Uso do método de reamostragem "bootstrap" na estimação de parâmetros genéticos populacionais (2001)
- Authors:
- Autor USP: GARCIA, LUCIANA APARECIDA CARLINI - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Sigla do Departamento: LGN
- Assunto: GENÉTICA MOLECULAR
- Language: Português
- Abstract: Muitos autores têm utilizado marcadores isoenzimáticos ou moleculares para estudar a estrutura genética e o sistema reprodutivo de populações naturais. Para tanto, parâmetros populacionais de interesse são estimados, mas há pouca informação sobre o erro associado a essas estimativas em função dos diferentes níveis de amostragem. Por intermédio dessa informação, estratégias de amostragem poderiam ser estabelecidas de modo a reduzir a magnitude dos erros associados a tais estimativas. No presente trabalho foram utilizados conjuntos de dados reais, além de dados simulados em algumas situações. Para os dados reais, foram feitas reamostragens "bootstrap" de loci, indivíduos, populações, e indivíduos e populações concomitantemente. Para os parâmetros índice de fixação total ( ), diversidade entre populações ou grau de coancestralidade nas populações ( ), índice de fixação dentro das populações ( ), taxa aparente de cruzamento ( ), fluxo de genes entre populações ( ) e tamanho efetivo populacional ( ) foi possível obter, em função das diferentes fontes de reamostragem, os erros associados às estimativas desses parâmetros, à distribuição empírica dessas estimativas e intervalos de confiança para tais parâmetros. Em geral, as menores variâncias estão associadas às estimativas de . O contrário foi observado para e. Verificou-se que apenas as distribuições empíricas de e tendem à normalidade. Isso ocorreu somente quando foram feitas reamostragens envolvendo indivíduos,possivelmente por serem mais numerosos que populações e loci. A partir dos dados reais e simulados, para os parâmetros, e individualmente e em conjunto, verificou-se que as estimativas das variâncias devidas à reamostragem de indivíduos e de populações isoladamente são aditivas. Conseqüentemente, pode-se calcular a contribuição relativa destas duas fontes de variação para a variância total das estimativas. Foi possível concluir que dois métodos de ) verificação da importância relativa das causas de variação de populações e de indivíduos, como fonte de erros das estimativas dos parâmetros e, em geral, apresentaram resultados concordantes. Para obter o número necessário de loci, indivíduos e populações, visando atingir uma determinada precisão na estimação de e, foram feitas reamostragens com tamanho variável de amostras "bootstrap". Para os diversos níveis dos fatores loci, indivíduos e populações, foram estimadas as respectivas variâncias e construídas curvas de regressão entre o número de populações, ou indivíduos ou loci e os erros de estimação associados. Em geral, os tamanhos amostrais utilizados nas pesquisas com populações naturais foram suficientes apenas para estimar, considerando a magnitude estabelecida para os erros das estimativas. Observou-se também que a fonte de variação de loci dos parâmetros e. Portanto, em pesquisas futuras dessa natureza, é recomendável atentar para a necessidade de trabalhar com número adequado de loci. Estenúmero certamente deve ser maior do que o comumente utilizado. A fonte de variação de populações também foi importante na estimação dos parâmetros e, devendo assim merecer a devida atenção. Diante dessas informações, evidencia-se a importância da aplicação de "bootstrap" na mensuração da precisão de estimativas de parâmetros populacionais, em função das diversas fontes de variação
- Imprenta:
- Publisher place: Piracicaba
- Date published: 2001
- Data da defesa: 29.03.2001
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ABNT
CARLINI-GARCIA, Luciana Aparecida. Uso do método de reamostragem "bootstrap" na estimação de parâmetros genéticos populacionais. 2001. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2001. Disponível em: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-20200111-131551/. Acesso em: 01 out. 2024. -
APA
Carlini-Garcia, L. A. (2001). Uso do método de reamostragem "bootstrap" na estimação de parâmetros genéticos populacionais (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de https://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-20200111-131551/ -
NLM
Carlini-Garcia LA. Uso do método de reamostragem "bootstrap" na estimação de parâmetros genéticos populacionais [Internet]. 2001 ;[citado 2024 out. 01 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-20200111-131551/ -
Vancouver
Carlini-Garcia LA. Uso do método de reamostragem "bootstrap" na estimação de parâmetros genéticos populacionais [Internet]. 2001 ;[citado 2024 out. 01 ] Available from: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11137/tde-20200111-131551/
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