Análise molecular de chalcona sintase em cana-de-açúcar (2002)
- Authors:
- Autor USP: CONTESSOTTO, MIRIAM GISELE GASPAROTTO - CENA
- Unidade: CENA
- Assunto: DNA
- Language: Português
- Abstract: Seqüências do banco de dados SUCEST foram analisadas quanto a sua identidade com genes que codificam a enzima chalcone sintase (CHS). A seqüência da proteína CHS de sorgo (gi|12229613|), foi usada para a buscar seqüências no banco de dados do SUCEST. Considerando a identidade das seqüências ao nível de aminoácidos, 14 clusters formados por 121 seqüências ESTs, foram divididos em 2 grupos. O primeiro grupo, o CHS1, tem 97% de identidade a CHS de sorgo (gi|5305906|) (EC 2.3.1.74), e apresenta a seqüência consenso de aminoácidos característica do sítio ativo da família chalcona e stilbene sintase. Análises da expressão gênica, baseada no número de seqüências ESTs de uma dada biblioteca presente em cada grupo, indicaram que neste caso, a maioria das seqüências são de bibliotecas preparadas de raiz e flores de cana-de-açúcar. O segundo grupo, o CHS2, tem 93% de identidade a uma CHS encontrada em folhas de plântulas de Sorghum bicolor infectadas por patógeno (gi|17978543|), e 90% de identidade à seqüência de aminoácidos deduzida de uma proteína (PI1, gi|9855801|) do banco de dados de EST de Sorghum bicolor. Estas seqüências de proteínas possuem 2 mudanças de aminoácidos no consenso padrão de chalcone e stilbene sintase, e conservam o resíduo de cisteína na posição do sítio ativo. A maioria das seqüências ESTs do segundo grupo é de bibliotecas de cana-de-açúcar preparadas de raiz e plântulas infectadas com Herbaspirillum rubrisubalbicans e Acetobacter diazotroficans.Novos experimentos confirmaram a presença de CHS2 em cana-de-açúcar, sugerindo agora que a cana-de-açúcar apresenta 2 grupos genes de chalcona sintase com padrão de expressão diferencial
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2002
- Data da defesa: 28.11.2002
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ABNT
CONTESSOTTO, Miriam Gisele Gasparotto. Análise molecular de chalcona sintase em cana-de-açúcar. 2002. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2002. . Acesso em: 19 abr. 2024. -
APA
Contessotto, M. G. G. (2002). Análise molecular de chalcona sintase em cana-de-açúcar (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. -
NLM
Contessotto MGG. Análise molecular de chalcona sintase em cana-de-açúcar. 2002 ;[citado 2024 abr. 19 ] -
Vancouver
Contessotto MGG. Análise molecular de chalcona sintase em cana-de-açúcar. 2002 ;[citado 2024 abr. 19 ]
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