Dissecting the sugarcane expressed sequence tag (SUCEST) database: unraveling flower-specific genes (2001)
- Authors:
- USP affiliated authors: GOLDMAN, GUSTAVO HENRIQUE - FCFRP ; GOLDMAN, MARIA HELENA DE SOUZA - FFCLRP
- Unidades: FCFRP; FFCLRP
- DOI: 10.1590/s1415-47572001000100012
- Assunto: CANA-DE-AÇÚCAR (GENÉTICA)
- Language: Inglês
- Abstract: Existem quase 260.000 clones independentes, seqüenciados a partir da extremidade 5, no banco de dados do SUCEST (Sugarcane Expressed Sequence Tag), os quais foram obtidos a partir de 37 bibliotecas de cDNA preparadas de diferentes tecidos. Este grande número de etiquetas de sequências expressas (ESTs) fornece uma oportunidade, sem precedentes em plantas, de realizar um digital differential screening em bibliotecas de cDNA selecionadas. Geralmente, a frequência de um determinado EST está correlacionada ao acúmulo de transcritos nos tecidos dos quais as bibliotecas de cDNA foram construídas, e desta forma, é possível comparar o transcriptoma completo de diferentes tecidos, usando uma análise computacional de um banco de dados de ESTs. Em nossa pesquisa, analisamos os ESTs de cana-de-açúcar de acordo com sua expressão tecidual e identificamos mais de 1.000 putativos genes específicos de flor. O fato de que usando esta técnica fomos capazes de identificar homológos em cana-de-açúcar, de vários genes previamente descritos como específicos de pólen, sustenta este método de estimar especificidade tecidual. Além disto, ESTs com similaridade a genes específicos de órgãos reprodutivos foram revelados, como por exemplo, o gene que codifica uma proteína meiótica essencial para a montagem do complexo sinaptonêmico e sinapse normal. Esta abordagem também permitiu a identificação de muitas sequências anônimas, específicas de flor, que são boas candidatas para novosgenes envolvidos com a reprodução de plantas. Este trabalho descreve a análise dos níveis de expressão gênica de 24 clusters de ESTs, durante o desenvolvimento floral, usando um northern blot digital construído a partir da contagem direta dos ESTs das bibliotecas não-normalizadas de cDNAs de cana-de-açúcar
- Imprenta:
- Publisher place: Ribeirão Preto
- Date published: 2001
- Source:
- Título: Genetics and Molecular Biology
- ISSN: 1415-4757
- Volume/Número/Paginação/Ano: v. 24, n. 1-4, p. 77-84, 2001
- Este periódico é de acesso aberto
- Este artigo é de acesso aberto
- URL de acesso aberto
- Cor do Acesso Aberto: gold
- Licença: cc-by
-
ABNT
FIGUEIREDO, R. C. et al. Dissecting the sugarcane expressed sequence tag (SUCEST) database: unraveling flower-specific genes. Genetics and Molecular Biology, v. 24, n. 1-4, p. 77-84, 2001Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1590/s1415-47572001000100012. Acesso em: 07 out. 2024. -
APA
Figueiredo, R. C., Brito, M. S., Figueiredo, L. H. M., Quiapin, A. C., Vitorelli, P. M., Silva, L. R., et al. (2001). Dissecting the sugarcane expressed sequence tag (SUCEST) database: unraveling flower-specific genes. Genetics and Molecular Biology, 24( 1-4), 77-84. doi:10.1590/s1415-47572001000100012 -
NLM
Figueiredo RC, Brito MS, Figueiredo LHM, Quiapin AC, Vitorelli PM, Silva LR, Santos RV, Molfetta JB, Goldman GH, Goldman MH de S. Dissecting the sugarcane expressed sequence tag (SUCEST) database: unraveling flower-specific genes [Internet]. Genetics and Molecular Biology. 2001 ; 24( 1-4): 77-84.[citado 2024 out. 07 ] Available from: https://doi.org/10.1590/s1415-47572001000100012 -
Vancouver
Figueiredo RC, Brito MS, Figueiredo LHM, Quiapin AC, Vitorelli PM, Silva LR, Santos RV, Molfetta JB, Goldman GH, Goldman MH de S. Dissecting the sugarcane expressed sequence tag (SUCEST) database: unraveling flower-specific genes [Internet]. Genetics and Molecular Biology. 2001 ; 24( 1-4): 77-84.[citado 2024 out. 07 ] Available from: https://doi.org/10.1590/s1415-47572001000100012 - The 'rca' A gene from 'Aspergillus nidulans' is related to the human nibrin gene and is required for camptothecin resistance
- A novel ATP-binding cassete transporter involved in multidrug resistance in the filamentous fungus Aspergillus nidulans
- A novel gene preferentially expressed in pistils of 'Nicotiana tabacum' is identified
- Developmental expression of pistil genes in self-compatible and self-incompatible nicotiana plants
- A novel Aspergillus nidulans serine/threonine protein kinase gene that is transcriptionally regulated by camptothecin
- Studying the promoter of an ABC transporter gene expressed in the tobacco reproductive organs
- Molecular analysis of a white-like ABC transporter gene expressed in tobacco pistils
- Análise de ESTs de estigmas/estiletes de nicotiana tabacum L
- Dissecting the sugarcane EST database: unraveling flower-specific genes
- A tobacco cDNA reveals two different transcription patterns in vegetative and reproductive organs
Informações sobre o DOI: 10.1590/s1415-47572001000100012 (Fonte: oaDOI API)
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