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Artigo de periodico
Analysis of twelve genomes of the bacterium Kerstersia gyiorum from brown-throated sloths (Bradypus variegatus), the first from a non-human host (2024)
Huaman, Dennis Carhuaricra; Gonzalez, Irys Hany Lima; Ramos, Patrícia Locosque ; Da Silva, Aline Maria ; Setubal, João Carlos
Fonte: PerrJ. Unidade: IQ
Assuntos: GENOMAS, BACTÉRIAS GRAM-NEGATIVAS
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ABNT
HUAMAN, Dennis Carhuaricra et al. Analysis of twelve genomes of the bacterium Kerstersia gyiorum from brown-throated sloths (Bradypus variegatus), the first from a non-human host. PerrJ, v. 12, p. 1-23 art. e17206, 2024Tradução . . Disponível em: https://dx.doi.org/10.7717/peerj.17206. Acesso em: 02 jul. 2024.
APA
Huaman, D. C., Gonzalez, I. H. L., Ramos, P. L., Da Silva, A. M., & Setubal, J. C. (2024). Analysis of twelve genomes of the bacterium Kerstersia gyiorum from brown-throated sloths (Bradypus variegatus), the first from a non-human host. PerrJ, 12, 1-23 art. e17206. doi:10.7717/peerj.17206
NLM
Huaman DC, Gonzalez IHL, Ramos PL, Da Silva AM, Setubal JC. Analysis of twelve genomes of the bacterium Kerstersia gyiorum from brown-throated sloths (Bradypus variegatus), the first from a non-human host [Internet]. PerrJ. 2024 ; 12 1-23 art. e17206.[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://dx.doi.org/10.7717/peerj.17206
Vancouver
Huaman DC, Gonzalez IHL, Ramos PL, Da Silva AM, Setubal JC. Analysis of twelve genomes of the bacterium Kerstersia gyiorum from brown-throated sloths (Bradypus variegatus), the first from a non-human host [Internet]. PerrJ. 2024 ; 12 1-23 art. e17206.[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://dx.doi.org/10.7717/peerj.17206
Artigo de periodico
The Exometabolome of Xylella fastidiosa in contact with Paraburkholderia phytofirmans supernatant reveals changes in nicotinamide, amino acids, biotin, and plant hormones (2024)
Feitosa Junior, Oséias Rodrigues ; Lubbe, Andrea; Kosina, Suzanne M; Martins Junior, Joaquim ; Barbosa, Deibs ; Baccari, Clelia; Zaini, Paulo Adriano ; Bowen, Benjamin P; Northen, Trent R; Lindow, Steven E; Da Silva, Aline Maria
Fonte: Metabolites. Unidade: IQ
Assuntos: METABOLÔMICA, FITOPATÓGENOS, CROMATOGRAFIA LÍQUIDA, ESPECTROMETRIA DE MASSAS
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ABNT
FEITOSA JUNIOR, Oséias Rodrigues et al. The Exometabolome of Xylella fastidiosa in contact with Paraburkholderia phytofirmans supernatant reveals changes in nicotinamide, amino acids, biotin, and plant hormones. Metabolites, v. 14, p. 1-26 art. 82, 2024Tradução . . Disponível em: https://dx.doi.org/10.3390/metabo14020082. Acesso em: 02 jul. 2024.
