Ferramenta de bioinfomática para a análise de polimorfismo (2003)
- Authors:
- Autor USP: COUTINHO, LUIZ LEHMANN - ESALQ
- Unidade: ESALQ
- Subjects: BIOINFORMÁTICA; GENÉTICA ANIMAL; VARIAÇÃO GENÉTICA
- Language: Português
- Abstract: Polimorfismos são variações alélicas que correspondem a alterações de uma ou mais bases em sequências de DNA. Essas variações sejam elas substituições, inserções ou deleções, podem implicar em alterações na sequência de aminoácidos assim como no controle da expressão gênica. Os polimorfismos respondem pela variabilidade genética nos organismos e podem ser responsáveis por doenças genéticas. Neste trabalho foi desenvolvido um sistema automático em Perl (http://www.cpan.org/) que dinamiza a identificação de polimorfismos em bancos de sequências expressas (ESTs). Neste sistema, ESTs são depositadas em banco de dados MySQL (Sistema Gerenciador de Banco de Dados, http://www.mysql.com/), avaliadas quanto à qualidade das bases sequenciadas (programa Phred) e alinhadas (programa Cap3). Os polimorfismos são identificados considerando-se o valor de qualidade da base, sendo que o sistema permite a flexibilidade de seleção do valor de qualidade para o polimorfismo de acordo com o interesse do usuário. Os polimorfismos são destacados e disponibilizados em forma de tabela, facilitando sua visualização. O sistema desenvolvido dinamiza a identificação de polimorfismos em bancos de sequências expressas via internet, uma ferramenta que auxiliará na identificação e seleção de marcadores moleculares informativos para populações de interesse.
- Imprenta:
- Source:
- Título do periódico: Agropecuária; resumos
- Conference titles: Simpósio Internacional de Iniciação Cientifica da Universidade de São Paulo
-
ABNT
PATRÍCIO, M. et al. Ferramenta de bioinfomática para a análise de polimorfismo. 2003, Anais.. São Paulo: USP, 2003. . Acesso em: 19 set. 2024. -
APA
Patrício, M., Leite, S., Jorge, E. C., Coutinho, L. L., Alves, H. J., Nones, K., & Souza, C. A. de. (2003). Ferramenta de bioinfomática para a análise de polimorfismo. In Agropecuária; resumos. São Paulo: USP. -
NLM
Patrício M, Leite S, Jorge EC, Coutinho LL, Alves HJ, Nones K, Souza CA de. Ferramenta de bioinfomática para a análise de polimorfismo. Agropecuária; resumos. 2003 ;[citado 2024 set. 19 ] -
Vancouver
Patrício M, Leite S, Jorge EC, Coutinho LL, Alves HJ, Nones K, Souza CA de. Ferramenta de bioinfomática para a análise de polimorfismo. Agropecuária; resumos. 2003 ;[citado 2024 set. 19 ] - Identificação das actinas expressas na musculatura esquelética de frangos como marcadores de crescimento muscular
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