Caracterização molecular de isolados brasileiros do vírus linfotrópico de células T humanas do tipo 1 (HTLV - 1) (2004)
- Authors:
- Autor USP: HADDAD, SIMONE KASHIMA - FMRP
- Unidade: FMRP
- Sigla do Departamento: RCM
- Subjects: GENÉTICA MOLECULAR; VIROLOGIA; HEMATOLOGIA
- Language: Português
- Abstract: O vírus Linfotrópico de Células T Humanas (HTLV) é um retrovírus que apresenta tropismo por células T humanas e é classificado em dois tipos principais: o HTLV do tipo 1 e o HTLV do tipo 2. Este vírus é relacionado como o agente etiológico da leucemia da células T do adulto (ATL) e da mielopatia associada ao HTLV-1/paraparesia espástica tropical (HAM/TSP). O genoma deste retrovírus é composto por aproximadamente 8.500 pares de bases contendo genes estruturais e regulatórios. Estudos filogenéticos das regiões LTR e env do HTLV-1 classificam-no em seis subtipos principais: Ia (Cosmopolita). Ib (África Central). Ic (Melanésia). Id (Camarões). Ie e If (Congo e Gabão, respectivamente). O subtipo Cosmopolita é subdividido ainda em 5 grupos principais: Transcontinental. Japonês, Oeste- Africano, Norte Africano e Negros do Peru. O objetivo do presente trabalho foi estudar as características genéticas e moleculares dos espécimes do HTLV-1 provenientes de várias regiões do Brasil, estabelecendo assim a epidemiologia molecular do vírus HTLV-1 por meio de métodos moleculares de subtipagem viral e análise filogenética; e determinar a seqüência completa de bases nucleotídicas do genoma de isolados brasileiros de HTLV-1, avaliando as características moleculares que possam influenciar na patogênese desta infecção. Foram analisadas amostras de DNA obtidas de 138 pacientes soropositivos, incluindo 55 indivíduos as sintomáticos, 28 pacientes com ATL e 33 pacientes com HAM/TSP.Estas amostras foram colhidas de regiões brasileiras geográficas distintas, sendo 26,2% proveniente do estado do Rio de janeiro, 50,8 % de São Paulo e 14,8% da região Sul, Nordeste e Centro-Oeste do país. Por meio da técnica de PCR, as amostras foram amplificadas para as regiões gênicas virais do LTR, pol, tax e env, para confirmar a infecção. A análise filogenética de 410 pares de bases da região do LTR demonstrou que 98,3% dos isolados foram ... classificados como subtipo Cosmopolita com a seguinte distribuição no subgrupo Transcontinental: 81,6% junto ao cluster da América Latina, 15,8% fora do cluster da América Latina e 2,6% no subgrupo Japonês, este último com o suporte estatístico significante por Maximum Likelihood (p>0,05). Ainda pôde ser observado neste grupo um único isolado (BRRP438) proveniente da África do Sul (0,08%). Para a região tax, importante por ser uma região imunodominante e regulatória foi realizado estudo molecular e filogenético. Foram analisadas aproximadamente 1.000 pb, resultando em 99% de similaridade em relação ao protótipo ATK-1 e outras 28 seqüências-referências. A composição nucleotídica difere em uma a oito substituições. Ainda, a análise do padrão de substituição demonstrou que nas posições 7401 (C->T), 7914 (T->C), 7920 (C->T), 7982 (C->T) e 8231 (G->A), estas se encontraram altamente conservadas entre os isolados brasileiros (79,6% das amostras) e parecem não estar associadas a um estado clínico específicoe sim a uma característica geográfica, pois a análise filogenética pelo LTR demonstrou que 98,3% dos isolados de HTLV-1 são classificados como subtipo Cosmopolita (Ia). Neste trabalho demonstramos pela primeira vez o seqüenciamento completo do genoma de dois isolados brasileiros do HTLV-1 (BRRP438 e BRRP430). Eles não diferem em relação à estrutura geral com os outros genomas descritos. O genoma do isolado BRRP425 e BRRP438 constituem-se de 8383 e 8883 bp, respectivamente; e apresentaram uma alta similaridade com os protótipos existentes no banco de dados (~92 to 99%). O entendimento da composição genômica do vírus juntamente com fatores relacionados ao hospedeiro são aspectos fundamentais para o entendimento da variabilidade e patogênese desta infecção
- Imprenta:
- Publisher place: Ribeirão Preto
- Date published: 2004
- Data da defesa: 05.03.2004
-
ABNT
HADDAD, Simone Kashima. Caracterização molecular de isolados brasileiros do vírus linfotrópico de células T humanas do tipo 1 (HTLV - 1). 2004. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2004. . Acesso em: 28 dez. 2025. -
APA
Haddad, S. K. (2004). Caracterização molecular de isolados brasileiros do vírus linfotrópico de células T humanas do tipo 1 (HTLV - 1) (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. -
NLM
Haddad SK. Caracterização molecular de isolados brasileiros do vírus linfotrópico de células T humanas do tipo 1 (HTLV - 1). 2004 ;[citado 2025 dez. 28 ] -
Vancouver
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