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Artigo de periodico
kir-mapper: a toolkit for killer-cell immunoglobulin-like receptor (KIR) genotyping from short-read second-generation sequencing data (2025)
Castelli, Erick C; Pereira, Raphaela Neto; Paes, Gabriela Sato; Andrade, Heloisa S.; Ferreira, Marcel Rodrigues; Santos, Ícaro Scalisse de Freitas; Vince, Nicolas; Pollock, Nicholas R; Norman, Paul J; Meyer, Diogo
Fonte: HLA. Unidade: IB
Assuntos: GENES, POLIMORFISMO, BIOINFORMÁTICA, IMUNOLOGIA
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ABNT
CASTELLI, Erick C et al. kir-mapper: a toolkit for killer-cell immunoglobulin-like receptor (KIR) genotyping from short-read second-generation sequencing data. HLA, v. 105, 2025Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1111/tan.70092. Acesso em: 08 out. 2025.
APA
Castelli, E. C., Pereira, R. N., Paes, G. S., Andrade, H. S., Ferreira, M. R., Santos, Í. S. de F., et al. (2025). kir-mapper: a toolkit for killer-cell immunoglobulin-like receptor (KIR) genotyping from short-read second-generation sequencing data. HLA, 105. doi:10.1111/tan.70092
NLM
Castelli EC, Pereira RN, Paes GS, Andrade HS, Ferreira MR, Santos ÍS de F, Vince N, Pollock NR, Norman PJ, Meyer D. kir-mapper: a toolkit for killer-cell immunoglobulin-like receptor (KIR) genotyping from short-read second-generation sequencing data [Internet]. HLA. 2025 ; 105[citado 2025 out. 08 ] Available from: https://doi.org/10.1111/tan.70092
Vancouver
Castelli EC, Pereira RN, Paes GS, Andrade HS, Ferreira MR, Santos ÍS de F, Vince N, Pollock NR, Norman PJ, Meyer D. kir-mapper: a toolkit for killer-cell immunoglobulin-like receptor (KIR) genotyping from short-read second-generation sequencing data [Internet]. HLA. 2025 ; 105[citado 2025 out. 08 ] Available from: https://doi.org/10.1111/tan.70092
Artigo de periodico
SARS-CoV-2 strains and clinical profiles of COVID-19 patients in a Southern Brazil hospital (2024)
Fam, Bibiana; Cadore, Nathan Araujo; Sbruzzi, Renan; Feira, Marilea Furtado; Giudicelli, Giovanna Câmara; Almeida, Luiz G. P. de; Gerber, Alexandra L; Guimarães, Ana Paula de C; Vasconcelos, Tereza Ribeiro; Pereira, Alexandre C; Pereira, Lygia da Veiga ; Hünemeier, Tábita ; Camey, Suzi Alves; Vianna, Fernanda S. Luiz
Fonte: Frontiers in Immunology. Unidade: IB
Assuntos: COVID-19, SEQUENCIAMENTO GENÉTICO, BIOINFORMÁTICA, BIOESTATÍSTICA
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ABNT
FAM, Bibiana et al. SARS-CoV-2 strains and clinical profiles of COVID-19 patients in a Southern Brazil hospital. Frontiers in Immunology, v. 15, 2024Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.3389/fimmu.2024.1444620. Acesso em: 08 out. 2025.
