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  • Dissertação (Mestrado)

    Análise multiparamétrica do problema das fases em cristalografia de proteínas via aprendizado de máquina usando XGBoost - estudo de caso: lisozima de clara de ovo de galinha (2025)

    Jucovski, André Gustavo; Ambrosio, Andre Luis Berteli (Orientador)

    Unidade: IFSC

    Assuntos: CRISTALOGRAFIA, APRENDIZADO COMPUTACIONAL, LISOZIMAS

    Acesso à fonteAcesso à fonteDOIComo citar
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    • ABNT

      JUCOVSKI, André Gustavo. Análise multiparamétrica do problema das fases em cristalografia de proteínas via aprendizado de máquina usando XGBoost - estudo de caso: lisozima de clara de ovo de galinha. 2025. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Carlos, 2025. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76135/tde-28082025-105716/. Acesso em: 02 dez. 2025.

    • APA

      Jucovski, A. G. (2025). Análise multiparamétrica do problema das fases em cristalografia de proteínas via aprendizado de máquina usando XGBoost - estudo de caso: lisozima de clara de ovo de galinha (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Carlos. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76135/tde-28082025-105716/

    • NLM

      Jucovski AG. Análise multiparamétrica do problema das fases em cristalografia de proteínas via aprendizado de máquina usando XGBoost - estudo de caso: lisozima de clara de ovo de galinha [Internet]. 2025 ;[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76135/tde-28082025-105716/

    • Vancouver

      Jucovski AG. Análise multiparamétrica do problema das fases em cristalografia de proteínas via aprendizado de máquina usando XGBoost - estudo de caso: lisozima de clara de ovo de galinha [Internet]. 2025 ;[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76135/tde-28082025-105716/

  • Editor de periodico

    Journal of Biological Chemistry (2025)

    Toker, Alex (Editor); Ambrosio, Andre Luis Berteli (Editor)

    Unidade: IFSC

    Assuntos: BIOLOGIA, QUÍMICA

    Versão PublicadaComo citar
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    • ABNT

      Journal of Biological Chemistry. . New York: Elsevier BV. Disponível em: https://repositorio.usp.br/directbitstream/0dc17af9-b88e-48c3-88fc-ba2a7750f795/PROD037294_3256877.pdf. Acesso em: 02 dez. 2025. , 2025

    • APA

      Journal of Biological Chemistry. (2025). Journal of Biological Chemistry. New York: Elsevier BV. Recuperado de https://repositorio.usp.br/directbitstream/0dc17af9-b88e-48c3-88fc-ba2a7750f795/PROD037294_3256877.pdf

    • NLM

      Journal of Biological Chemistry [Internet]. 2025 ;[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://repositorio.usp.br/directbitstream/0dc17af9-b88e-48c3-88fc-ba2a7750f795/PROD037294_3256877.pdf

    • Vancouver

      Journal of Biological Chemistry [Internet]. 2025 ;[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://repositorio.usp.br/directbitstream/0dc17af9-b88e-48c3-88fc-ba2a7750f795/PROD037294_3256877.pdf

  • Trabalho de evento-resumo

    Integrative structural biology in situ: toward a molecular sociology of GLS filaments in mitochondria (2025)

    Dias, Sandra Martha Gomes ; Ambrosio, Andre Luis Berteli

    Fonte: Book of Abstracts. Nome do evento: Brazilian Crystallographic Association - ABCr. Unidade: IFSC

    Assuntos: MITOCÔNDRIAS, BIOQUÍMICA, CRISTALOGRAFIA, ESTRUTURA MOLECULAR (QUÍMICA TEÓRICA)

    Versão PublicadaComo citar
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    • ABNT

      DIAS, Sandra Martha Gomes e AMBROSIO, Andre Luis Berteli. Integrative structural biology in situ: toward a molecular sociology of GLS filaments in mitochondria. 2025, Anais.. Cordoba: Latin American Crystallographic Association - LACA, 2025. Disponível em: https://repositorio.usp.br/directbitstream/ab48297d-755f-404d-8b64-c761b460ece8/3279609.pdf. Acesso em: 02 dez. 2025.

    • APA

      Dias, S. M. G., & Ambrosio, A. L. B. (2025). Integrative structural biology in situ: toward a molecular sociology of GLS filaments in mitochondria. In Book of Abstracts. Cordoba: Latin American Crystallographic Association - LACA. Recuperado de https://repositorio.usp.br/directbitstream/ab48297d-755f-404d-8b64-c761b460ece8/3279609.pdf

    • NLM

      Dias SMG, Ambrosio ALB. Integrative structural biology in situ: toward a molecular sociology of GLS filaments in mitochondria [Internet]. Book of Abstracts. 2025 ;[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://repositorio.usp.br/directbitstream/ab48297d-755f-404d-8b64-c761b460ece8/3279609.pdf

    • Vancouver

      Dias SMG, Ambrosio ALB. Integrative structural biology in situ: toward a molecular sociology of GLS filaments in mitochondria [Internet]. Book of Abstracts. 2025 ;[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://repositorio.usp.br/directbitstream/ab48297d-755f-404d-8b64-c761b460ece8/3279609.pdf

  • Trabalho de evento-resumo

    Capturing experimental dynamics of human glutamine synthetase by single- particle Cryo-EM and neural Ab initio reconstruction (2025)

    Santillan, Jhon Antoni Vargas ; Machado, Raquel Arminda Martinez ; Owen, David; Silva, Bianca Novaes da; Halabi, Yuan Nahim Chang; Garratt, Richard Charles ; Dias, Sandra Martha Gomes ; Ambrosio, Andre Luis Berteli

    Fonte: Book of Abstracts. Nome do evento: Brazilian Crystallographic Association - ABCr. Unidade: IFSC

    Assuntos: CRISTALOGRAFIA, PLANEJAMENTO DE FÁRMACOS, ESTRUTURA MOLECULAR (QUÍMICA TEÓRICA)

    Versão PublicadaComo citar
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    • ABNT

      SANTILLAN, Jhon Antoni Vargas et al. Capturing experimental dynamics of human glutamine synthetase by single- particle Cryo-EM and neural Ab initio reconstruction. 2025, Anais.. Cordoba: Latin American Crystallographic Association - LACA, 2025. Disponível em: https://repositorio.usp.br/directbitstream/691e85d1-c83c-4479-a5f7-c9d009478fcf/3279796.pdf. Acesso em: 02 dez. 2025.

