Tese

Potencial estéreo-hidrofóbico e propriedades topológicas no enovelamento de proteínas (2003)

• Authors:
  • Tarragó, Maria Eulália Pinto
  • Caliri, Antônio (Orientador)
• Autor USP: TARRAGO, MARIA EULALIA PINTO - FFCLRP
• Unidade: FFCLRP
• Sigla do Departamento: 591
• Subjects: FÍSICA; MÉTODO DE MONTE CARLO (APLICAÇÕES)
• Language: Português
• Abstract: O entendimento dos princípios básicos do enovelamento proteico pode conduzir a muitas aplicações importantes. Embora não se conheçam todos os aspectos significativos envolvidos neste problema, experimentos e aproximações teóricas têm produzido avanços relevantes na sua compreensão; como, por exemplo, o papel dominante das forças hidrofóbicas. Com o propósito de contribuir para a identificação de alguns parâmetros determinantes no processo de folding, o objetivo deste trabalho consiste em estudar o potencial estéreo-hidrofóbico (isto é, o potencial hidrofóbico e um conjunto de especificidades estéricas adequadas) relacionado ao processo de enovelamento de proteínas globulares, evidenciando o papel das restrições estéricas e as características topológicas do estado nativo. Para tanto, empregou-se um modelo simplificado em rede cúbica, estudando-se, através de simulações Monte Carlo, o comportamento de mais de 40 cadeias tipo-proteínas, que apresentam estados nativos caracterizados pelos seguintes parâmetros topológicos: ordem de contato,'qui', ordem de longo alcance, X(LR) e número 'fi' de estruturas tipo grande manivela. Claramente, os resultados das simulações para as cadeias com configurações nativas, caracterizadas por baixo valor de 'qui' e elevado valor de 'fi', são bastante diferenciados daqueles obtidos para as cadeias que apresentam configurações nativas com 'qui' elevado e 'fi' pequeno, evidenciando que o potencial estéreo-hidrofóbico,adotado neste trabalho, permite relacionar os comportamentos termodinâmico e cinético da cadeia tipo-proteína com os atributos topológicos da configuração nativa correspondente. Adicionalmente, mostrou-se que as restrições estéricas consideradas introduzem fortes mudanças na atividade configuracional, aumentando a estabilidade do estado nativo, bem como alterando, drasticamente, a curva da capacidade térmica, em função da temperatura, em comparação com os resultados das (continuação) simulações obtidos com o potencial hidrofóbico (sem restrições estéricas)
• Imprenta:
  • Publisher place: Ribeirão Preto
  • Date published: 2003
• Data da defesa: 26.02.2003


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How to cite

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• ABNT

  TARRAGÓ, Maria Eulália Pinto. Potencial estéreo-hidrofóbico e propriedades topológicas no enovelamento de proteínas. 2003. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2003. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/59/59135/tde-19092005-084427/. Acesso em: 24 abr. 2024.

• APA

  Tarragó, M. E. P. (2003). Potencial estéreo-hidrofóbico e propriedades topológicas no enovelamento de proteínas (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/59/59135/tde-19092005-084427/

• NLM

  Tarragó MEP. Potencial estéreo-hidrofóbico e propriedades topológicas no enovelamento de proteínas [Internet]. 2003 ;[citado 2024 abr. 24 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/59/59135/tde-19092005-084427/

• Vancouver

  Tarragó MEP. Potencial estéreo-hidrofóbico e propriedades topológicas no enovelamento de proteínas [Internet]. 2003 ;[citado 2024 abr. 24 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/59/59135/tde-19092005-084427/

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