Simetrias de Lie e modelagem estocástica da regulação da expressão gênica (2008)
- Autores:
- Autor USP: RAMOS, ALEXANDRE FERREIRA - IFSC
- Unidade: IFSC
- Sigla do Departamento: FCM
- Assuntos: REGULAÇÃO GÊNICA; FUNÇÕES ESPECIAIS; SIMETRIA (FÍSICA DE PARTÍCULAS)
- Idioma: Português
- Resumo: Nesta tese, mostramos que o modelo estocástico binário para expressão gênica, por um gene auto-regulado, possui solução completa. A solução dependente do tempo é escrita via expansão em termos das funções de Heun confluentes. Apresentamos um exemplo de dinâmica estocástica desse gene. Para tal, desenvolvemos uma relação de recorrência entre derivadas arbitrárias das funções de Heun confluentes. Mostramos também que o regime estacionário deste modelo possui simetria de Lie SO(2,1) tipo Lorentz. Esta simetria é análoga à simetria do momento angular, porém com um sinal "errado". O invariante desta álgebra define a meia-vida relativa do regime dinâmico do gene. O equivalente do momento angular azimutal é uma medida indireta do nível de atividade do gene. Os operadores levantamento e abaixamento conectam diferentes processos estocásticos de expressão proteínica. As flutuações destes processos estocásticos são classificadas em termos das relações entre os etiquetadores de um elemento da representação da álgebra. No arcabouço da teoria dos grupos, o modelo estocástico para um gene externamente regulado aparece como um caso particular do modelo para um gene auto-regulado. Mostramos, por fim, uma comparação entre estas duas estratégias de regulação. Demonstramos que um gene auto-regulado pode expressar proteínas em regimes sub Poisson, Poisson ou super Poisson. Por seu turno, o gene externamente regulado somente expressa proteínas em regimes Poisson ou super Poisson.Portanto, num processo estocástico, a auto-regulação mostra-se como uma forma de controle mais precisa. Também mostramos que a dinâmica de genes auto-regulados possui meia-vida mais curta que a de genes externamente regulados. Ou seja, a auto-regulação permite respostas mais rápidas à perturbações externas
- Imprenta:
- Local: São Carlos
- Data de publicação: 2008
- Data da defesa: 16.09.2008
-
ABNT
RAMOS, Alexandre Ferreira. Simetrias de Lie e modelagem estocástica da regulação da expressão gênica. 2008. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Carlos, 2008. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76131/tde-13052010-114844/. Acesso em: 24 abr. 2024. -
APA
Ramos, A. F. (2008). Simetrias de Lie e modelagem estocástica da regulação da expressão gênica (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Carlos. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76131/tde-13052010-114844/ -
NLM
Ramos AF. Simetrias de Lie e modelagem estocástica da regulação da expressão gênica [Internet]. 2008 ;[citado 2024 abr. 24 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76131/tde-13052010-114844/ -
Vancouver
Ramos AF. Simetrias de Lie e modelagem estocástica da regulação da expressão gênica [Internet]. 2008 ;[citado 2024 abr. 24 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76131/tde-13052010-114844/ - Stochastic model for gene transcription on Drosophila melanogaster embryos
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