APA
Fam, B., Cadore, N. A., Sbruzzi, R., Feira, M. F., Giudicelli, G. C., Almeida, L. G. P. de, et al. (2024). SARS-CoV-2 strains and clinical profiles of COVID-19 patients in a Southern Brazil hospital. Frontiers in Immunology, 15. doi:10.3389/fimmu.2024.1444620
NLM
Fam B, Cadore NA, Sbruzzi R, Feira MF, Giudicelli GC, Almeida LGP de, Gerber AL, Guimarães AP de C, Vasconcelos TR, Pereira AC, Pereira L da V, Hünemeier T, Camey SA, Vianna FSL. SARS-CoV-2 strains and clinical profiles of COVID-19 patients in a Southern Brazil hospital [Internet]. Frontiers in Immunology. 2024 ; 15[citado 2025 out. 08 ] Available from: https://doi.org/10.3389/fimmu.2024.1444620
Vancouver
Fam B, Cadore NA, Sbruzzi R, Feira MF, Giudicelli GC, Almeida LGP de, Gerber AL, Guimarães AP de C, Vasconcelos TR, Pereira AC, Pereira L da V, Hünemeier T, Camey SA, Vianna FSL. SARS-CoV-2 strains and clinical profiles of COVID-19 patients in a Southern Brazil hospital [Internet]. Frontiers in Immunology. 2024 ; 15[citado 2025 out. 08 ] Available from: https://doi.org/10.3389/fimmu.2024.1444620
Artigo de periodico
Population-based change-point detection for the identification of homozygosity islands (2023)
Prates, Lucas de Oliveira; Lemes, Renan Barbosa ; Hünemeier, Tábita ; Leonardi, Florencia Graciela
Fonte: Bioinformatics. Unidades: IB, IME
Assunto: BIOINFORMÁTICA
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ABNT
PRATES, Lucas de Oliveira et al. Population-based change-point detection for the identification of homozygosity islands. Bioinformatics, v. 39, n. 4, p. 1-8, 2023Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btad170. Acesso em: 08 out. 2025.
APA
Prates, L. de O., Lemes, R. B., Hünemeier, T., & Leonardi, F. G. (2023). Population-based change-point detection for the identification of homozygosity islands. Bioinformatics, 39( 4), 1-8. doi:10.1093/bioinformatics/btad170
NLM
Prates L de O, Lemes RB, Hünemeier T, Leonardi FG. Population-based change-point detection for the identification of homozygosity islands [Internet]. Bioinformatics. 2023 ; 39( 4): 1-8.[citado 2025 out. 08 ] Available from: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btad170
Vancouver
Prates L de O, Lemes RB, Hünemeier T, Leonardi FG. Population-based change-point detection for the identification of homozygosity islands [Internet]. Bioinformatics. 2023 ; 39( 4): 1-8.[citado 2025 out. 08 ] Available from: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btad170
Monografia/livro
Introdução à bioinformática (2021)
Matioli, Sergio Russo ; Souza, Diego Trindade de
Unidades: IB, Interunidades em Bioinformática
Assuntos: BIOINFORMÁTICA, GENÔMICA, FILOGENIA
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ABNT
MATIOLI, Sergio Russo e SOUZA, Diego Trindade de. Introdução à bioinformática. . Campinas: Editora da UNICAMP. . Acesso em: 08 out. 2025. , 2021
APA
Matioli, S. R., & Souza, D. T. de. (2021). Introdução à bioinformática. Campinas: Editora da UNICAMP.
NLM
Matioli SR, Souza DT de. Introdução à bioinformática. 2021 ;[citado 2025 out. 08 ]
Vancouver
Matioli SR, Souza DT de. Introdução à bioinformática. 2021 ;[citado 2025 out. 08 ]
Trabalho de evento-resumo
The role of host genetic variability in the development and establishment of human gut microbiome diversity (2019)
Palmeira, Ondina Fonseca de Jesus; Matos, Larissa; Naslavsky, Michel ; Bueno, Heloisa; Zatz, Mayana ; Setubal, João Carlos
Fonte: Proceedings. Nome do evento: International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology/AB3C. Unidades: IB, IQ
Assuntos: BIOINFORMÁTICA, GENÉTICA
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ABNT
PALMEIRA, Ondina Fonseca de Jesus et al. The role of host genetic variability in the development and establishment of human gut microbiome diversity. 2019, Anais.. Campos do Jordão: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional/AB3C, 2019. . Acesso em: 08 out. 2025.
APA
Palmeira, O. F. de J., Matos, L., Naslavsky, M., Bueno, H., Zatz, M., & Setubal, J. C. (2019). The role of host genetic variability in the development and establishment of human gut microbiome diversity. In Proceedings. Campos do Jordão: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional/AB3C.