APA
Feitosa Junior, O. R., Lubbe, A., Kosina, S. M., Martins Junior, J., Barbosa, D., Baccari, C., et al. (2024). The Exometabolome of Xylella fastidiosa in contact with Paraburkholderia phytofirmans supernatant reveals changes in nicotinamide, amino acids, biotin, and plant hormones. Metabolites, 14, 1-26 art. 82. doi:10.3390/metabo14020082
NLM
Feitosa Junior OR, Lubbe A, Kosina SM, Martins Junior J, Barbosa D, Baccari C, Zaini PA, Bowen BP, Northen TR, Lindow SE, Da Silva AM. The Exometabolome of Xylella fastidiosa in contact with Paraburkholderia phytofirmans supernatant reveals changes in nicotinamide, amino acids, biotin, and plant hormones [Internet]. Metabolites. 2024 ; 14 1-26 art. 82.[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://dx.doi.org/10.3390/metabo14020082
Vancouver
Feitosa Junior OR, Lubbe A, Kosina SM, Martins Junior J, Barbosa D, Baccari C, Zaini PA, Bowen BP, Northen TR, Lindow SE, Da Silva AM. The Exometabolome of Xylella fastidiosa in contact with Paraburkholderia phytofirmans supernatant reveals changes in nicotinamide, amino acids, biotin, and plant hormones [Internet]. Metabolites. 2024 ; 14 1-26 art. 82.[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://dx.doi.org/10.3390/metabo14020082
Artigo de periodico
Discovery and description of novel phage genomes from urban microbiomes sampled by the MetaSUB consortium (2024)
Flores, Vinicius S; Amgarten, Deyvid E; Iha, Bruno Koshin Vásquez; Ryon, Krista A; Danko, David; Tierney, Braden T; Mason, Christopher ; Da Silva, Aline Maria ; Setubal, João Carlos
Fonte: Scientific Reports. Unidades: IQ, BIOINFORMÁTICA
Assuntos: GENOMAS, BIOSFERA
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ABNT
FLORES, Vinicius S et al. Discovery and description of novel phage genomes from urban microbiomes sampled by the MetaSUB consortium. Scientific Reports, v. 14, p. 1-14 art. 7913, 2024Tradução . . Disponível em: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-024-58226-0. Acesso em: 02 jul. 2024.
APA
Flores, V. S., Amgarten, D. E., Iha, B. K. V., Ryon, K. A., Danko, D., Tierney, B. T., et al. (2024). Discovery and description of novel phage genomes from urban microbiomes sampled by the MetaSUB consortium. Scientific Reports, 14, 1-14 art. 7913. doi:10.1038/s41598-024-58226-0
NLM
Flores VS, Amgarten DE, Iha BKV, Ryon KA, Danko D, Tierney BT, Mason C, Da Silva AM, Setubal JC. Discovery and description of novel phage genomes from urban microbiomes sampled by the MetaSUB consortium [Internet]. Scientific Reports. 2024 ; 14 1-14 art. 7913.[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-024-58226-0
Vancouver
Flores VS, Amgarten DE, Iha BKV, Ryon KA, Danko D, Tierney BT, Mason C, Da Silva AM, Setubal JC. Discovery and description of novel phage genomes from urban microbiomes sampled by the MetaSUB consortium [Internet]. Scientific Reports. 2024 ; 14 1-14 art. 7913.[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-024-58226-0
Dissertação (Mestrado)
Recuperação e caracterização de genomas de bacteriófagos a partir de metagenomas de compostagem (2023)
Flores, Vinicius Sousa; Setubal, João Carlos (coorient) ; Da Silva, Aline Maria (Orientador)
Unidade: BIOINFORMÁTICA
Assuntos: COMPOSTAGEM, BACTERIÓFAGOS, GENOMAS, BIOINFORMÁTICA
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ABNT
FLORES, Vinicius Sousa. Recuperação e caracterização de genomas de bacteriófagos a partir de metagenomas de compostagem. 2023. Dissertação (Mestrado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2023. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-09102023-164409/. Acesso em: 02 jul. 2024.