    • APA

      Santillan, J. A. V., Machado, R. A. M., Owen, D., Silva, B. N. da, Halabi, Y. N. C., Garratt, R. C., et al. (2025). Capturing experimental dynamics of human glutamine synthetase by single- particle Cryo-EM and neural Ab initio reconstruction. In Book of Abstracts. Cordoba: Latin American Crystallographic Association - LACA. Recuperado de https://repositorio.usp.br/directbitstream/691e85d1-c83c-4479-a5f7-c9d009478fcf/3279796.pdf

    • NLM

      Santillan JAV, Machado RAM, Owen D, Silva BN da, Halabi YNC, Garratt RC, Dias SMG, Ambrosio ALB. Capturing experimental dynamics of human glutamine synthetase by single- particle Cryo-EM and neural Ab initio reconstruction [Internet]. Book of Abstracts. 2025 ;[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://repositorio.usp.br/directbitstream/691e85d1-c83c-4479-a5f7-c9d009478fcf/3279796.pdf

    • Vancouver

      Santillan JAV, Machado RAM, Owen D, Silva BN da, Halabi YNC, Garratt RC, Dias SMG, Ambrosio ALB. Capturing experimental dynamics of human glutamine synthetase by single- particle Cryo-EM and neural Ab initio reconstruction [Internet]. Book of Abstracts. 2025 ;[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://repositorio.usp.br/directbitstream/691e85d1-c83c-4479-a5f7-c9d009478fcf/3279796.pdf

  • Artigo de periodico

    Architecture and regulation of filamentous human cystathionine beta-synthase (2024)

    McCorvie, Thomas James ; Adamoski, Douglas ; Machado, Raquel Arminda Carvalho ; Tang, Jiazhi; Bailey, Henry J.; Ferreira, Douglas Sales Medina; Strain-Damerell, Claire ; Baslé, Arnaud ; Ambrosio, Andre Luis Berteli ; Dias, Sandra Martha Gomes ; Yue, Wyatt W.

    Fonte: Nature Communications. Unidade: IFSC

    Assuntos: CRISTALOGRAFIA, BIOQUÍMICA

    Versão PublicadaAcesso à fonteDOIComo citar
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      MCCORVIE, Thomas James et al. Architecture and regulation of filamentous human cystathionine beta-synthase. Nature Communications, v. 15, p. 2931-1-2931-14, 2024Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1038/s41467-024-46864-x. Acesso em: 02 dez. 2025.

    • APA

      McCorvie, T. J., Adamoski, D., Machado, R. A. C., Tang, J., Bailey, H. J., Ferreira, D. S. M., et al. (2024). Architecture and regulation of filamentous human cystathionine beta-synthase. Nature Communications, 15, 2931-1-2931-14. doi:10.1038/s41467-024-46864-x

    • NLM

      McCorvie TJ, Adamoski D, Machado RAC, Tang J, Bailey HJ, Ferreira DSM, Strain-Damerell C, Baslé A, Ambrosio ALB, Dias SMG, Yue WW. Architecture and regulation of filamentous human cystathionine beta-synthase [Internet]. Nature Communications. 2024 ; 15 2931-1-2931-14.[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://doi.org/10.1038/s41467-024-46864-x

    • Vancouver

      McCorvie TJ, Adamoski D, Machado RAC, Tang J, Bailey HJ, Ferreira DSM, Strain-Damerell C, Baslé A, Ambrosio ALB, Dias SMG, Yue WW. Architecture and regulation of filamentous human cystathionine beta-synthase [Internet]. Nature Communications. 2024 ; 15 2931-1-2931-14.[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://doi.org/10.1038/s41467-024-46864-x

  • Trabalho de evento-resumo

    Analysis of glutamine synthetase and aldehyde dehydrogenase 2 aggregation in response to nutritional stress (2024)

    Casal, Thaís Fontes Milz; Santillan, Jhon Antoni Vargas ; Ambrosio, Andre Luis Berteli ; Dias, Sandra Martha Gomes ; Machado, Raquel Arminda Carvalho

    Fonte: Anais. Nome do evento: Congresso Brasileiro de Biologia Celular. Unidade: IFSC

    Assuntos: ENZIMAS, NEOPLASIAS, BIOQUÍMICA

    PrivadoAcesso à fonteComo citar
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      CASAL, Thaís Fontes Milz et al. Analysis of glutamine synthetase and aldehyde dehydrogenase 2 aggregation in response to nutritional stress. 2024, Anais.. São Paulo: Sociedade Brasileira de Biologia Celular - SBBC, 2024. Disponível em: https://www.sbbc-congress.com.br/wp-content/uploads/2024/10/1729015730_anais_finalizado_-_Marisa_Ionta.pdf. Acesso em: 02 dez. 2025.