NLM
Palmeira OF de J, Matos L, Naslavsky M, Bueno H, Zatz M, Setubal JC. The role of host genetic variability in the development and establishment of human gut microbiome diversity. Proceedings. 2019 ;[citado 2025 out. 08 ]
Vancouver
Palmeira OF de J, Matos L, Naslavsky M, Bueno H, Zatz M, Setubal JC. The role of host genetic variability in the development and establishment of human gut microbiome diversity. Proceedings. 2019 ;[citado 2025 out. 08 ]
Apresentacao sonora/cenica/entrevista
Genoma da drosófila abriu campo de pesquisa (2017)
Vibranovski, Maria
Fonte: Ciência USP. Núcleo de Divulgação Científica. Unidade: IB
Assuntos: GENES, EVOLUÇÃO, GAMETOGÊNESE, GENOMAS, MUTAÇÃO GENÉTICA, BIOINFORMÁTICA
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ABNT
VIBRANOVSKI, Maria. Genoma da drosófila abriu campo de pesquisa. Ciência USP. Núcleo de Divulgação Científica. São Paulo: Instituto de Biociências, Universidade de São Paulo. . Acesso em: 08 out. 2025. , 2017
APA
Vibranovski, M. (2017). Genoma da drosófila abriu campo de pesquisa. Ciência USP. Núcleo de Divulgação Científica. São Paulo: Instituto de Biociências, Universidade de São Paulo.
NLM
Vibranovski M. Genoma da drosófila abriu campo de pesquisa. Ciência USP. Núcleo de Divulgação Científica. 2017 ;[citado 2025 out. 08 ]
Vancouver
Vibranovski M. Genoma da drosófila abriu campo de pesquisa. Ciência USP. Núcleo de Divulgação Científica. 2017 ;[citado 2025 out. 08 ]
Artigo de jornal-dep/entr
Pesquisa detecta inativação de cromossomo X em embriões humanos. [Depoimento] (2017)
Pereira, Lygia da Veiga ; Vibranovski, Maria
Fonte: Jornal da USP. Unidade: IB
Assuntos: EMBRIÃO, CROMOSSOMO X, CROMOSSOMOS SEXUAIS, MUTAÇÃO GENÉTICA, DOENÇAS HEREDITÁRIAS, EPIGÊNESE GENÉTICA, BIOINFORMÁTICA
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ABNT
PEREIRA, Lygia da Veiga e VIBRANOVSKI, Maria. Pesquisa detecta inativação de cromossomo X em embriões humanos. [Depoimento]. Jornal da USP. São Paulo: Instituto de Biociências, Universidade de São Paulo. Disponível em: http://jornal.usp.br/ciencias/pesquisa-detecta-inativacao-de-cromossomo-x-em-embrioes-humanos/. Acesso em: 08 out. 2025. , 2017
APA
Pereira, L. da V., & Vibranovski, M. (2017). Pesquisa detecta inativação de cromossomo X em embriões humanos. [Depoimento]. Jornal da USP. São Paulo: Instituto de Biociências, Universidade de São Paulo. Recuperado de http://jornal.usp.br/ciencias/pesquisa-detecta-inativacao-de-cromossomo-x-em-embrioes-humanos/
NLM
Pereira L da V, Vibranovski M. Pesquisa detecta inativação de cromossomo X em embriões humanos. [Depoimento] [Internet]. Jornal da USP. 2017 ;[citado 2025 out. 08 ] Available from: http://jornal.usp.br/ciencias/pesquisa-detecta-inativacao-de-cromossomo-x-em-embrioes-humanos/
Vancouver
Pereira L da V, Vibranovski M. Pesquisa detecta inativação de cromossomo X em embriões humanos. [Depoimento] [Internet]. Jornal da USP. 2017 ;[citado 2025 out. 08 ] Available from: http://jornal.usp.br/ciencias/pesquisa-detecta-inativacao-de-cromossomo-x-em-embrioes-humanos/
Artigo de periodico
Inativação do cromossomo X ocorre no início do desenvolvimento embrionário. [Depoimento a Rodrigo de Oliveira Andrade] (2017)
Pereira, Lygia da Veiga
Fonte: Pesquisa FAPESP. Unidade: IB
Assuntos: CROMOSSOMOS SEXUAIS, CROMOSSOMO X, EMBRIÃO, MAMÍFEROS, EXPRESSÃO GÊNICA, CÉLULAS-TRONCO, BIOINFORMÁTICA
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ABNT
PEREIRA, Lygia da Veiga. Inativação do cromossomo X ocorre no início do desenvolvimento embrionário. [Depoimento a Rodrigo de Oliveira Andrade]. Pesquisa FAPESP, 2017Tradução . . Disponível em: http://revistapesquisa.fapesp.br/2017/09/08/inativacao-do-cromossomo-x-ocorre-no-inicio-do-desenvolvimento-embrionario/. Acesso em: 08 out. 2025.