APA
Flores, V. S. (2023). Recuperação e caracterização de genomas de bacteriófagos a partir de metagenomas de compostagem (Dissertação (Mestrado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-09102023-164409/
NLM
Flores VS. Recuperação e caracterização de genomas de bacteriófagos a partir de metagenomas de compostagem [Internet]. 2023 ;[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-09102023-164409/
Vancouver
Flores VS. Recuperação e caracterização de genomas de bacteriófagos a partir de metagenomas de compostagem [Internet]. 2023 ;[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-09102023-164409/
Artigo de periodico
Transcriptome and secretome analyses of endophyte methylobacterium mesophilicum and pathogen Xylella fastidiosa interacting show nutrient competition (2023)
Dourado, Manuella Nóbrega ; Pierry, Paulo Marques ; Feitosa Junior, Oséias Rodrigues ; Uceda-Campos, Guillermo ; Barbosa, Deibs ; Zaini, Paulo Adriano ; Dandekar, Abhaya M. ; Da Silva, Aline Maria ; Araújo, Welington Luiz de
Fonte: Microorganisms. Unidades: ICB, IQ, BIOINFORMÁTICA, FM
Assuntos: MICROBIOLOGIA, BACTÉRIAS GRAM-NEGATIVAS, INFECÇÕES BACTERIANAS GRAM-NEGATIVAS, FITOPATÓGENOS, ANTIOXIDANTES, TRANSCRIÇÃO GÊNICA, PROTEÍNAS DE PLANTAS
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ABNT
DOURADO, Manuella Nóbrega et al. Transcriptome and secretome analyses of endophyte methylobacterium mesophilicum and pathogen Xylella fastidiosa interacting show nutrient competition. Microorganisms, v. 11, n. 11, p. 28 , 2023Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.3390/ microorganisms11112755. Acesso em: 02 jul. 2024.
APA
Dourado, M. N., Pierry, P. M., Feitosa Junior, O. R., Uceda-Campos, G., Barbosa, D., Zaini, P. A., et al. (2023). Transcriptome and secretome analyses of endophyte methylobacterium mesophilicum and pathogen Xylella fastidiosa interacting show nutrient competition. Microorganisms, 11( 11), 28 . doi:https://doi.org/10.3390/ microorganisms11112755
NLM
Dourado MN, Pierry PM, Feitosa Junior OR, Uceda-Campos G, Barbosa D, Zaini PA, Dandekar AM, Da Silva AM, Araújo WL de. Transcriptome and secretome analyses of endophyte methylobacterium mesophilicum and pathogen Xylella fastidiosa interacting show nutrient competition [Internet]. Microorganisms. 2023 ; 11( 11): 28 .[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://doi.org/10.3390/ microorganisms11112755
Vancouver
Dourado MN, Pierry PM, Feitosa Junior OR, Uceda-Campos G, Barbosa D, Zaini PA, Dandekar AM, Da Silva AM, Araújo WL de. Transcriptome and secretome analyses of endophyte methylobacterium mesophilicum and pathogen Xylella fastidiosa interacting show nutrient competition [Internet]. Microorganisms. 2023 ; 11( 11): 28 .[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://doi.org/10.3390/ microorganisms11112755
Tese (Doutorado)
Recuperação de elementos genéticos móveis e prospecção de genes de resistência a antibióticos em dados metagenômicos de compostagem termofílica (2023)
Rodrigues, Remigio Cenepo Escobar; Setubal, João Carlos (coorient) ; Da Silva, Aline Maria (Orientador)
Unidade: BIOINFORMÁTICA
Assuntos: COMPOSTAGEM, BIOINFORMÁTICA
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ABNT
RODRIGUES, Remigio Cenepo Escobar. Recuperação de elementos genéticos móveis e prospecção de genes de resistência a antibióticos em dados metagenômicos de compostagem termofílica. 2023. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2023. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-04122023-211130/. Acesso em: 02 jul. 2024.