    • APA

      Casal, T. F. M., Santillan, J. A. V., Ambrosio, A. L. B., Dias, S. M. G., & Machado, R. A. C. (2024). Analysis of glutamine synthetase and aldehyde dehydrogenase 2 aggregation in response to nutritional stress. In Anais. São Paulo: Sociedade Brasileira de Biologia Celular - SBBC. Recuperado de https://www.sbbc-congress.com.br/wp-content/uploads/2024/10/1729015730_anais_finalizado_-_Marisa_Ionta.pdf

    • NLM

      Casal TFM, Santillan JAV, Ambrosio ALB, Dias SMG, Machado RAC. Analysis of glutamine synthetase and aldehyde dehydrogenase 2 aggregation in response to nutritional stress [Internet]. Anais. 2024 ;[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://www.sbbc-congress.com.br/wp-content/uploads/2024/10/1729015730_anais_finalizado_-_Marisa_Ionta.pdf

    • Vancouver

      Casal TFM, Santillan JAV, Ambrosio ALB, Dias SMG, Machado RAC. Analysis of glutamine synthetase and aldehyde dehydrogenase 2 aggregation in response to nutritional stress [Internet]. Anais. 2024 ;[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://www.sbbc-congress.com.br/wp-content/uploads/2024/10/1729015730_anais_finalizado_-_Marisa_Ionta.pdf

  • Trabalho de evento-resumo

    Elucidação estrutural e funcional dos mecanismos de auto-montagem de enzimas metabólicas humanas e suas implicações na regulação metabólica (2024)

    Santillan, Jhon Antoni Vargas ; Machado, Raquel Arminda Martinez; Garratt, Richard Charles ; Dias, Sandra Martha Gomes ; Ambrosio, Andre Luis Berteli

    Fonte: Livro de Resumos. Nome do evento: Semana Integrada do Instituto de Física de São Carlos - SIFSC. Unidade: IFSC

    Assuntos: ENZIMAS, BIOFÍSICA, METABOLISMO CELULAR

    Versão PublicadaComo citar
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      SANTILLAN, Jhon Antoni Vargas et al. Elucidação estrutural e funcional dos mecanismos de auto-montagem de enzimas metabólicas humanas e suas implicações na regulação metabólica. 2024, Anais.. São Carlos: Instituto de Física de São Carlos - IFSC, 2024. Disponível em: https://repositorio.usp.br/directbitstream/06d37a28-b5de-4378-8693-c51ab3b2a0c9/3229697.pdf. Acesso em: 02 dez. 2025.

    • APA

      Santillan, J. A. V., Machado, R. A. M., Garratt, R. C., Dias, S. M. G., & Ambrosio, A. L. B. (2024). Elucidação estrutural e funcional dos mecanismos de auto-montagem de enzimas metabólicas humanas e suas implicações na regulação metabólica. In Livro de Resumos. São Carlos: Instituto de Física de São Carlos - IFSC. Recuperado de https://repositorio.usp.br/directbitstream/06d37a28-b5de-4378-8693-c51ab3b2a0c9/3229697.pdf

    • NLM

      Santillan JAV, Machado RAM, Garratt RC, Dias SMG, Ambrosio ALB. Elucidação estrutural e funcional dos mecanismos de auto-montagem de enzimas metabólicas humanas e suas implicações na regulação metabólica [Internet]. Livro de Resumos. 2024 ;[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://repositorio.usp.br/directbitstream/06d37a28-b5de-4378-8693-c51ab3b2a0c9/3229697.pdf

    • Vancouver

      Santillan JAV, Machado RAM, Garratt RC, Dias SMG, Ambrosio ALB. Elucidação estrutural e funcional dos mecanismos de auto-montagem de enzimas metabólicas humanas e suas implicações na regulação metabólica [Internet]. Livro de Resumos. 2024 ;[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://repositorio.usp.br/directbitstream/06d37a28-b5de-4378-8693-c51ab3b2a0c9/3229697.pdf

  • Trabalho de evento-resumo

    Análise multiparamétrica do problema de fases em cristalografia de proteínas por aprendizado de máquina -caso de estudo:: lisozima da clara do ovo de galinha (2024)

    Jucovski, André Gustavo; Ambrosio, Andre Luis Berteli

    Fonte: Livro de Resumos. Nome do evento: Semana Integrada do Instituto de Física de São Carlos - SIFSC. Unidade: IFSC

    Assuntos: LISOZIMAS, CRISTALOGRAFIA, APRENDIZADO COMPUTACIONAL

    Versão PublicadaComo citar
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      JUCOVSKI, André Gustavo e AMBROSIO, Andre Luis Berteli. Análise multiparamétrica do problema de fases em cristalografia de proteínas por aprendizado de máquina -caso de estudo:: lisozima da clara do ovo de galinha. 2024, Anais.. São Carlos: Instituto de Física de São Carlos - IFSC, 2024. Disponível em: https://repositorio.usp.br/directbitstream/27056f8e-a644-40c5-9779-d8dc8cdbc086/PROD036725_3232195.pdf. Acesso em: 02 dez. 2025.

