Bioinformática e anotação de genes em Xanthomonas axonopodis pv. citri e Xylella fastidiosa: metabolismo de ferro e biossíntese de pequenas moléculas (2002)
- Authors:
- Autor USP: FORMIGHIERI, EDUARDO FERNANDES - CENA
- Unidade: CENA
- Subjects: BIOLOGIA MOLECULAR; GENÉTICA BACTERIANA
- Language: Português
- Abstract: Nos últimos anos, o seqüenciamento de diversos organismos tem gerado uma grande quantidade de dados biológicos. Para possibilitar o armazenamento, gerenciamento e disponibilização destes dados de forma a potencializar ao máximo sua utilização, a bioinformática se desenvolveu conjuntamente, e numa velocidade também impressionante. O resultado desta parceria entre a biologia molecular e a informática pode ser visto na quantidade crescente de genomas completos sendo seqüenciados, e também no sucesso do Programa de Seqüenciarnento de Genomas (ONSA-FAPESP), que levou o Brasil ao pequeno grupo de países com esta capacidade científica. O desenvolvimento e adaptação de ferramentas computacionais e a formação de recursos humanos têm apresentado crescimento constante no Brasil e no mundo. Este estudo envolve o desenvolvimento de bioinformática através da adaptação desta ao Laboratório de Biologia Celular e Molecular do CENA/USP, de anotação de genes nas bactérias Xylela fastidiosa (XCVC), Xanthornonas axonopodis pv. citri (Xcitri), Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcamp) e Xylella fastidiosa / Pierce's Disease (XPD) e de estudo de genes relacionados ao metabolismo do ferro, que inclui estudo filogenético do gene fur e de alguns dependentes do sistema TonB. O gene fur mostrou-se suficientemente conservado para ser útil na comparação de grupos próximo de bactérias. No caso dos receptores, uma maior divergência foi encontrada, indicando uma grande variaçãoentre receptores da mesma classe, e algumas possíveis falhas no processo de anotação ou novas classes de receptores fecA em Xanthomonas. A anotação em Xcitri envolveu parte da categoria Processos Celulares, e parte da categoria Patogenicidade, Virulência e Adaptação. A anotação em XPD incluiu a categoria Biossíntese de Pequenas Moléculas, sendo feita uma comparação entre as quatro bactérias citadas Entre XCVC e XPD não existem diferenças significativas nesta classe de genes, o mesmo ocorrendo entre Xcitri e Xcamp. O mesmo foi refletido na totalidade dos genomas. Na classe estudada, as espécies de Xanthomonas apresentaram alguns genes a mais que os isolados de Xylella
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2002
- Data da defesa: 24.05.2002
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ABNT
FORMIGHIERI, Eduardo Fernandes. Bioinformática e anotação de genes em Xanthomonas axonopodis pv. citri e Xylella fastidiosa: metabolismo de ferro e biossíntese de pequenas moléculas. 2002. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2002. . Acesso em: 11 out. 2024. -
APA
Formighieri, E. F. (2002). Bioinformática e anotação de genes em Xanthomonas axonopodis pv. citri e Xylella fastidiosa: metabolismo de ferro e biossíntese de pequenas moléculas (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. -
NLM
Formighieri EF. Bioinformática e anotação de genes em Xanthomonas axonopodis pv. citri e Xylella fastidiosa: metabolismo de ferro e biossíntese de pequenas moléculas. 2002 ;[citado 2024 out. 11 ] -
Vancouver
Formighieri EF. Bioinformática e anotação de genes em Xanthomonas axonopodis pv. citri e Xylella fastidiosa: metabolismo de ferro e biossíntese de pequenas moléculas. 2002 ;[citado 2024 out. 11 ]
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