Estudo de sequências homólogas ao retrotransposon TNT1 em Lycopersicon peruvianum (L.) Mill (1999)
- Authors:
- Autor USP: COSTA, ANA PAULA PIMENTEL - IB
- Unidade: IB
- Sigla do Departamento: BIB
- Assunto: BOTÂNICA
- Language: Português
- Abstract: A presença de seqüências homólogas ao retrotransposon Tnt1 já havia sido anteriormente detectada em espécies do gênero Lycopersicon. Neste presente estudo, procurou-se caracterizar estas seqüências tendo como modelo L.peruvianum (L.) Mill. Dois clones independentes (Lp1 e Lp5) foram isolados de uma biblioteca genômica de L.peruvianum. A análise destes clones, baseada em hibridação molecular, comparação de seqüências e buscas em bancos de dados, mostrou que estes contém regiões de homologia com Tnt1. Sendo a homologia em relação a Tnt1 é maior em Lp1 (85% de identidade em nível de aminoácidos) do que em Lp5 (55% de identidade em nível de aminoácidos). Em Lp1 a região homóloga a Tn1 corresponde a 3300 bp. Esta apresenta os domínios funcionais e a organização típica dos retrotransposons do tipo Ty1-cópia. Esta seqüência não engloba um elemento completo, pois não foi possível localizar a sua extremidade 3', que correspondendo a porção final do domínio da transcriptase reversa e a LTR 3'. No entanto todos os outros domínios funcionais presentes (GAG, protease e endonuclease) e a LTR 5' se apresentam altamente conservados ( acima de 80% de identidade) em comparação a Tnt1. Por suas características esta seqüência foi denominada de Tlp1 (transposon de L.peruvianum 1). Tlp1 encontra disperso no genoma de L.peruvianum e também está presente em outras espécies dentro deste gênero. Foi observada uma variação do padrão de distribuição de Tlp1entre estas espécies. Isto sugere queTlp1 possa ser um instrumento útil no estudo das relações filogenética dentro deste gênero. Também foi observada a possível presença de transcritos, em diferentes condições, o que sugere uma possível atividade de Tlp1. No clone Lp5, sua seqüência parcial indicou que a região homóloga a Tnt1 corresponde a 2000 pb. Esta também apresenta alguns dos domínios funcionais ( protease, endonucleas e transcriptase reversa) de tretrotransposons e ) organização destes é típica dos retrotransposons Ty1-cópia. Contudo, como a maioria destes domínios encontra-se incompleta é necessário uma maior caracterização desta seqüência para defini-la como um retrotransposon. Estudos utilizando tanto Tlp1 como Lp5 podem contribuir para a compreensão de suas relações no genoma de L.peruvianum, contribuindo assim para o entendimento das relações entre retrotransposons e o genoma vegetal. A possível atividade de Tpl1, seus mecanismos de controle também podem ser uma fonte importante de infomações sobre a origem e a evolução de seqüências móveis nas plantas
- Imprenta:
- Data da defesa: 24.02.1999
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ABNT
COSTA, Ana Paula Pimentel. Estudo de sequências homólogas ao retrotransposon TNT1 em Lycopersicon peruvianum (L.) Mill. 1999. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 1999. . Acesso em: 24 abr. 2024. -
APA
Costa, A. P. P. (1999). Estudo de sequências homólogas ao retrotransposon TNT1 em Lycopersicon peruvianum (L.) Mill (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. -
NLM
Costa APP. Estudo de sequências homólogas ao retrotransposon TNT1 em Lycopersicon peruvianum (L.) Mill. 1999 ;[citado 2024 abr. 24 ] -
Vancouver
Costa APP. Estudo de sequências homólogas ao retrotransposon TNT1 em Lycopersicon peruvianum (L.) Mill. 1999 ;[citado 2024 abr. 24 ]
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