    • APA

      Jucovski, A. G., & Ambrosio, A. L. B. (2024). Análise multiparamétrica do problema de fases em cristalografia de proteínas por aprendizado de máquina -caso de estudo:: lisozima da clara do ovo de galinha. In Livro de Resumos. São Carlos: Instituto de Física de São Carlos - IFSC. Recuperado de https://repositorio.usp.br/directbitstream/27056f8e-a644-40c5-9779-d8dc8cdbc086/PROD036725_3232195.pdf

    • NLM

      Jucovski AG, Ambrosio ALB. Análise multiparamétrica do problema de fases em cristalografia de proteínas por aprendizado de máquina -caso de estudo:: lisozima da clara do ovo de galinha [Internet]. Livro de Resumos. 2024 ;[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://repositorio.usp.br/directbitstream/27056f8e-a644-40c5-9779-d8dc8cdbc086/PROD036725_3232195.pdf

    • Vancouver

      Jucovski AG, Ambrosio ALB. Análise multiparamétrica do problema de fases em cristalografia de proteínas por aprendizado de máquina -caso de estudo:: lisozima da clara do ovo de galinha [Internet]. Livro de Resumos. 2024 ;[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://repositorio.usp.br/directbitstream/27056f8e-a644-40c5-9779-d8dc8cdbc086/PROD036725_3232195.pdf

  • Trabalho de evento-resumo

    Single-particle analysis and in situ cryo-ET: glutaminase filaments as a case study and an emerging opportunity in South America. (2024)

    Ambrosio, Andre Luis Berteli

    Fonte: Abstract Book. Nome do evento: Annual Meeting Chilean Society of Biochemistry and Molecular Biology. Unidade: IFSC

    Assuntos: ENZIMAS, BIOQUÍMICA, CRISTALOGRAFIA

    PrivadoComo citar
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      AMBROSIO, Andre Luis Berteli. Single-particle analysis and in situ cryo-ET: glutaminase filaments as a case study and an emerging opportunity in South America. 2024, Anais.. Providencia: Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular - SBBM, 2024. Disponível em: https://repositorio.usp.br/directbitstream/a5c165b2-2d63-4426-befa-f95a2308f010/PROD037103_3246511.pdf. Acesso em: 02 dez. 2025.

    • APA

      Ambrosio, A. L. B. (2024). Single-particle analysis and in situ cryo-ET: glutaminase filaments as a case study and an emerging opportunity in South America. In Abstract Book. Providencia: Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular - SBBM. Recuperado de https://repositorio.usp.br/directbitstream/a5c165b2-2d63-4426-befa-f95a2308f010/PROD037103_3246511.pdf

    • NLM

      Ambrosio ALB. Single-particle analysis and in situ cryo-ET: glutaminase filaments as a case study and an emerging opportunity in South America. [Internet]. Abstract Book. 2024 ;[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://repositorio.usp.br/directbitstream/a5c165b2-2d63-4426-befa-f95a2308f010/PROD037103_3246511.pdf

    • Vancouver

      Ambrosio ALB. Single-particle analysis and in situ cryo-ET: glutaminase filaments as a case study and an emerging opportunity in South America. [Internet]. Abstract Book. 2024 ;[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://repositorio.usp.br/directbitstream/a5c165b2-2d63-4426-befa-f95a2308f010/PROD037103_3246511.pdf

  • Trabalho de evento-resumo

    Dynamic aggregation of human phosphoribosyl pyrophosphate synthetase reveals metabolic adaptation to nutrient stress (2024)

    Machado, Raquel Arminda Martinez ; Casal, Thaís Fontes Milz; Ambrosio, Andre Luis Berteli ; Dias, Sandra Martha Gomes

    Fonte: Anais. Nome do evento: Congresso Brasileiro de Biologia Celular. Unidade: IFSC

    Assuntos: ENZIMAS, NEOPLASIAS, BIOQUÍMICA

    PrivadoAcesso à fonteComo citar
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      MACHADO, Raquel Arminda Martinez et al. Dynamic aggregation of human phosphoribosyl pyrophosphate synthetase reveals metabolic adaptation to nutrient stress. 2024, Anais.. São Paulo: Sociedade Brasileira de Biologia Celular - SBBC, 2024. Disponível em: https://www.sbbc-congress.com.br/wp-content/uploads/2024/10/1729015730_anais_finalizado_-_Marisa_Ionta.pdf. Acesso em: 02 dez. 2025.

    • APA

      Machado, R. A. M., Casal, T. F. M., Ambrosio, A. L. B., & Dias, S. M. G. (2024). Dynamic aggregation of human phosphoribosyl pyrophosphate synthetase reveals metabolic adaptation to nutrient stress. In Anais. São Paulo: Sociedade Brasileira de Biologia Celular - SBBC. Recuperado de https://www.sbbc-congress.com.br/wp-content/uploads/2024/10/1729015730_anais_finalizado_-_Marisa_Ionta.pdf

    • NLM

      Machado RAM, Casal TFM, Ambrosio ALB, Dias SMG. Dynamic aggregation of human phosphoribosyl pyrophosphate synthetase reveals metabolic adaptation to nutrient stress [Internet]. Anais. 2024 ;[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://www.sbbc-congress.com.br/wp-content/uploads/2024/10/1729015730_anais_finalizado_-_Marisa_Ionta.pdf

    • Vancouver

      Machado RAM, Casal TFM, Ambrosio ALB, Dias SMG. Dynamic aggregation of human phosphoribosyl pyrophosphate synthetase reveals metabolic adaptation to nutrient stress [Internet]. Anais. 2024 ;[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://www.sbbc-congress.com.br/wp-content/uploads/2024/10/1729015730_anais_finalizado_-_Marisa_Ionta.pdf

  • Artigo de periodico

    Structural insights into a functional unit from an immunogenic mollusk hemocyanin (2024)

    Muñoz, Sebastián Manuel; Baccelliere, Gabriel Vallejos; Manubens, Augusto; Salazar, Michelle L.; Nascimento, Andrey Fabricio Ziem ; Reyes , Patricio Tapi ; Meneses , Claudio ; Ambrosio, Andre Luis Berteli ; Becker, María Inés; Guixé, Victoria; Fernandez, Victor Castro

    Fonte: Structure. Unidade: IFSC

    Assuntos: CRISTALOGRAFIA, BIOQUÍMICA, PROTEÍNAS, NEOPLASIAS

    PrivadoAcesso à fonteDOIComo citar
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      MUÑOZ, Sebastián Manuel et al. Structural insights into a functional unit from an immunogenic mollusk hemocyanin. Structure, v. 32, n. 6, p. 812-823 + supplemental information, 2024Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1016/j.str.2024.02.018. Acesso em: 02 dez. 2025.

