Alem disso, a herança uniparental apresenta reduzido impacto da recombinação intermolecular e auxilia na simplificação das teorias de evolução do ptDNA em muitos taxons vegetais. O objetivo deste trabalho foi contribuir com os estudos de evolução do cloroplasto em va'rias especies e hibridos de cana-de-açúcra pela identificação de regiåioes polimorficas e sinais filigeneticos ou "hotspots" que possam ser utilizados como marcadores filogeneticos. Para isso, outras espécies pertencentes a familiaPoaceae, principalmente sorgo, milho, arroa e trigo também foram utilizadas nas análises. As regiões selcionadas para este estudo foram: região intergênica entre rbcL e petA; região intergênica entre trnI e trnL; região 16SrDNA e um segmento das quatro intersecções do ptDNA que unem as duas regiões invertidas repetidas com a LSC e SSC. Estas sequências foram amplificadas por PCR, seuqenciadas e alinhadas utilizando os programas computacionais (continua) )ClustalW e Phred-Phrap-Consed. As análises de parcimônia foram realizadas pelo programa PAUP versão 4.0 e as árvores filogeneticas foram desenhadas pelo programa TreeView. As comparações dos "hotspots" do pyDNA forneceram informações quanto a evolução do cloroplasto e sobre os mecanismos responsaveis pela divergencia entre os plastomas destas especies estudadas. Também foi observada maior identidade entre os plastomas de cana-de-açúcar, sorgo e milho, que são plantas C4, do que entre os plastomas de cana-de-açúcar e de gramineas C3, como arroz e trigo, incluindo a organização estrutural dos genes
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 05.08.2004
  • Acesso à fonte
    How to cite
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    • ABNT

      MELOTTO-PASSARIN, Danila Montewka; CARRER, Helaine. Estudo evolutivo de espécies e híbridos de cana-de-açúcar por análise comparativa com outras espécies da família Poaceae (Arroz, milho, sorgo e trigo) utilizando regiões do genoma cloroplastidial. 2004.Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2004. Disponível em: < https://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11144/tde-20191108-122615/ >.
    • APA

      Melotto-Passarin, D. M., & Carrer, H. (2004). Estudo evolutivo de espécies e híbridos de cana-de-açúcar por análise comparativa com outras espécies da família Poaceae (Arroz, milho, sorgo e trigo) utilizando regiões do genoma cloroplastidial. Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11144/tde-20191108-122615/
    • NLM

      Melotto-Passarin DM, Carrer H. Estudo evolutivo de espécies e híbridos de cana-de-açúcar por análise comparativa com outras espécies da família Poaceae (Arroz, milho, sorgo e trigo) utilizando regiões do genoma cloroplastidial [Internet]. 2004 ;Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11144/tde-20191108-122615/
    • Vancouver

      Melotto-Passarin DM, Carrer H. Estudo evolutivo de espécies e híbridos de cana-de-açúcar por análise comparativa com outras espécies da família Poaceae (Arroz, milho, sorgo e trigo) utilizando regiões do genoma cloroplastidial [Internet]. 2004 ;Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11144/tde-20191108-122615/


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