APA
Pereira, L. da V. (2017). Inativação do cromossomo X ocorre no início do desenvolvimento embrionário. [Depoimento a Rodrigo de Oliveira Andrade]. Pesquisa FAPESP. Recuperado de http://revistapesquisa.fapesp.br/2017/09/08/inativacao-do-cromossomo-x-ocorre-no-inicio-do-desenvolvimento-embrionario/
NLM
Pereira L da V. Inativação do cromossomo X ocorre no início do desenvolvimento embrionário. [Depoimento a Rodrigo de Oliveira Andrade] [Internet]. Pesquisa FAPESP. 2017 ;[citado 2025 out. 08 ] Available from: http://revistapesquisa.fapesp.br/2017/09/08/inativacao-do-cromossomo-x-ocorre-no-inicio-do-desenvolvimento-embrionario/
Vancouver
Pereira L da V. Inativação do cromossomo X ocorre no início do desenvolvimento embrionário. [Depoimento a Rodrigo de Oliveira Andrade] [Internet]. Pesquisa FAPESP. 2017 ;[citado 2025 out. 08 ] Available from: http://revistapesquisa.fapesp.br/2017/09/08/inativacao-do-cromossomo-x-ocorre-no-inicio-do-desenvolvimento-embrionario/
Artigo de periodico
Erratum: Adaptive evolution in the toxicity of a spider’s venom enzymes (2016)
Pedroso, Aurélio; Matioli, Sergio Russo ; Murakami, Mário Tyago; Pidde-Queiroz, Giselle; Tambourgi, Denise V
Fonte: BMC Evolutionary Biology. Unidade: IB
Assuntos: TOXINAS, IMUNOQUÍMICA, FOSFOLIPASES, ARANHAS, VENENOS DE ORIGEM ANIMAL, GENÉTICA, BIOINFORMÁTICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
PEDROSO, Aurélio et al. Erratum: Adaptive evolution in the toxicity of a spider’s venom enzymes. BMC Evolutionary Biology, v. 16, p. 1-2, 2016Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1186/s12862-016-0623-2. Acesso em: 08 out. 2025.