    • APA

      Muñoz, S. M., Baccelliere, G. V., Manubens, A., Salazar, M. L., Nascimento, A. F. Z., Reyes , P. T., et al. (2024). Structural insights into a functional unit from an immunogenic mollusk hemocyanin. Structure, 32( 6), 812-823 + supplemental information. doi:10.1016/j.str.2024.02.018

    • NLM

      Muñoz SM, Baccelliere GV, Manubens A, Salazar ML, Nascimento AFZ, Reyes PT, Meneses C, Ambrosio ALB, Becker MI, Guixé V, Fernandez VC. Structural insights into a functional unit from an immunogenic mollusk hemocyanin [Internet]. Structure. 2024 ; 32( 6): 812-823 + supplemental information.[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.str.2024.02.018

    • Vancouver

      Muñoz SM, Baccelliere GV, Manubens A, Salazar ML, Nascimento AFZ, Reyes PT, Meneses C, Ambrosio ALB, Becker MI, Guixé V, Fernandez VC. Structural insights into a functional unit from an immunogenic mollusk hemocyanin [Internet]. Structure. 2024 ; 32( 6): 812-823 + supplemental information.[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.str.2024.02.018

  • Trabalho de evento-resumo

    Análise multiparamétrica do problema de fases em cristalografia de proteínas por aprendizado de máquina - caso de estudo: lisozima da clara do ovo de galinha (2023)

    Jucovski, André Gustavo; Ambrosio, Andre Luis Berteli

    Fonte: Livro de Resumos. Nome do evento: Semana Integrada do Instituto de Física de São Carlos - SIFSC. Unidade: IFSC

    Assuntos: LISOZIMAS, CRISTALOGRAFIA, APRENDIZADO COMPUTACIONAL

    Versão PublicadaComo citar
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    • ABNT

      JUCOVSKI, André Gustavo e AMBROSIO, Andre Luis Berteli. Análise multiparamétrica do problema de fases em cristalografia de proteínas por aprendizado de máquina - caso de estudo: lisozima da clara do ovo de galinha. 2023, Anais.. São Carlos: Instituto de Física de São Carlos - IFSC, 2023. Disponível em: https://repositorio.usp.br/directbitstream/b8e937df-fe7b-4eae-81cf-b8524134a016/PROD035566_3180431.pdf. Acesso em: 02 dez. 2025.

    • APA

      Jucovski, A. G., & Ambrosio, A. L. B. (2023). Análise multiparamétrica do problema de fases em cristalografia de proteínas por aprendizado de máquina - caso de estudo: lisozima da clara do ovo de galinha. In Livro de Resumos. São Carlos: Instituto de Física de São Carlos - IFSC. Recuperado de https://repositorio.usp.br/directbitstream/b8e937df-fe7b-4eae-81cf-b8524134a016/PROD035566_3180431.pdf

    • NLM

      Jucovski AG, Ambrosio ALB. Análise multiparamétrica do problema de fases em cristalografia de proteínas por aprendizado de máquina - caso de estudo: lisozima da clara do ovo de galinha [Internet]. Livro de Resumos. 2023 ;[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://repositorio.usp.br/directbitstream/b8e937df-fe7b-4eae-81cf-b8524134a016/PROD035566_3180431.pdf

    • Vancouver

      Jucovski AG, Ambrosio ALB. Análise multiparamétrica do problema de fases em cristalografia de proteínas por aprendizado de máquina - caso de estudo: lisozima da clara do ovo de galinha [Internet]. Livro de Resumos. 2023 ;[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://repositorio.usp.br/directbitstream/b8e937df-fe7b-4eae-81cf-b8524134a016/PROD035566_3180431.pdf

  • Artigo de periodico

    Discovery of aminothiazole derivatives as a chemical scaffold for glutaminase inhibition (2023)

    Costa, Renna Karoline Eloi; Brancaglion, Guilherme Andrade; Pinheiro, Matheus Pinto; Meira, Douglas Adamoski ; Silva, Bianca Novaes da; Negrão, Cyro von Zuben de Valega ; Gonçalves, Kaliandra de Almeida; Rodrigues, Camila Tanimoto; Ambrosio, Andre Luis Berteli ; Guido, Rafael Victorio Carvalho ; Pastre, Julio Cezar; Dias, Sandra Martha Gomes

    Fonte: Results in Chemistry. Unidade: IFSC

    Assuntos: GLUTAMINA, METABOLISMO CELULAR, NEOPLASIAS MAMÁRIAS

    Versão PublicadaAcesso à fonteDOIComo citar
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    • ABNT

      COSTA, Renna Karoline Eloi et al. Discovery of aminothiazole derivatives as a chemical scaffold for glutaminase inhibition. Results in Chemistry, v. 5, n. Ja 2023, p. 100842-1-100842-17 + supplementary data: S1-S54, 2023Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1016/j.rechem.2023.100842. Acesso em: 02 dez. 2025.

