Estudos estruturais da enzima fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PEPCK) de Trypanosoma cruzi, um potencial alvo para o planejamento de dorgas antichagásicas (2001)
- Authors:
- Autor USP: TRAPANI, STEFANO - IQSC
- Unidade: IQSC
- Subjects: PROTEÍNAS; BIOFÍSICA
- Language: Português
- Abstract: A fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PEPCK) (ATP-dependente) [ATP: oxaloacetatocarboxiliase (transfosforilante), EC 4.1.1.49] é uma enzima chave envolvida no catabolismo da glicose e dos aminoácidos do parasita Trypanosoma cruzi, o agente causador da doença de Chagas. Devido às diferenças significativas observadas na seqüência de aminoácidos e na especificidade da enzima homóloga humana (PEPCK (GTP-dependente), EC 4.1.1.32), a enzima do parasita tem sido considerada um bom alvo para o desenvolvimento de novos fármacos antichagásicos. Nós resolvemos a estrutura cristalográfica da PEPCK recombinante de T. cruzi a 2,0'ANGSTRON' de resolução, caracterizamos a organização dimérica da enzima mediante espalhamento de raios X a baixo ângulo (SAXS) em solução, e comparamos a estrutura da enzima com a estrutura conhecida da PEPCK monomérica de Escherichia coli. A estrutura dimérica possui simetria binária, e cada monômero apresenta um elevado grau de similaridade estrutural com a estrutura monomérica da PEPCK de E. coli. Cada monômero encontra-se enovelado em dois domínios complexos de tipo misto 'alfa'/'beta', com o sítio ativo localizado numa fenda profunda entre os dois domínios. Os dois sítios ativos no dímero encontram-se distantes um do outro, numa disposição que parece permitir o acesso independente dos substratos aos dois sítios ativos. Todos os resíduos da PEPCK de E. coli, para os quais havia-se observado a interação com substratos e co-fatoresmetálicos, encontram-se conservados e numa disposição espacial substancialmente equivalente na estrutura da PEPCK de T. cruzi. Nenhum substrato ou co-fator está presente na estrutura cristalográfica por nós determinada. Contudo, um íon sulfato, procedente do meio de cristalização, foi encontrado ligado ao sítio ativo da enzima. Dados SAXS em solução sugerem que, em soluções com concentração de sulfato menor que a usada nos experimentos de cristalização, a conformação ) da enzima possa ser levemente diferente da conformação observada na estrutura cristalográfica. Isto poderia ser devido a uma mudança conformacional induzida quando da ligação do sulfato, análoga à transição induzida pela ligação do ATP na PEPCK de E. coli, ou a efeitos de empacotamento cristalino. A presente estruturada PEPCK de T. cruzi representa uma boa base para a modelagem de novos inibidores, visada ao desenvolvimento de novos fármacos antichagásicos. Com este intuito, foi realizado um estudo preliminar de docagem computacional, baseado no banco de dados NCIopen3D de estruturas de moléculas pequenas do Instituto Nacional do Câncer (NCI) dos EUA, e nas informações estruturais obtidas sobre a enzima
- Imprenta:
- Publisher place: São Carlos
- Date published: 2001
- Data da defesa: 05.11.2001
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ABNT
TRAPANI, Stefano. Estudos estruturais da enzima fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PEPCK) de Trypanosoma cruzi, um potencial alvo para o planejamento de dorgas antichagásicas. 2001. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Carlos, 2001. . Acesso em: 12 maio 2025. -
APA
Trapani, S. (2001). Estudos estruturais da enzima fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PEPCK) de Trypanosoma cruzi, um potencial alvo para o planejamento de dorgas antichagásicas (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Carlos. -
NLM
Trapani S. Estudos estruturais da enzima fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PEPCK) de Trypanosoma cruzi, um potencial alvo para o planejamento de dorgas antichagásicas. 2001 ;[citado 2025 maio 12 ] -
Vancouver
Trapani S. Estudos estruturais da enzima fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PEPCK) de Trypanosoma cruzi, um potencial alvo para o planejamento de dorgas antichagásicas. 2001 ;[citado 2025 maio 12 ]
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