APA
Rodrigues, R. C. E. (2023). Recuperação de elementos genéticos móveis e prospecção de genes de resistência a antibióticos em dados metagenômicos de compostagem termofílica (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-04122023-211130/
NLM
Rodrigues RCE. Recuperação de elementos genéticos móveis e prospecção de genes de resistência a antibióticos em dados metagenômicos de compostagem termofílica [Internet]. 2023 ;[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-04122023-211130/
Vancouver
Rodrigues RCE. Recuperação de elementos genéticos móveis e prospecção de genes de resistência a antibióticos em dados metagenômicos de compostagem termofílica [Internet]. 2023 ;[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-04122023-211130/
Artigo de periodico
Draft genome sequence of Enterobacter cloacae ST473 harbouring blaCMH-3 isolated from a human patient diagnosed with recurrent bacteriuria in Nigeria (2023)
David, Ebuka Elijah ; Igwenyi, Ikechuku Okorie ; Iroha, Ifeanyichukwu Romanus; Martins, Layla Farage; Campos, Guillermo Uceda ; Da Silva, Aline Maria
Fonte: Access Microbiology. Unidades: IQ, BIOINFORMÁTICA
Assuntos: ENTEROBACTER, TRATO URINÁRIO, INFECÇÕES POR ENTEROBACTERIACEAE
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ABNT
DAVID, Ebuka Elijah et al. Draft genome sequence of Enterobacter cloacae ST473 harbouring blaCMH-3 isolated from a human patient diagnosed with recurrent bacteriuria in Nigeria. Access Microbiology, v. 3, p. 1-9, 2023Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1099/acmi.0.000565.v3. Acesso em: 02 jul. 2024.
APA
David, E. E., Igwenyi, I. O., Iroha, I. R., Martins, L. F., Campos, G. U., & Da Silva, A. M. (2023). Draft genome sequence of Enterobacter cloacae ST473 harbouring blaCMH-3 isolated from a human patient diagnosed with recurrent bacteriuria in Nigeria. Access Microbiology, 3, 1-9. doi:10.1099/acmi.0.000565.v3
NLM
David EE, Igwenyi IO, Iroha IR, Martins LF, Campos GU, Da Silva AM. Draft genome sequence of Enterobacter cloacae ST473 harbouring blaCMH-3 isolated from a human patient diagnosed with recurrent bacteriuria in Nigeria [Internet]. Access Microbiology. 2023 ; 3 1-9.[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://doi.org/10.1099/acmi.0.000565.v3
Vancouver
David EE, Igwenyi IO, Iroha IR, Martins LF, Campos GU, Da Silva AM. Draft genome sequence of Enterobacter cloacae ST473 harbouring blaCMH-3 isolated from a human patient diagnosed with recurrent bacteriuria in Nigeria [Internet]. Access Microbiology. 2023 ; 3 1-9.[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://doi.org/10.1099/acmi.0.000565.v3
Artigo de periodico
Diversity assessment of photosynthesizers: comparative analysis of pre-cultivated and natural microbiome of sediments from Cerrado biome in Maranhão, Brazil (2022)
Butarelli, Ana Carolina de Araújo ; Ferreira, Lucas Salomão de Sousa ; Riyuzo, Raquel; Dall’Agnol, Hivana Melo Barbosa ; Piroupo, Carlos Morais; Da Silva, Aline Maria ; Setubal, João Carlos ; Dall’Agnol, Leonardo Teixeira
Fonte: Environmental Science and Pollution Research. Unidade: IQ
Assuntos: BIOMA, CERRADO, MICROALGAS
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ABNT
BUTARELLI, Ana Carolina de Araújo et al. Diversity assessment of photosynthesizers: comparative analysis of pre-cultivated and natural microbiome of sediments from Cerrado biome in Maranhão, Brazil. Environmental Science and Pollution Research, v. 29, n. 51, p. 77359-77374, 2022Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1007/s11356-022-21229-3. Acesso em: 02 jul. 2024.