    • APA

      Costa, R. K. E., Brancaglion, G. A., Pinheiro, M. P., Meira, D. A., Silva, B. N. da, Negrão, C. von Z. de V., et al. (2023). Discovery of aminothiazole derivatives as a chemical scaffold for glutaminase inhibition. Results in Chemistry, 5( Ja 2023), 100842-1-100842-17 + supplementary data: S1-S54. doi:10.1016/j.rechem.2023.100842

    • NLM

      Costa RKE, Brancaglion GA, Pinheiro MP, Meira DA, Silva BN da, Negrão C von Z de V, Gonçalves K de A, Rodrigues CT, Ambrosio ALB, Guido RVC, Pastre JC, Dias SMG. Discovery of aminothiazole derivatives as a chemical scaffold for glutaminase inhibition [Internet]. Results in Chemistry. 2023 ; 5( Ja 2023): 100842-1-100842-17 + supplementary data: S1-S54.[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.rechem.2023.100842

    • Vancouver

      Costa RKE, Brancaglion GA, Pinheiro MP, Meira DA, Silva BN da, Negrão C von Z de V, Gonçalves K de A, Rodrigues CT, Ambrosio ALB, Guido RVC, Pastre JC, Dias SMG. Discovery of aminothiazole derivatives as a chemical scaffold for glutaminase inhibition [Internet]. Results in Chemistry. 2023 ; 5( Ja 2023): 100842-1-100842-17 + supplementary data: S1-S54.[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://doi.org/10.1016/j.rechem.2023.100842

  • Dissertação (Mestrado)

    Structural determination, by cryo-EM, of the hemocyanin from the mollusk Concholepas concholepas with substantial biomedical impact (2023)

    Ellena, Matías Nahuel; Ambrosio, Andre Luis Berteli (Orientador)

    Unidade: IFSC

    Assuntos: MICROSCOPIA ELETRÔNICA, PROTEÍNAS, ADJUVANTES IMUNOLÓGICOS

    Acesso à fonteAcesso à fonteDOIComo citar
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    • ABNT

      ELLENA, Matías Nahuel. Structural determination, by cryo-EM, of the hemocyanin from the mollusk Concholepas concholepas with substantial biomedical impact. 2023. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Carlos, 2023. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76133/tde-06032024-085323/. Acesso em: 02 dez. 2025.

    • APA

      Ellena, M. N. (2023). Structural determination, by cryo-EM, of the hemocyanin from the mollusk Concholepas concholepas with substantial biomedical impact (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Carlos. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76133/tde-06032024-085323/

    • NLM

      Ellena MN. Structural determination, by cryo-EM, of the hemocyanin from the mollusk Concholepas concholepas with substantial biomedical impact [Internet]. 2023 ;[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76133/tde-06032024-085323/

    • Vancouver

      Ellena MN. Structural determination, by cryo-EM, of the hemocyanin from the mollusk Concholepas concholepas with substantial biomedical impact [Internet]. 2023 ;[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76133/tde-06032024-085323/

  • Trabalho de evento-resumo

    Identification of new metabolic enzymes with filament capacity defined by transmission electron microscopy (2023)

    Garratt, Richard Charles ; Dias, Sandra Martha Gomes ; Ambrosio, Andre Luis Berteli ; Santillan, Jhon Antoni Vargas ; Machado, Raquel Arminda Martinez

    Fonte: Livro de Resumos. Nome do evento: Semana Integrada do Instituto de Física de São Carlos - SIFSC. Unidade: IFSC

    Assuntos: CRISTALOGRAFIA, ENZIMAS, PROTEÍNAS, FILAMENTOS CITOPLASMÁTICOS

    Versão PublicadaComo citar
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    • ABNT

      GARRATT, Richard Charles et al. Identification of new metabolic enzymes with filament capacity defined by transmission electron microscopy. 2023, Anais.. São Carlos: Instituto de Física de São Carlos - IFSC, 2023. Disponível em: https://repositorio.usp.br/directbitstream/a3274269-eeb6-4098-99ae-d2a0bef93b59/3180747.pdf. Acesso em: 02 dez. 2025.

    • APA

      Garratt, R. C., Dias, S. M. G., Ambrosio, A. L. B., Santillan, J. A. V., & Machado, R. A. M. (2023). Identification of new metabolic enzymes with filament capacity defined by transmission electron microscopy. In Livro de Resumos. São Carlos: Instituto de Física de São Carlos - IFSC. Recuperado de https://repositorio.usp.br/directbitstream/a3274269-eeb6-4098-99ae-d2a0bef93b59/3180747.pdf

    • NLM

      Garratt RC, Dias SMG, Ambrosio ALB, Santillan JAV, Machado RAM. Identification of new metabolic enzymes with filament capacity defined by transmission electron microscopy [Internet]. Livro de Resumos. 2023 ;[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://repositorio.usp.br/directbitstream/a3274269-eeb6-4098-99ae-d2a0bef93b59/3180747.pdf

    • Vancouver

      Garratt RC, Dias SMG, Ambrosio ALB, Santillan JAV, Machado RAM. Identification of new metabolic enzymes with filament capacity defined by transmission electron microscopy [Internet]. Livro de Resumos. 2023 ;[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://repositorio.usp.br/directbitstream/a3274269-eeb6-4098-99ae-d2a0bef93b59/3180747.pdf

  • Trabalho de evento-resumo

    Biologia estrutural do carreador mitocondrial de piruvato humano (MPC), proteína-chave no metabolismo de glicose e na adaptação metabólica tumoral (2023)

    Delphito, Leonardo; Ambrosio, Andre Luis Berteli

    Fonte: Livro de Resumos. Nome do evento: Semana Integrada do Instituto de Física de São Carlos - SIFSC. Unidade: IFSC

    Assuntos: METABOLISMO CELULAR, CRISTALOGRAFIA, BIOQUÍMICA, PROTEÍNAS

    Versão PublicadaComo citar
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      DELPHITO, Leonardo e AMBROSIO, Andre Luis Berteli. Biologia estrutural do carreador mitocondrial de piruvato humano (MPC), proteína-chave no metabolismo de glicose e na adaptação metabólica tumoral. 2023, Anais.. São Carlos: Instituto de Física de São Carlos - IFSC, 2023. Disponível em: https://repositorio.usp.br/directbitstream/8d70d812-9aa8-4fae-ae86-a27b1d253fa5/3180406_Inserir_REP.pdf. Acesso em: 02 dez. 2025.

