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Implementação e aplicação de mudanças conformacionais de moléculas flexíveis em simulação Monte Carlo de moléculas em meio solvente (2002)

  • Authors:
  • Autor USP: MENDES NETO, IVAM PEREIRA - IF
  • Unidade: IF
  • Sigla do Departamento: FMT
  • Subjects: MÉTODO DE MONTE CARLO; FÍSICA DA MATÉRIA CONDENSADA
  • Language: Português
  • Abstract: Recentemente foi desenvolvido pelo nosso grupo de pesquisa um código computacional, chamado DICE, que realiza simulações computacionais de moléculas rígidas no ensembles NVT e NPT, utilizando o método de Monte Carlo com duas possibilidades para técnica de amostragem, a de Metropolis e a preferencial. Com esse programa é possível simular soluções com a proporção molar desejada e realizar cálculos de variação de energia livre através da Teoria de Perturbação Termodinâmica. Neste trabalho desenvolvemos algoritmos e implementamos subrotinas no programa DICE para realizar deformações moleculares em solutos flexíveis. Possibilitando assim o estudo de modificações conformacionais de moléculas em meio solvente. A partir daí, realizamos três aplicações importantes e complementares. Na primeira, estudamos o alongamento da distância C=O da molécula de acetona em meio aquoso e em 'CCl IND.4'. Esse alongamento, que decorrente da formação de ligação de hidrogênio em solventes práticos, tem conseqüências espectrais tanto na região do infravermelho quanto do UV-visível e foi descrito adequadamente em nossas simulações. Outra aplicação foi o estudo da forma estrutural do dicloroetano. É sabido que em fase gasosa, essa molécula tem uma conformação preferencial do tipo trans. Já em fase líquida, ela muda para uma conformação preferencial do tipo gauche. Nossos resultados estão em muito boa concordância com resultados experimentais e com simulações prévias. Por fim, estudamos oproblema estrutural da orto-betaina. Betaínas são sistemas de grande interesse em espectroscopia de moléculas orgânicas por apresentarem um solvatocromismo pronunciado. Assim, recentemente, esses sistemas têm servido como indicadores de polaridade de solventes. Estudamos a torção entre os anéis, doador e aceitador de cargas, usando diferentes modelos para a redistribuição de cargas ao longo da torção
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 18.12.2002

  • How to cite
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    • ABNT

      MENDES NETO, Ivam Pereira; CANUTO, Sylvio. Implementação e aplicação de mudanças conformacionais de moléculas flexíveis em simulação Monte Carlo de moléculas em meio solvente. 2002.Universidade de São Paulo, São Paulo, 2002.
    • APA

      Mendes Neto, I. P., & Canuto, S. (2002). Implementação e aplicação de mudanças conformacionais de moléculas flexíveis em simulação Monte Carlo de moléculas em meio solvente. Universidade de São Paulo, São Paulo.
    • NLM

      Mendes Neto IP, Canuto S. Implementação e aplicação de mudanças conformacionais de moléculas flexíveis em simulação Monte Carlo de moléculas em meio solvente. 2002 ;
    • Vancouver

      Mendes Neto IP, Canuto S. Implementação e aplicação de mudanças conformacionais de moléculas flexíveis em simulação Monte Carlo de moléculas em meio solvente. 2002 ;

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