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Identificação e clonagem molecular de genes com expressão diferencial em raízes de fumo (Nicotiana tabacum) infectadas por Glomus intradices (1997)

  • Authors:
  • Autor USP: DITT, RENATA FAVA - ESALQ
  • Unidade: ESALQ
  • Sigla do Departamento: SD
  • Subjects: CLONAGEM; EXPRESSÃO GÊNICA; FUMO; FUNGOS MICORRÍZICOS
  • Language: Português
  • Abstract: Com o objetivo de compreender os mecanismos que regulam a formação da simbiose entre fungos micorrízicos arbusculares e raízes de plantas, procurou-se identificar e clonar genes com expressão diferencial na interação através da técnica do "display" diferencial de cDNAs. Raízes de fumo (Nicotiana tabacum) não colonizadas e colonizadas pelo fungo Glomus intraradices foram coletadas, após um período experimental de oito semanas, para a extração de RNA. Em seguida, iniciadores com base na seqüência poliadenílica do RNA mensageiro de eucariotos (oligo-dTs) foram utilizados para a síntese de cDNA. Iniciadores aleatórios ou combinações de iniciadores aleatórios e oligo-dTs foram utilizadas para amplificar, por PCR, a primeira fita de cDNA. Três produtos de amplificação presentes somente em amostras de raízes colonizadas foram identificados e clonados. Os clones foram seqüenciados e suas seqüências comparadas às seqüências de genes conhecidos. O clone NtGil apresentou 55 a 70% e 33 a 66% de identidade em nível de nucleotídeos e aminoácidos, respectivamente, com genes que codificam proteínas acessórias da urease (UreG), de várias bactérias e Arabidopsis. O clone NtGi2 também apresentou alta homologia (55 a 66% em nível de nucleotídeos e 41 a 65% em nível de aminoácidos) com proteínas UreG de várias bactérias. Esse clone é praticamente idêntico à NtGil, diferindo apenas por uma inserção de 74 nucleotídeos, entre as posições 534 e 607. A seqüência de nucleotídeos doclone NtGi3 é idêntica à sequência de NtGil, exceto pelo fato do clone NtGil abranger uma porção maior da região '3 POT.+' do gene. A análise da seqüência de aminoácidos deduzida revelou a presença de sítios putativos de N-glicosilação (NYSR e NKTD), de ligação ATP/GTP (GPVGSGKT, "P-loop") e de fosforilação por quinase-tirosina (RELADYIY). Os sítios de glicosilação e de ligação ATP/GTP são conservados entre as proteínas UreG armazenadas nos bancos de dados. No entanto, o sítio de fosforilação é específico para os cDNAs isolados. Com base nos resultados obtidos, é possível que as proteínas UreG estejam envolvidas no metabolismo do nitrogênio durante a simbiose ou ainda com a infectividade do fungo
  • Imprenta:
  • Data da defesa: 30.06.1997
  • Acesso à fonte
    How to cite
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    • ABNT

      DITT, Renata Fava; LAMBAIS, Marcio Rodrigues. Identificação e clonagem molecular de genes com expressão diferencial em raízes de fumo (Nicotiana tabacum) infectadas por Glomus intradices. 1997.Universidade de São Paulo, Piracicaba, 1997. Disponível em: < http://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11144/tde-20181127-161308/ >.
    • APA

      Ditt, R. F., & Lambais, M. R. (1997). Identificação e clonagem molecular de genes com expressão diferencial em raízes de fumo (Nicotiana tabacum) infectadas por Glomus intradices. Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11144/tde-20181127-161308/
    • NLM

      Ditt RF, Lambais MR. Identificação e clonagem molecular de genes com expressão diferencial em raízes de fumo (Nicotiana tabacum) infectadas por Glomus intradices [Internet]. 1997 ;Available from: http://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11144/tde-20181127-161308/
    • Vancouver

      Ditt RF, Lambais MR. Identificação e clonagem molecular de genes com expressão diferencial em raízes de fumo (Nicotiana tabacum) infectadas por Glomus intradices [Internet]. 1997 ;Available from: http://teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11144/tde-20181127-161308/

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