Análise estrutural de mutações na enzima GALNS associadas à mucopolissacaridose IVA utilizando a técnica de modelagem comparativa (2015)
- Autores:
- Autor USP: TORRIERI, ÉRICO - FMRP
- Unidade: FMRP
- Sigla do Departamento: RGE
- Assuntos: GLICOSAMINOGLICANAS; ENZIMAS; HOMOLOGIA (MODELAGEM)
- Palavras-chave do autor: GALNS; Homology modeling; Missense mutations; MPS IVA; Mutações missense
- Idioma: Português
- Resumo: As Mucopolissacaridoses (MPS) são um grupo de doenças de armazenamento lisossômico causadas por deficiência de enzimas que catalisam a degradação gradual das glicosaminoglicanas (GAGs). GAGs (anteriormente chamadas de mucopolissacarídeos) são produtos de degradação das proteoglicanas que existem na matriz extracelular e tem efeito proteolítico. A classificação das MPS é baseada na deficiência enzimática específica. A MPS IVA é causada por mutações no gene que codifica a enzima GALNS (Nacetilgalactosamina-6-sulfatase), a qual desempenha um papel crucial na degradação do sulfato de queratano e condroitina-6-sulfatase. As mutações na enzima se resumem em três categorias: interrupção do sítio ativo, alterações no núcleo hidrofóbico e exposição da superfície, onde mutações missense na estrutura podem afetar gravemente a atividade da proteína GALNS, alterando seu núcleo hidrofóbico ou modificando seu enovelamento (folding). Com a falta de tratamentos efetivos, sendo em sua maioria paliativos, e tendo como base a estrutura já resolvida da GLANS selvagem, este trabalho teve como objetivo modelar 3 variantes da enzima GALNs, sendo uma mutação no sítio ativo, uma no núcleo hidrofóbico e uma na superfície. Foi usado o software MODELLER 9.12 para a modelagem comparativa, os softwares Prochek, PROSA II, ERRATv2, Verify3d, ProQ para a avaliação dos modelos, o software NAND 2.10, para simulação de dinâmica molecular e o software Chimera 1.10.1 para cálculo de superfícies eletrostáticas e hidrofobicidade da superfície. Os modelos apresentaram bons resultados segundo os softwares de avaliação e análise visual. Apresentaram poucas diferenças estruturais em relação à estrutura da GALNS selvagem, demonstraram estabilidade em simulação de dinâmica molecular. Entretanto, algumas diferenças foram observadas com relação à distribuição de cargas e hidrofobicidade nosítio ativo do modelo da variante com mutação no sítio ativo. Pôde ser concluído que as 3 mutações analisadas não causaram alterações estruturais significativas, não interferiram na estabilidade estrutural em simulação de dinâmica molecular, entretanto, foi demonstrado que mutações na região do sítio ativo podem interferir na função da enzima
- Imprenta:
- Local: Ribeirão Preto
- Data de publicação: 2015
- Data da defesa: 09.06.2015
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ABNT
TORRIERI, Érico. Análise estrutural de mutações na enzima GALNS associadas à mucopolissacaridose IVA utilizando a técnica de modelagem comparativa. 2015. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2015. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-28072015-113748/. Acesso em: 16 abr. 2024. -
APA
Torrieri, É. (2015). Análise estrutural de mutações na enzima GALNS associadas à mucopolissacaridose IVA utilizando a técnica de modelagem comparativa (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-28072015-113748/ -
NLM
Torrieri É. Análise estrutural de mutações na enzima GALNS associadas à mucopolissacaridose IVA utilizando a técnica de modelagem comparativa [Internet]. 2015 ;[citado 2024 abr. 16 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-28072015-113748/ -
Vancouver
Torrieri É. Análise estrutural de mutações na enzima GALNS associadas à mucopolissacaridose IVA utilizando a técnica de modelagem comparativa [Internet]. 2015 ;[citado 2024 abr. 16 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-28072015-113748/
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