Emprego de técnicas de análise exploratória de dados utilizados em química medicinal (2013)
- Authors:
- Autor USP: GERTRUDES, JADSON CASTRO - EACH
- Unidade: EACH
- Subjects: QUÍMICA MÉDICA; QUÍMICA FARMACÊUTICA; RELAÇÕES ESTRUTURA-ATIVIDADE; COMPONENTES PRINCIPAIS (ANÁLISE)
- Keywords: Agrupamento de dados; Análise de componentes principais; Análise de componentes principais esparsas; Análise entre estrutura química e atividade biológica; Clustering; Dimensionality reduction; Principal component analysis; Redução de dimensionalidade; Seleção de variáveis; Sparse principal component analysis; Structure activity relationship; Variable selection
- Language: Português
- Abstract: Pesquisas na área de química medicinal têm direcionado esforços na busca por métodos que acelerem o processo de descoberta de novos medicamentos. Dentre as diversas etapas relacionadas ao longo do processo de descoberta de substâncias bioativas está a análise das relações entre a estrutura química e a atividade biológica de compostos. Neste processo, os pesquisadores da área de química medicinal analisam conjuntos de dados que são caracterizados pela alta dimensionalidade e baixo número de observações. Dentro desse contexto, o presente trabalho apresenta uma abordagem computacional que visa contribuir para a análise de dados químicos e, consequentemente, a descoberta de novos medicamentos para o tratamento de doenças crônicas. As abordagens de análise exploratória de dados, utilizadas neste trabalho, combinam técnicas de redução de dimensionalidade e de agrupamento para detecção de estruturas naturais que reflitam a atividade biológica dos compostos analisados. Dentre as diversas técnicas existentes para a redução de dimensionalidade, são discutidas o escore de Fisher, a análise de componentes principais e a análise de componentes principais esparsas. Quanto aos algoritmos de aprendizado, são avaliados o k-médias, fuzzy c-médias e modelo de misturas ICA aperfeiçoado.No desenvolvimento deste trabalho foram utilizados quatro conjuntos de dados, contendo informações de substâncias bioativas, sendo que dois conjuntos foram relacionados ao tratamento da diabetes mellitus e da síndrome metabólica, o terceiro conjunto relacionado a doenças cardiovasculares e o último conjunto apresenta substâncias que podem ser utilizadas no tratamento do câncer. Nos experimentos realizados, os resultados alcançados sugerem a utilização das técnicas de redução de dimensionalidade juntamente com os algoritmos não supervisionados para a tarefa de agrupamento dos dados químicos, uma vez que nesses experimentos foi possível descrever níveis de atividade biológica dos compostos estudados. Portanto, é possível concluir que as técnicas de redução de dimensionalidade e de agrupamento podem possivelmente ser utilizadas como guias no processo de descoberta e desenvolvimento de novos compostos na área de química medicinal
- Imprenta:
- Data da defesa: 10.09.2013
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ABNT
GERTRUDES, Jadson Castro. Emprego de técnicas de análise exploratória de dados utilizados em química medicinal. 2013. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2013. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/100/100131/tde-14112013-124231/. Acesso em: 24 abr. 2024. -
APA
Gertrudes, J. C. (2013). Emprego de técnicas de análise exploratória de dados utilizados em química medicinal (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/100/100131/tde-14112013-124231/ -
NLM
Gertrudes JC. Emprego de técnicas de análise exploratória de dados utilizados em química medicinal [Internet]. 2013 ;[citado 2024 abr. 24 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/100/100131/tde-14112013-124231/ -
Vancouver
Gertrudes JC. Emprego de técnicas de análise exploratória de dados utilizados em química medicinal [Internet]. 2013 ;[citado 2024 abr. 24 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/100/100131/tde-14112013-124231/
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