APA
Pedroso, A., Matioli, S. R., Murakami, M. T., Pidde-Queiroz, G., & Tambourgi, D. V. (2016). Erratum: Adaptive evolution in the toxicity of a spider’s venom enzymes. BMC Evolutionary Biology, 16, 1-2. doi:10.1186/s12862-016-0623-2
NLM
Pedroso A, Matioli SR, Murakami MT, Pidde-Queiroz G, Tambourgi DV. Erratum: Adaptive evolution in the toxicity of a spider’s venom enzymes [Internet]. BMC Evolutionary Biology. 2016 ; 16 1-2.[citado 2025 out. 08 ] Available from: https://doi.org/10.1186/s12862-016-0623-2
Vancouver
Pedroso A, Matioli SR, Murakami MT, Pidde-Queiroz G, Tambourgi DV. Erratum: Adaptive evolution in the toxicity of a spider’s venom enzymes [Internet]. BMC Evolutionary Biology. 2016 ; 16 1-2.[citado 2025 out. 08 ] Available from: https://doi.org/10.1186/s12862-016-0623-2
Artigo de jornal-dep/entr
Entre a genética e a computação [Depoimento a Aline Naoe] (2015)
Setubal, João Carlos ; Meyer, Diogo
Fonte: Jornal da USP. Unidades: IQ, IB
Assuntos: GENÉTICA, BIOINFORMÁTICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
SETUBAL, João Carlos e MEYER, Diogo. Entre a genética e a computação [Depoimento a Aline Naoe]. Jornal da USP. São Paulo: Instituto de Química, Universidade de São Paulo. Disponível em: http://espaber.uspnet.usp.br/jorusp/?p=46813. Acesso em: 08 out. 2025. , 2015
APA
Setubal, J. C., & Meyer, D. (2015). Entre a genética e a computação [Depoimento a Aline Naoe]. Jornal da USP. São Paulo: Instituto de Química, Universidade de São Paulo. Recuperado de http://espaber.uspnet.usp.br/jorusp/?p=46813
NLM
Setubal JC, Meyer D. Entre a genética e a computação [Depoimento a Aline Naoe] [Internet]. Jornal da USP. 2015 ; 9.[citado 2025 out. 08 ] Available from: http://espaber.uspnet.usp.br/jorusp/?p=46813
Vancouver
Setubal JC, Meyer D. Entre a genética e a computação [Depoimento a Aline Naoe] [Internet]. Jornal da USP. 2015 ; 9.[citado 2025 out. 08 ] Available from: http://espaber.uspnet.usp.br/jorusp/?p=46813
Artigo de periodico
Adaptive evolution in the toxicity of a spider’s venom enzymes (2015)
Pedroso, Aurélio; Matioli, Sergio Russo ; Murakami, Mário Tyago; Pidde-Queiroz, Giselle; Tambourgi, Denise V
Fonte: BMC Evolutionary Biology. Unidade: IB
Assuntos: FILOGENIA, EVOLUÇÃO MOLECULAR, BIOINFORMÁTICA, ENZIMAS, IMUNOQUÍMICA, FOSFOLIPASES, TOXINAS, ARANHAS, VENENOS DE ORIGEM ANIMAL
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
PEDROSO, Aurélio et al. Adaptive evolution in the toxicity of a spider’s venom enzymes. BMC Evolutionary Biology, v. 15, p. 1-16, 2015Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1186/s12862-015-0561-4. Acesso em: 08 out. 2025.
APA
Pedroso, A., Matioli, S. R., Murakami, M. T., Pidde-Queiroz, G., & Tambourgi, D. V. (2015). Adaptive evolution in the toxicity of a spider’s venom enzymes. BMC Evolutionary Biology, 15, 1-16. doi:10.1186/s12862-015-0561-4
NLM
Pedroso A, Matioli SR, Murakami MT, Pidde-Queiroz G, Tambourgi DV. Adaptive evolution in the toxicity of a spider’s venom enzymes [Internet]. BMC Evolutionary Biology. 2015 ; 15 1-16.[citado 2025 out. 08 ] Available from: https://doi.org/10.1186/s12862-015-0561-4
Vancouver
Pedroso A, Matioli SR, Murakami MT, Pidde-Queiroz G, Tambourgi DV. Adaptive evolution in the toxicity of a spider’s venom enzymes [Internet]. BMC Evolutionary Biology. 2015 ; 15 1-16.[citado 2025 out. 08 ] Available from: https://doi.org/10.1186/s12862-015-0561-4
Artigo de periodico
Genome-wide DNA methylation profile of leukocytes from melanoma patients with and without CDKN2A mutations (2014)
Araújo, Érica Sara Souza de; Marchi, Fabio Albuquerque; Rodrigues, Tatiane Cristina; Vieira, Henrique Cursino; Kuasne, Hellen; Achatz, Maria Isabel Waddington; Moredo, Luciana Facure; Sá, Bianca Costa Soares de; Duprat, João Pereira; Brentani, Helena Paula; Rosenberg, Carla ; Carraro, Dirce Maria; Krepischi, Ana Cristina Victorino
Fonte: Experimental and Molecular Pathology. Unidades: FM, IB
Assuntos: MELANOMA, LEUCÓCITOS, MUTAÇÃO GENÉTICA, NEOPLASIAS (GENÉTICA), BIOINFORMÁTICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
ARAÚJO, Érica Sara Souza de et al. Genome-wide DNA methylation profile of leukocytes from melanoma patients with and without CDKN2A mutations. Experimental and Molecular Pathology, v. 97, n. 3, p. 425-432, 2014Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1016/j.yexmp.2014.09.009. Acesso em: 08 out. 2025.
