Desenvolvimento e aprimoramento de tecnologia em imagem digital para identificação e enumeração semi-automáticas do mesozooplâncton marinho: estudos preliminares (2008)
- Authors:
- Autor USP: LOPES, RUBENS MENDES - IO
- Unidade: IO
- Subjects: ZOOPLÂNCTON MARINHO; IMAGEM DIGITAL
- Language: Português
- Abstract: Visando acelerar o processamento de dados sobre a composição e a abundância do zooplâncton, novas tecnologias de análises envolvendo imagens digitais vêm sendo desenvolvidas, tais como o LOPC (Laser Optical Plankton Counter), o VPR (Video Plankton Recorder), a macro-fotografia, a FlowCAM e o Zooscan. Neste estudo são comparados os resultados obtidos por três métodos: a macro-fotografia, o ZooScan e um escâner de mesa adaptado para este propósito, em relação a dados e medidas obtidos com mesa digitalizadora acoplada a microscópio e lupa. Os objetivos são fornecer subsídios para a padronização das melhores técnicas disponíveis para a detecção automática visual (identificação e contagem) de organismos zooplanctônicos e estabelecer um método para comparação e calibração dos diferentes sistemas de análise visual. As amostras de zooplâncton preservadas com formaldeído tamponado 4% foram obtidas com rede Multinet MPS (300 µm) durante dois cruzeiros oceanográficos com o N/Oc. Prof. W. Besnard na região entre o sul da Ilha de São Sebastião e Peruíbe (SP) na primavera de 2005 e no verão de 2006, como parte do projeto ECOSAN. Em laboratório, estas amostras foram analisadas com cada um desses dispositivos de captação de imagens e seus respectivos programas para tratamento dos resultados. As amostras foram fracionadas entre 1/32 e 1/1024 com um separador Motoda. O principal grupo de organismos zooplanctônicos marinhos, os copépodes, foi identificado ao menor nível taxonômicopossível e os indivíduos contados e medidos sob microscópio estereoscópio dotado de uma câmara clara e mesa digitalizadora, utilizando o programa ZoopBiom (Zooplankton Biomass). Tais medidas serviram para comparação com os resultados obtidos com os equipamentos digitais, permitindo que fossem realizadas as calibrações necessárias. As amostras foram escaneadas em resolução de 1200 dpi, sendo posteriormente processadas e analisadas através do programa Zooprocess, cujos passos são: isolamento de miniaturas individuais de cada organismo detectado na imagem e descrição do organismo em termos de tamanho, forma do corpo e níveis de cinza, entre outras variáveis. As informações são armazenadas em arquivo PID, e tratadas através do Plankton Identifier, um programa de classificação semi-automático baseado na comparação estatística de uma amostra com um arquivo PID de aprendizado, onde se obtém um conjunto de treinamento com uma amplitude de vinhetas representativas de cada unidade de grupo taxonômico. Foi gerado um arquivo de aprendizado contendo mais de 1000 vinhetas em 36 categorias, como: Appendicularia, Chaetognatha, Calanoida, Cnidaria, Cyclopoida, Gastropoda, Malacostraca, Ostracoda, Poecilostomatoida, Salpa entre outras. No caso da macro-fotografia, associada ao programa de computador Zooimage, a técnica consistiu da utilização de uma câmera reflex digital Canon EOS 40D, objetiva macro 50mmm/f2.5 e iluminação de estúdio com flash compacto Mako 1001. As amostras,posicionadas em cubeta de vidro, foram fotografadas perpendicularmente e com a iluminação em back-light a fim de obter imagem com contraste e densidade adequados, sendo super-expostas em um ponto onde se obteve o melhor resultado na separação das miniaturas. Como principais resultados desta fase inicial do estudo podem ser citados: a formação de um banco de imagens de organismos planctônicos; o aprimoramento dos softwares disponíveis para o processamento e a identificação automática do plâncton, principalmente o Zooprocess (utilizado com o ZooScan) e o ZooImage (utilizado com os demais instrumentos) e a geração de resultados de identificação e contagem automática dos organismos do plâncton, focados no aprimoramento da qualidade da classificação em conjunto com o menor tempo possível de processamento. Os novos sistemas de análise de imagens zooplanctônicas oferecem uma solução vantajosa comparada ao método manual de de identificação e contagem. Além disso, os bancos de imagens e de dados gerados são uma garantia de preservação da informação das amostras, possibilitando consultas futuras. Como a demanda pelo monitoramento da qualidade biológica de águas costeiras e oceânicas é crescente no Brasil, as análises digitais
- Imprenta:
- Conference titles: Simpósio Brasileiro de Oceanografia
-
ABNT
SARTORI, Luciana Pinto et al. Desenvolvimento e aprimoramento de tecnologia em imagem digital para identificação e enumeração semi-automáticas do mesozooplâncton marinho: estudos preliminares. 2008, Anais.. São Paulo: Iousp, 2008. . Acesso em: 24 abr. 2024. -
APA
Sartori, L. P., Cabral, C. R., Kitahara, E. M., Miyashita, L. K., Silva, T. A. da S., & Lopes, R. M. (2008). Desenvolvimento e aprimoramento de tecnologia em imagem digital para identificação e enumeração semi-automáticas do mesozooplâncton marinho: estudos preliminares. In . São Paulo: Iousp. -
NLM
Sartori LP, Cabral CR, Kitahara EM, Miyashita LK, Silva TA da S, Lopes RM. Desenvolvimento e aprimoramento de tecnologia em imagem digital para identificação e enumeração semi-automáticas do mesozooplâncton marinho: estudos preliminares. 2008 ;[citado 2024 abr. 24 ] -
Vancouver
Sartori LP, Cabral CR, Kitahara EM, Miyashita LK, Silva TA da S, Lopes RM. Desenvolvimento e aprimoramento de tecnologia em imagem digital para identificação e enumeração semi-automáticas do mesozooplâncton marinho: estudos preliminares. 2008 ;[citado 2024 abr. 24 ] - Organismos zooplanctônicos introduzidos em águas costeiras e estuarinas no Brasil.
- Spatial and temporal variation of the exotic copepod pseudodiaptomus trihamatus wright, 1937 in Bahia coast, eastern Brazil
- Variações na comunidade zooplanctônica em 2 transectos no complexo estuarino de Paranaguá (Paraná)
- Uso da tecnologia FlowCAM para monitoramento de alta frequência do microfitoplâncton em uma maricultura de bivalves na praia da Cocanha (Caraguatatuba, SP)
- Censo da vida marinha (coml): sistema de informações biogeográficas dos oceanos (obis) - catálogo na internet para levantamento da biodiversidade marinha.
- Genome Sequence of the Bacterioplanktonic, Mixotrophic Vibrio campbellii Strain PEL22A, Isolated in the Abrolhos Bank
- A 3-year study of the seasonal variability of abundance, biomass and reproductive traits of Oncaea venusta (Copepoda, Oncaeidae) in a subtropical coastal area
- An empirical assessment of the consistency of taxonomic identifications
- Circumtropical distribution of the epiphytic dino flagellateCoolia malayensis (Dinophyceae): Morphology and molecular phylogeny from Puerto Rico and Brazil
- A global marine particle size distribution dataset obtained with the Underwater Vision Profiler 5
How to cite
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
