Descoberta e caracterização de vírus emergentes e reergentes em áreas peri-florestais (2018)
- Autores:
- Autor USP: PAOLA, NICHOLAS DI - ICB
- Unidade: ICB
- Sigla do Departamento: BMM
- Assuntos: PARVOVIRIDAE; VIROSES; FEBRE AMARELA; INFECÇÕES POR ARBOVIRUS; FILOGENIA; SEQUENCIAMENTO GENÉTICO; EVOLUÇÃO
- Palavras-chave do autor: Codon usage; Emerging virus; Evolução viral; Filogenia; Hidden Markov Models; Modelos Ocultos de Markov; Parvovirus B19; Parvovírus B19; Phylogeny; Uso do codão; Viral Evolution; Vírus da febre amarela; Vírus emergente; Yellow Fever virus
- Idioma: Português
- Resumo: A fragmentação e a invasão de florestas tropicais e a crescente concentração de assentamentos humanos aumentaram exponencialmente as chances de exposição a vírus emergentes e emergentes. Dado o grande potencial de espalhamento de patógenos em população humanas, a identificação e caracterização de agentes patogênicos circulantes podem melhorar a atenção primária e as capacidades de diagnóstico para um agente emergente futuro. As abordagens moleculares e metagenômicas que utilizam as tecnologias de sequenciação da próxima geração levaram a descoberta e caracterização de muitos vírus emergentes na última década. Além disso, as abordagens in silico também podem ajudar a identificar vírus emergentes usando apenas dados de sequenciamento publicamente disponíveis. Além disso, estimar a ascendência filogenética e até mesmo analisar as mudanças no uso de codons são ferramentas adicionais que podem melhorar a nossa compreensão de vírus emergentes ou reemergentes. Este projeto visou aplicar essas ferramentas em ambos os vírus que poderiam estar circulando no Brasil: Parvovírus B19 e vírus da Febre Amarela. Também exploramos as aplicações de modelos ocultos de Markov e índice de adaptação de codons usando dados publicamente disponíveis. Esperamos que este trabalho forneça uma prova de conceito para futuros projetos metagenômicos e demonstre a utilidade das várias técnicas moleculares e bioinformáticas no estudo de vírus emergentes
- Imprenta:
- Data da defesa: 21.03.2018
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ABNT
PAOLA, Nicholas Di. Descoberta e caracterização de vírus emergentes e reergentes em áreas peri-florestais. 2018. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2018. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-26062018-095508/. Acesso em: 18 abr. 2024. -
APA
Paola, N. D. (2018). Descoberta e caracterização de vírus emergentes e reergentes em áreas peri-florestais (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-26062018-095508/ -
NLM
Paola ND. Descoberta e caracterização de vírus emergentes e reergentes em áreas peri-florestais [Internet]. 2018 ;[citado 2024 abr. 18 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-26062018-095508/ -
Vancouver
Paola ND. Descoberta e caracterização de vírus emergentes e reergentes em áreas peri-florestais [Internet]. 2018 ;[citado 2024 abr. 18 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-26062018-095508/
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