Triagem funcional de genes envolvidos no processo de manutenção da inativação do cromossomo X em humanos (2014)
- Autores:
- Autor USP: VERGANI, NAJA - IB
- Unidade: IB
- Sigla do Departamento: BIO
- Assuntos: CROMOSSOMO X; GENES; EXPRESSÃO GÊNICA; TRIAGEM; GENOMAS; MODELOS ANIMAIS; DNA; CROMATINA
- Palavras-chave do autor: Epigenética; Epigenetics; Genomic functional screening; ICX; Inativação do cromossomo X; Next generation sequencing; NGS; Sequenciamento de próxima geração; Triagem genômica funcional; X chromosome inactivation; XCI
- Idioma: Português
- Resumo: A compensação da dosagem gênica entre fêmeas XX e machos XY em mamíferos é adquirida através de um complexo mecanismo epigenético que resulta na inativação de grande parte de um dos cromossomos X nas células femininas. O processo de inativação do cromossomo X (XCI) se inicia cedo durante a embriogênese, concomitantemente à diferenciação celular, e envolve a aquisição de modificações epigenéticas características do cromossomo X inativo (Xi). Uma estabelecido, o padrão de inativação é estavelmente mantido através de todas as mitoses celulares subsequentes e por toda a vida do organismo (exceto para células germinativas que sofrem reativação do Xi). Os mecanismos envolvidos na iniciação e estabelecimento da XCI foram extensivamente estudados, especialmente em camundongos. Embora algumas características epigenéticas associadas à manutenção da XCI tenham sido descritas, a identidade e modo específico de ação de fatores envolvidos durante essa fase da XCI são aspectos ainda não bem compreendidos. Além disso, o processo de XCI apresenta diferenças importantes entre humanos e camundongos e estudos direcionados para a identificação de novos componentes envolvidos na manutenção da XCI em humanos tornam-se de fundamental importância. Triagens funcionais genômicas por bibliotecas de shRNAs constituem uma ferramenta poderosa para a identificação de genes envolvidos em diferentes mecanismos celulares e vias bioquímicas. Sendo assim, utilizamos essa ferramenta para triar genes envolvidosna manutenção da XCI em humanos. Células somáticas femininas primárias HPRT+/-/HPRT- foram transduzidas com uma biblioteca lentiviral de shRNAs e posteriormente tratadas em meio de cultura contendo a droga HAT para seleção de células HPRT+ nas quais esperava-se que o cromossomo Xi presente tivesse sofrido reativação em decorrência do knockdown de genes envolvidos na manutenção da XCI. Essa estratégia nos permitiu identificar 20 novos genes candidatos a estarem envolvidos na manutenção da XCI. Esses candidatos deverão ser avaliados individualmente para confirmar seu papel no processo de controle epigenético do cromossomo X
- Imprenta:
- Data da defesa: 01.04.2014
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ABNT
VERGANI, Naja. Triagem funcional de genes envolvidos no processo de manutenção da inativação do cromossomo X em humanos. 2014. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2014. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41131/tde-11072014-094132/. Acesso em: 19 abr. 2024. -
APA
Vergani, N. (2014). Triagem funcional de genes envolvidos no processo de manutenção da inativação do cromossomo X em humanos (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41131/tde-11072014-094132/ -
NLM
Vergani N. Triagem funcional de genes envolvidos no processo de manutenção da inativação do cromossomo X em humanos [Internet]. 2014 ;[citado 2024 abr. 19 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41131/tde-11072014-094132/ -
Vancouver
Vergani N. Triagem funcional de genes envolvidos no processo de manutenção da inativação do cromossomo X em humanos [Internet]. 2014 ;[citado 2024 abr. 19 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41131/tde-11072014-094132/
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