APA
Butarelli, A. C. de A., Ferreira, L. S. de S., Riyuzo, R., Dall’Agnol, H. M. B., Piroupo, C. M., Da Silva, A. M., et al. (2022). Diversity assessment of photosynthesizers: comparative analysis of pre-cultivated and natural microbiome of sediments from Cerrado biome in Maranhão, Brazil. Environmental Science and Pollution Research, 29( 51), 77359-77374. doi:10.1007/s11356-022-21229-3
NLM
Butarelli AC de A, Ferreira LS de S, Riyuzo R, Dall’Agnol HMB, Piroupo CM, Da Silva AM, Setubal JC, Dall’Agnol LT. Diversity assessment of photosynthesizers: comparative analysis of pre-cultivated and natural microbiome of sediments from Cerrado biome in Maranhão, Brazil [Internet]. Environmental Science and Pollution Research. 2022 ; 29( 51): 77359-77374.[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://doi.org/10.1007/s11356-022-21229-3
Vancouver
Butarelli AC de A, Ferreira LS de S, Riyuzo R, Dall’Agnol HMB, Piroupo CM, Da Silva AM, Setubal JC, Dall’Agnol LT. Diversity assessment of photosynthesizers: comparative analysis of pre-cultivated and natural microbiome of sediments from Cerrado biome in Maranhão, Brazil [Internet]. Environmental Science and Pollution Research. 2022 ; 29( 51): 77359-77374.[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://doi.org/10.1007/s11356-022-21229-3
Trabalho de evento-resumo
Isolation and characterization of Pseudomonas_Phage_P1_LAFX against a carbapenem resistant Pseudomonas aeruginosa (2022)
Santos Junior, Ariosvaldo Pereira dos ; Martins, Layla Farage; Rossi, Fernando Pacheco Nobre ; Amgarten, Deyvid Emanuel ; Da Silva, Aline Maria
Fonte: Abstract Book. Nome do evento: Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology/SBBq. Unidades: IQ, BIOINFORMÁTICA
Assuntos: PSEUDOMONAS, SEQUENCIAMENTO GENÉTICO
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ABNT
SANTOS JUNIOR, Ariosvaldo Pereira dos et al. Isolation and characterization of Pseudomonas_Phage_P1_LAFX against a carbapenem resistant Pseudomonas aeruginosa. 2022, Anais.. São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2022. Disponível em: https://www2.sbbq.org.br/reuniao/2022/images/livro_completo.pdf. Acesso em: 02 jul. 2024.
APA
Santos Junior, A. P. dos, Martins, L. F., Rossi, F. P. N., Amgarten, D. E., & Da Silva, A. M. (2022). Isolation and characterization of Pseudomonas_Phage_P1_LAFX against a carbapenem resistant Pseudomonas aeruginosa. In Abstract Book. São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. Recuperado de https://www2.sbbq.org.br/reuniao/2022/images/livro_completo.pdf
NLM
Santos Junior AP dos, Martins LF, Rossi FPN, Amgarten DE, Da Silva AM. Isolation and characterization of Pseudomonas_Phage_P1_LAFX against a carbapenem resistant Pseudomonas aeruginosa [Internet]. Abstract Book. 2022 ;[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://www2.sbbq.org.br/reuniao/2022/images/livro_completo.pdf
Vancouver
Santos Junior AP dos, Martins LF, Rossi FPN, Amgarten DE, Da Silva AM. Isolation and characterization of Pseudomonas_Phage_P1_LAFX against a carbapenem resistant Pseudomonas aeruginosa [Internet]. Abstract Book. 2022 ;[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://www2.sbbq.org.br/reuniao/2022/images/livro_completo.pdf
Artigo de periodico
The XadA trimeric autotransporter adhesins in Xylella fastidiosa differentially contribute to cell aggregation, biofilm formation, insect transmission and virulence to plants (2022)
Feitosa Junior, Oséias Rodrigues ; Souza, Ana Paula Silva de; Zaini, Paulo A; Baccari, Clelia; Ionescu, Michael; Pierry, Paulo Marques ; Campos, Guillermo Uceda ; Labroussaa, Fabien ; Almeida, Rodrigo P. P; Lindow, Steven E; Da Silva, Aline Maria
Fonte: Molecular Plant-Microbe Interactions. Unidades: IQ, BIOINFORMÁTICA
Assuntos: BIOFILMES, VIRULÊNCIA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
FEITOSA JUNIOR, Oséias Rodrigues et al. The XadA trimeric autotransporter adhesins in Xylella fastidiosa differentially contribute to cell aggregation, biofilm formation, insect transmission and virulence to plants. Molecular Plant-Microbe Interactions, v. 35, n. 9, p. 857–866, 2022Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1094/MPMI-05-22-0108-R. Acesso em: 02 jul. 2024.
