Integrative analysis of microRNAs and mRNAs involved in regulation of intramuscular fat deposition in Nelore cattle (2017)
- Autores:
- Autor USP: OLIVEIRA, GABRIELLA BORBA DE - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Sigla do Departamento: LZT
- Assuntos: GADO NELORE; LIPÍDEOS; GORDURAS; RNA
- Idioma: Inglês
- Resumo: A quantidade de gordura intramuscular pode influenciar as características sensoriais e o valor nutricional da carne bovina, assim, a seleção de animais com conteúdo de gordura adequado para o consumidor torna-se importante. A gordura intramuscular é uma característica complexa, de difícil medição e há um conhecimento crescente sobre os genes e vias que controlam os processos biológicos envolvidos na deposição de gordura no músculo. MicroRNAs (miRNAs) são uma classe bem conservados de pequenos RNAs não-codificantes, que modulam a expressão gênica de uma gama de funções no desenvolvimento e fisiologia animal. Este estudo objetivou identificar miRNAs diferencialmente expressos (DE), genes reguladores candidatos e redes de co-expressão usando dados de expressão de mRNAs e miRNAs do músculo Longissimus dorsi de 30 novilhos Nelore com valores genéticos genômicos estimados (GEBV) extremos para conteúdo de gordura intramuscular (IMF). A análise de expressão diferencial entre os dados de miRNA de animais com valores extremos de GEBV para o IMF identificou seis miRNAs DE. A anotação funcional de genes alvos destes microRNAs indica que a via de sinalização de PPAR está envolvida com a deposição de IMF. Os genes reguladores candidatos, tais como SDHAF4, FBXO17, ALDOA e PKM foram identificados pelas abordagens de correlação parcial com teoria da informação (PCIT), fator de impacto fenotípico (PIF) e fator de impacto regulatório (RIF) a partir de dados integrados de expressão demRNAs-miRNAs. Dois miRNAs, bta-miR-143 e bta-miR-146b, com alta expressão no grupo de baixo conteúdo de IMF, também foram correlacionados com genes reguladores candidatos, os quais foram funcionalmente enriquecidos para termos GO relacionados a oxidação de ácidos graxos. As redes de co-expressão identificaram vários módulos relacionados ao sistema imunológico, ao metabolismo das proteínas, ao metabolismo energético e ao catabolismo da glicose através da análise ponderada da rede de correlação (WGCNA), que mostrou possível interação e regulação entre mRNAs e miRNAs. Este estudo contribui com a compreensão dos possíveis mecanismos reguladores das redes de sinalização genética envolvidas no processo de deposição de gordura. O metabolismo da glicose e o processo de inflamação foram as principais vias encontrados na análise integrada de mRNA-miRNA e mostraram estar associadas ao conteúdo de gordura intramuscular em bovinos de corte
- Imprenta:
- Local: Piracicaba
- Data de publicação: 2017
- Data da defesa: 16.02.2017
-
ABNT
OLIVEIRA, Gabriella Borba de. Integrative analysis of microRNAs and mRNAs involved in regulation of intramuscular fat deposition in Nelore cattle. 2017. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Piracicaba, 2017. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-26072017-103507/. Acesso em: 07 maio 2024. -
APA
Oliveira, G. B. de. (2017). Integrative analysis of microRNAs and mRNAs involved in regulation of intramuscular fat deposition in Nelore cattle (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Piracicaba. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-26072017-103507/ -
NLM
Oliveira GB de. Integrative analysis of microRNAs and mRNAs involved in regulation of intramuscular fat deposition in Nelore cattle [Internet]. 2017 ;[citado 2024 maio 07 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-26072017-103507/ -
Vancouver
Oliveira GB de. Integrative analysis of microRNAs and mRNAs involved in regulation of intramuscular fat deposition in Nelore cattle [Internet]. 2017 ;[citado 2024 maio 07 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-26072017-103507/
Como citar
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