    • APA

      Delphito, L., & Ambrosio, A. L. B. (2023). Biologia estrutural do carreador mitocondrial de piruvato humano (MPC), proteína-chave no metabolismo de glicose e na adaptação metabólica tumoral. In Livro de Resumos. São Carlos: Instituto de Física de São Carlos - IFSC. Recuperado de https://repositorio.usp.br/directbitstream/8d70d812-9aa8-4fae-ae86-a27b1d253fa5/3180406_Inserir_REP.pdf

    • NLM

      Delphito L, Ambrosio ALB. Biologia estrutural do carreador mitocondrial de piruvato humano (MPC), proteína-chave no metabolismo de glicose e na adaptação metabólica tumoral [Internet]. Livro de Resumos. 2023 ;[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://repositorio.usp.br/directbitstream/8d70d812-9aa8-4fae-ae86-a27b1d253fa5/3180406_Inserir_REP.pdf

    • Vancouver

      Delphito L, Ambrosio ALB. Biologia estrutural do carreador mitocondrial de piruvato humano (MPC), proteína-chave no metabolismo de glicose e na adaptação metabólica tumoral [Internet]. Livro de Resumos. 2023 ;[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://repositorio.usp.br/directbitstream/8d70d812-9aa8-4fae-ae86-a27b1d253fa5/3180406_Inserir_REP.pdf

  • Artigo de periodico

    Molecular mechanism of glutaminase activation through filamentation and the role of filaments in mitophagy protection (2023)

    Meira, Douglas Adamoski ; Dias, Marília Meira ; Quesñay, José Edwin Neciosup; Yang, Zhengyi; Zagoriy, Ievgeniia ; Steyer, Anna M. ; Rodrigues, Camila Tanimoto; Bastos, Alliny Cristiny da Silva ; Silva, Bianca Novaes da ; Costa, Renna Karoline Eloi ; Abreu, Flávia Mayumi Odahara de ; Islam, Zeyaul ; Cassago, Alexandre ; van Heel, Marin Gerard; Consonni, Sílvio Roberto ; Mattei, Simone ; Mahamid, Julia ; Portugal, Rodrigo Villares; Ambrosio, Andre Luis Berteli ; Dias, Sandra Martha Gomes

    Fonte: Nature Structural and Molecular Biology. Unidades: IFSC, IQ

    Assuntos: GLUTAMINA, METABOLISMO CELULAR, MACROMOLÉCULAS NATURAIS

    PrivadoAcesso à fonteDOIComo citar
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      MEIRA, Douglas Adamoski et al. Molecular mechanism of glutaminase activation through filamentation and the role of filaments in mitophagy protection. Nature Structural and Molecular Biology, v. 30, p. 1902-1912 + supplementary information, 2023Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1038/s41594-023-01118-0. Acesso em: 02 dez. 2025.

    • APA

      Meira, D. A., Dias, M. M., Quesñay, J. E. N., Yang, Z., Zagoriy, I., Steyer, A. M., et al. (2023). Molecular mechanism of glutaminase activation through filamentation and the role of filaments in mitophagy protection. Nature Structural and Molecular Biology, 30, 1902-1912 + supplementary information. doi:10.1038/s41594-023-01118-0

    • NLM

      Meira DA, Dias MM, Quesñay JEN, Yang Z, Zagoriy I, Steyer AM, Rodrigues CT, Bastos AC da S, Silva BN da, Costa RKE, Abreu FMO de, Islam Z, Cassago A, van Heel MG, Consonni SR, Mattei S, Mahamid J, Portugal RV, Ambrosio ALB, Dias SMG. Molecular mechanism of glutaminase activation through filamentation and the role of filaments in mitophagy protection [Internet]. Nature Structural and Molecular Biology. 2023 ; 30 1902-1912 + supplementary information.[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://doi.org/10.1038/s41594-023-01118-0

    • Vancouver

      Meira DA, Dias MM, Quesñay JEN, Yang Z, Zagoriy I, Steyer AM, Rodrigues CT, Bastos AC da S, Silva BN da, Costa RKE, Abreu FMO de, Islam Z, Cassago A, van Heel MG, Consonni SR, Mattei S, Mahamid J, Portugal RV, Ambrosio ALB, Dias SMG. Molecular mechanism of glutaminase activation through filamentation and the role of filaments in mitophagy protection [Internet]. Nature Structural and Molecular Biology. 2023 ; 30 1902-1912 + supplementary information.[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://doi.org/10.1038/s41594-023-01118-0

  • Trabalho de evento-resumo

    Megaproteínas: determinación estructural por cryo-em de una hemocianina de molusco de 8 MDA con impacto biomédico substancial (2023)

    Ellena, Matias Nahuel; Muñoz, Sebastián Manuel; Fernández, Víctor Castro; Leguia, Victoria Cristina Guixe; Ambrosio, Andre Luis Berteli

    Fonte: Livro de resúmenes. Nome do evento: Reunión Anual de la Asociación Argentina de Cristalografía. Unidade: IFSC

    Assuntos: CRISTALOGRAFIA, BIOQUÍMICA, PROTEÍNAS

    PrivadoAcesso à fonteComo citar
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      ELLENA, Matias Nahuel et al. Megaproteínas: determinación estructural por cryo-em de una hemocianina de molusco de 8 MDA con impacto biomédico substancial. 2023, Anais.. Mar del Plata: Instituto de Investigaciones en Ciencia y Tecnología de Materiales - INTEMA, 2023. Disponível em: http://intema.gob.ar/aacr2023/assets/files/libro-de-resumenes.pdf. Acesso em: 02 dez. 2025.

