Estudo de cDNAS de função desconhecida e características não usuais em Leishmania major: identificação de uma proteína compartimentalizada (2001)
- Authors:
- Autor USP: CALVO, MARIA PILAR IRIBAR - FMRP
- Unidade: FMRP
- Sigla do Departamento: RBI
- Subjects: LEISHMANIA; DNA (IDENTIFICAÇÃO)
- Language: Português
- Abstract: A grande quantidade de genes novos, revelada pelo Projeto Genoma de Leishmania, despertou nosso interesse por eles e assim realizamos uma análise comparativa de uma população de genes de função desconhecida frente a outros com função predita, em procura de características comuns. Esta análise revelou que a categoria de "genes desconhecidos", apresentava características não usuais, entre elas um alto conteúdo de AT, para os padrões de Leishmania. Isto nos levou a selecionar o gene ODD1(sem função definida) para uma análise mais detelhada visando uma caracterização do mesmo. O sequenciamento completo do gene revelou uma ORF rica em AT de pequeno tamanho, com dois códons internos de parada. A sequencia completa, incluindo os códons internos de parada mostrou-se altamente conservada nas diferentes espécies de Leishmania analisadas. Na procura de uma explicação para estes códons TGA internos, foram encontradas ao menos 7 selenoproteínas no parasita, sendo esta a primeira vez que proteínas desta categoria são reportadas para tripanossomatídeos. Uma análise do transcrito ODD1 revelou que o mesmo era processado policistronicamente e transportado para o citoplasma, descartando assim a possibilidade de que seu processsamneto fosse um artefato de construção da biblioteca ou que atuasse como um ncRNA no núcleo. A região genômica na qual se insere o gene ODD1 é, em toda a extensão analisada, rica em AT e tem uma densidade de transcritos compatível com aquela descrita paraoutras regiòes do genoma. A análise dos níveis de transcrição dos oito transcritos detectados revelou que quatro deles apresentam-se em níveis mais elevados nos amastigotas. Por último, em procura de um produto protéico para o ODD1 e utilizando a técnica de transposição como estratégia de "armadilha de genes", na qual a expressão do marcador de seleção depende de sua fusão com um produto funcional, foi possível fazer a localização subcelular da ) proteína codificada pelo gene ODD1, através de fusão com NEO (gene que codifica a Neomicina fosfotransferase), mostrndo que a mesma é compartimentalizada em grânulos. Os resultados obtidos durante o desenvolvimento deste projeto, nos permitem sugerir que as estratégias e ferramentas utilizadas no processo de anotação do projeto genoma de Leishmania têm um viés para a identificação de transcritos sem função definida, seja por seu tamanho ou pelas características não usuais de sua composição nucleotídica. Portanto é possível que inúmeros RNAs não codificadores (ncRNAs) e proteínas não usuais não estejam sendo detectadas
- Imprenta:
- Publisher place: Ribeirão Preto
- Date published: 2001
- Data da defesa: 01.10.2001
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ABNT
CALVO, Maria Pilar Iribar. Estudo de cDNAS de função desconhecida e características não usuais em Leishmania major: identificação de uma proteína compartimentalizada. 2001. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2001. . Acesso em: 01 out. 2024. -
APA
Calvo, M. P. I. (2001). Estudo de cDNAS de função desconhecida e características não usuais em Leishmania major: identificação de uma proteína compartimentalizada (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. -
NLM
Calvo MPI. Estudo de cDNAS de função desconhecida e características não usuais em Leishmania major: identificação de uma proteína compartimentalizada. 2001 ;[citado 2024 out. 01 ] -
Vancouver
Calvo MPI. Estudo de cDNAS de função desconhecida e características não usuais em Leishmania major: identificação de uma proteína compartimentalizada. 2001 ;[citado 2024 out. 01 ]
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