Artigo de periodico

Estudo comparativo de três diferentes procedimentos para extração de RNA a partir de amostras fixadas em formalina e embebidas em parafina (2008)

• Autores:
  • Silva, Alfredo Ribeiro da
  • Garcia, Sérgio Britto
• Autores USP: SILVA, ALFREDO RIBEIRO DA - FMRP ; GARCIA, SERGIO BRITTO - FMRP
• Unidade: FMRP
• DOI: 10.1590/s1676-24442008000200009
• Assuntos: RNA; BIOLOGIA MOLECULAR
• Idioma: Português
• Resumo: INTRODUÇÃO: O desenvolvimento de métodos de extração de RNA a partir de amostras fixadas em formalina e embebidas em parafina (FFEP) possibilitou estudos retrospectivos de biologia molecular. Objetivos: Comparar a quantidade e a qualidade do RNA extraído de amostras FFEP a partir de três kits disponíveis comercialmente. MATERIAL E MÉTODO: Utilizando-se três diferentes procedimentos, o RNA total foi extraído de 14 blocos de parafina contendo fragmentos de carcinomas mamários, todos arquivados há 10 anos. A quantidade do RNA foi expressa em pg/'mü'l; e a qualidade, pelo número de integridade do RNA (NIR), utilizando-se o Bioanalyzer da Agilent com o Pico LabChip. O RNA de maior NIR extraído de cada uma das 14 amostras foi amplificado por reação em cadeia da polimerase com transcrição reversa (RT-PCR) utilizando-se o gene G6PD, com primers designados para gerar fragmentos de 67, 151 e 242 pares de bases (pb). RESULTADOS: A média e a mediana da quantidade do RNA extraído para os três protocolos foram, respectivamente, 42,91 e 31,31 pg'mü'l. A média e a mediana do NIR foram, respectivamente, 1,8 e 2. Em todas as amostras, o gene G6PD foi amplificado para fragmentos de RNA de 67 e 151 pb. DISCUSSÃO: Como houve grande variação individual na quantidade e na qualidade do RNA extraído para cada amostra, os dados do presente estudo indicam que, se não for possível extrair RNA de uma determinada amostra na primeira tentativa, uma segunda extração deve ser realizada antes de sedescartar essa amostra para testes de biologia molecular. CONCLUSÕES: Nos três procedimentos utilizados foi possível extrair RNA de qualidade aceitável para amplificação por RT-PCR (com NIR > 1,4)
• Imprenta:
  • Local: Rio de Janeuro
  • Data de publicação: 2008
• Fonte:
  • Título do periódico: Jornal Brasileiro de Patologia e Medicina Laboratorial
  • ISSN: 1676-2444
  • Volume/Número/Paginação/Ano: v. 44, n. 2, p. 123-130, 2008

Informações sobre o DOI: 10.1590/s1676-24442008000200009 (Fonte: oaDOI API)
• Este periódico é de acesso aberto
• Este artigo é de acesso aberto
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• Cor do Acesso Aberto: gold
• Licença: cc-by

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• ABNT

  SILVA, Alfredo Ribeiro da e GARCIA, Sérgio Britto. Estudo comparativo de três diferentes procedimentos para extração de RNA a partir de amostras fixadas em formalina e embebidas em parafina. Jornal Brasileiro de Patologia e Medicina Laboratorial, v. 44, n. 2, p. 123-130, 2008Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1590/s1676-24442008000200009. Acesso em: 20 set. 2024.

• APA

  Silva, A. R. da, & Garcia, S. B. (2008). Estudo comparativo de três diferentes procedimentos para extração de RNA a partir de amostras fixadas em formalina e embebidas em parafina. Jornal Brasileiro de Patologia e Medicina Laboratorial, 44( 2), 123-130. doi:10.1590/s1676-24442008000200009

• NLM

  Silva AR da, Garcia SB. Estudo comparativo de três diferentes procedimentos para extração de RNA a partir de amostras fixadas em formalina e embebidas em parafina [Internet]. Jornal Brasileiro de Patologia e Medicina Laboratorial. 2008 ; 44( 2): 123-130.[citado 2024 set. 20 ] Available from: https://doi.org/10.1590/s1676-24442008000200009

• Vancouver

  Silva AR da, Garcia SB. Estudo comparativo de três diferentes procedimentos para extração de RNA a partir de amostras fixadas em formalina e embebidas em parafina [Internet]. Jornal Brasileiro de Patologia e Medicina Laboratorial. 2008 ; 44( 2): 123-130.[citado 2024 set. 20 ] Available from: https://doi.org/10.1590/s1676-24442008000200009

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