APA
Araújo, É. S. S. de, Marchi, F. A., Rodrigues, T. C., Vieira, H. C., Kuasne, H., Achatz, M. I. W., et al. (2014). Genome-wide DNA methylation profile of leukocytes from melanoma patients with and without CDKN2A mutations. Experimental and Molecular Pathology, 97( 3), 425-432. doi:10.1016/j.yexmp.2014.09.009
NLM
Araújo ÉSS de, Marchi FA, Rodrigues TC, Vieira HC, Kuasne H, Achatz MIW, Moredo LF, Sá BCS de, Duprat JP, Brentani HP, Rosenberg C, Carraro DM, Krepischi ACV. Genome-wide DNA methylation profile of leukocytes from melanoma patients with and without CDKN2A mutations [Internet]. Experimental and Molecular Pathology. 2014 ; 97( 3): 425-432.[citado 2025 out. 08 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.yexmp.2014.09.009
Vancouver
Araújo ÉSS de, Marchi FA, Rodrigues TC, Vieira HC, Kuasne H, Achatz MIW, Moredo LF, Sá BCS de, Duprat JP, Brentani HP, Rosenberg C, Carraro DM, Krepischi ACV. Genome-wide DNA methylation profile of leukocytes from melanoma patients with and without CDKN2A mutations [Internet]. Experimental and Molecular Pathology. 2014 ; 97( 3): 425-432.[citado 2025 out. 08 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.yexmp.2014.09.009
Trabalho de evento
A framework for discrete modeling of juxtacrine signaling systems (2007)
Rozante, Luiz Carlos da Silva ; Gubitoso, Marco Dimas ; Matioli, Sergio Russo
Fonte: Proceedings. Nome do evento: Symposium on Computational Intelligence and Bioinformatics and Computational Biology - CIBCB. Unidades: IME, IB, Interunidades em Bioinformática
Assuntos: BIOINFORMÁTICA, MODELOS MATEMÁTICOS, PROCESSAMENTO DE SINAIS, PROTEÍNAS, CÉLULAS
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
ROZANTE, Luiz Carlos da Silva e GUBITOSO, Marco Dimas e MATIOLI, Sergio Russo. A framework for discrete modeling of juxtacrine signaling systems. 2007, Anais.. Piscataway: IEEE, 2007. Disponível em: https://doi.org/10.1109/CIBCB.2007.4221245. Acesso em: 08 out. 2025.
APA
Rozante, L. C. da S., Gubitoso, M. D., & Matioli, S. R. (2007). A framework for discrete modeling of juxtacrine signaling systems. In Proceedings. Piscataway: IEEE. doi:10.1109/CIBCB.2007.4221245
NLM
Rozante LC da S, Gubitoso MD, Matioli SR. A framework for discrete modeling of juxtacrine signaling systems [Internet]. Proceedings. 2007 ;[citado 2025 out. 08 ] Available from: https://doi.org/10.1109/CIBCB.2007.4221245
Vancouver
Rozante LC da S, Gubitoso MD, Matioli SR. A framework for discrete modeling of juxtacrine signaling systems [Internet]. Proceedings. 2007 ;[citado 2025 out. 08 ] Available from: https://doi.org/10.1109/CIBCB.2007.4221245

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