Análise do transcriptoma do fígado da serpente Bothrops jararaca utilizando expressed sequence tags (ESTs) (2013)
- Authors:
- Autor USP: GOMES, CICERA MARIA - BIOTECNOLOGIA
- Unidade: BIOTECNOLOGIA
- Subjects: SERPENTES; FÍGADO; EXPRESSÃO GÊNICA; METABOLISMO DE PROTEÍNA
- Keywords: BOTHROPS JARARACA; TRANSCRIPTOMA; EXPRESSED SEQUENCE TAGS
- Language: Português
- Abstract: Bothrops jararaca é uma das principais serpentes responsáveis por acidentes ofídicos em São Paulo. O efeito do envenenamento pode ser local ou sistêmico, os quais são mediados por uma variedade de componentes do veneno. Considerando que, em animais vertebrados, o fígado desempenha atividades metabólicas essenciais, além de ser o principal órgão responsável pela síntese de proteínas do plasma, a obtenção do transcriptoma deste é de extrema importância para o estudo destas proteínas. Assim, o objetivo deste trabalho foi analisar o perfil de expressão de RNA no fígado de B. jararaca. Para isto foram obtidas 1700 sequências nucleotídicas denominadas Expressed Sequences Tags (ESTs). As sequências de nucleotídeos foram reunidas em 260 contigs, que foram submetidos ao banco de dados NCBI GenBank usando os algorítimos Blastx e Blastn. dos transcritos tiveram hit com banco de dados NR enquanto 30,5% das ESTs não tiveram homologia. De acordo com a análise do Gene Ontology (GO), os transcritos foram designados para processo biológico, componente celular e função molecular. A maioria dos transcritos foram agrupados em processo biológico, distribuídos em processo metabólico, processo celular e regulação biológica. No entanto, as atividades de ligação proteica, catalítica e de atividade regulatória enzimática foram as principais categorias relacionadas à função molecular. A análise do componente celular apresentou maior número de transcritos envolvidos com a parte celular, região extracelular e restrito a membrana de organela. O maior grupo de transcritos foi relacionado a inibidores de metaloproteases, inibidores de serinoproteases e inibidores de PLA2. Estudos de expressão gênica de alguns alvos selecionados na biblioteca de cDNA de B. jararaca foram realizados para comparação da expressão entre serpentes jovens e adultas. Esses resultados fornecem dados que poderão auxiliar
- Imprenta:
- Data da defesa: 08.03.2013
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ABNT
GOMES, Cícera Maria. Análise do transcriptoma do fígado da serpente Bothrops jararaca utilizando expressed sequence tags (ESTs). 2013. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2013. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-12062013-092051/. Acesso em: 19 abr. 2024. -
APA
Gomes, C. M. (2013). Análise do transcriptoma do fígado da serpente Bothrops jararaca utilizando expressed sequence tags (ESTs) (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-12062013-092051/ -
NLM
Gomes CM. Análise do transcriptoma do fígado da serpente Bothrops jararaca utilizando expressed sequence tags (ESTs) [Internet]. 2013 ;[citado 2024 abr. 19 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-12062013-092051/ -
Vancouver
Gomes CM. Análise do transcriptoma do fígado da serpente Bothrops jararaca utilizando expressed sequence tags (ESTs) [Internet]. 2013 ;[citado 2024 abr. 19 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/87/87131/tde-12062013-092051/
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