    • APA

      Ellena, M. N., Muñoz, S. M., Fernández, V. C., Leguia, V. C. G., & Ambrosio, A. L. B. (2023). Megaproteínas: determinación estructural por cryo-em de una hemocianina de molusco de 8 MDA con impacto biomédico substancial. In Livro de resúmenes. Mar del Plata: Instituto de Investigaciones en Ciencia y Tecnología de Materiales - INTEMA. Recuperado de http://intema.gob.ar/aacr2023/assets/files/libro-de-resumenes.pdf

    • NLM

      Ellena MN, Muñoz SM, Fernández VC, Leguia VCG, Ambrosio ALB. Megaproteínas: determinación estructural por cryo-em de una hemocianina de molusco de 8 MDA con impacto biomédico substancial [Internet]. Livro de resúmenes. 2023 ;[citado 2025 dez. 02 ] Available from: http://intema.gob.ar/aacr2023/assets/files/libro-de-resumenes.pdf

    • Vancouver

      Ellena MN, Muñoz SM, Fernández VC, Leguia VCG, Ambrosio ALB. Megaproteínas: determinación estructural por cryo-em de una hemocianina de molusco de 8 MDA con impacto biomédico substancial [Internet]. Livro de resúmenes. 2023 ;[citado 2025 dez. 02 ] Available from: http://intema.gob.ar/aacr2023/assets/files/libro-de-resumenes.pdf

  • Dissertação (Mestrado)

    Prospecting the interaction interface in the polymerization process of the enzyme glutaminase C (2023)

    Abreu, Flávia Mayumi Odahara de; Ambrosio, Andre Luis Berteli (Orientador)

    Unidade: IFSC

    Assuntos: GLUTAMINA, NEOPLASIAS, ENZIMAS, BIOLOGIA

    Acesso à fonteAcesso à fonteDOIComo citar
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      ABREU, Flávia Mayumi Odahara de. Prospecting the interaction interface in the polymerization process of the enzyme glutaminase C. 2023. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Carlos, 2023. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76133/tde-26012024-104256/. Acesso em: 02 dez. 2025.

    • APA

      Abreu, F. M. O. de. (2023). Prospecting the interaction interface in the polymerization process of the enzyme glutaminase C (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Carlos. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76133/tde-26012024-104256/

    • NLM

      Abreu FMO de. Prospecting the interaction interface in the polymerization process of the enzyme glutaminase C [Internet]. 2023 ;[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76133/tde-26012024-104256/

    • Vancouver

      Abreu FMO de. Prospecting the interaction interface in the polymerization process of the enzyme glutaminase C [Internet]. 2023 ;[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76133/tde-26012024-104256/

  • Trabalho de evento-resumo

    Mega Protein: Cryo-EM structural determination a 8 MDa molluscan hemocyanin with substantial biomedic impact (2023)

    Ellena, Matias Nahuel; Fernández, Víctor Castro; Ambrosio, Andre Luis Berteli ; Leguia, Victoria Cristina Guixe; Muñoz, Sebastián Manuel

    Fonte: Livro de Resumos. Nome do evento: Semana Integrada do Instituto de Física de São Carlos - SIFSC. Unidade: IFSC

    Assuntos: CRISTALOGRAFIA, BIOQUÍMICA, PROTEÍNAS

    Versão PublicadaComo citar
    A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas

    • ABNT

      ELLENA, Matias Nahuel et al. Mega Protein: Cryo-EM structural determination a 8 MDa molluscan hemocyanin with substantial biomedic impact. 2023, Anais.. São Carlos: Instituto de Física de São Carlos - IFSC, 2023. Disponível em: https://repositorio.usp.br/directbitstream/3a4267a0-db07-41d6-9a46-6a335d421be2/3180223.pdf. Acesso em: 02 dez. 2025.

    • APA

      Ellena, M. N., Fernández, V. C., Ambrosio, A. L. B., Leguia, V. C. G., & Muñoz, S. M. (2023). Mega Protein: Cryo-EM structural determination a 8 MDa molluscan hemocyanin with substantial biomedic impact. In Livro de Resumos. São Carlos: Instituto de Física de São Carlos - IFSC. Recuperado de https://repositorio.usp.br/directbitstream/3a4267a0-db07-41d6-9a46-6a335d421be2/3180223.pdf

    • NLM

      Ellena MN, Fernández VC, Ambrosio ALB, Leguia VCG, Muñoz SM. Mega Protein: Cryo-EM structural determination a 8 MDa molluscan hemocyanin with substantial biomedic impact [Internet]. Livro de Resumos. 2023 ;[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://repositorio.usp.br/directbitstream/3a4267a0-db07-41d6-9a46-6a335d421be2/3180223.pdf

    • Vancouver

      Ellena MN, Fernández VC, Ambrosio ALB, Leguia VCG, Muñoz SM. Mega Protein: Cryo-EM structural determination a 8 MDa molluscan hemocyanin with substantial biomedic impact [Internet]. Livro de Resumos. 2023 ;[citado 2025 dez. 02 ] Available from: https://repositorio.usp.br/directbitstream/3a4267a0-db07-41d6-9a46-6a335d421be2/3180223.pdf

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