APA
Feitosa Junior, O. R., Souza, A. P. S. de, Zaini, P. A., Baccari, C., Ionescu, M., Pierry, P. M., et al. (2022). The XadA trimeric autotransporter adhesins in Xylella fastidiosa differentially contribute to cell aggregation, biofilm formation, insect transmission and virulence to plants. Molecular Plant-Microbe Interactions, 35( 9), 857–866. doi:10.1094/MPMI-05-22-0108-R
NLM
Feitosa Junior OR, Souza APS de, Zaini PA, Baccari C, Ionescu M, Pierry PM, Campos GU, Labroussaa F, Almeida RPP, Lindow SE, Da Silva AM. The XadA trimeric autotransporter adhesins in Xylella fastidiosa differentially contribute to cell aggregation, biofilm formation, insect transmission and virulence to plants [Internet]. Molecular Plant-Microbe Interactions. 2022 ; 35( 9): 857–866.[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://doi.org/10.1094/MPMI-05-22-0108-R
Vancouver
Feitosa Junior OR, Souza APS de, Zaini PA, Baccari C, Ionescu M, Pierry PM, Campos GU, Labroussaa F, Almeida RPP, Lindow SE, Da Silva AM. The XadA trimeric autotransporter adhesins in Xylella fastidiosa differentially contribute to cell aggregation, biofilm formation, insect transmission and virulence to plants [Internet]. Molecular Plant-Microbe Interactions. 2022 ; 35( 9): 857–866.[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://doi.org/10.1094/MPMI-05-22-0108-R
Tese (Doutorado)
Machine learning prediction in genomic sequences of prokaryotic viruses from metagenomic datasets (2022)
Amgarten, Deyvid Emanuel ; Setubal, João Carlos (Orientador) ; Da Silva, Aline Maria (coorient)
Unidade: BIOINFORMÁTICA
Assuntos: APRENDIZADO COMPUTACIONAL, BACTERIÓFAGOS, VÍRUS
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
AMGARTEN, Deyvid Emanuel. Machine learning prediction in genomic sequences of prokaryotic viruses from metagenomic datasets. 2022. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2022. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-17022022-091454/. Acesso em: 02 jul. 2024.
APA
Amgarten, D. E. (2022). Machine learning prediction in genomic sequences of prokaryotic viruses from metagenomic datasets (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-17022022-091454/
NLM
Amgarten DE. Machine learning prediction in genomic sequences of prokaryotic viruses from metagenomic datasets [Internet]. 2022 ;[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-17022022-091454/
Vancouver
Amgarten DE. Machine learning prediction in genomic sequences of prokaryotic viruses from metagenomic datasets [Internet]. 2022 ;[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-17022022-091454/
Artigo de periodico
vHULK, a new tool for bacteriophage host prediction based on annotated genomic features and deep neural networks (2022)
Amgarten, Deyvid Emanuel ; Iha, Bruno Koshin Vásquez ; Piroupo, Carlos Morais ; Da Silva, Aline Maria ; Setubal, João Carlos
Fonte: bioRxiv. Unidades: IQ, BIOINFORMÁTICA
Assuntos: BACTERIÓFAGOS, REDES NEURAIS, GENÔMICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
AMGARTEN, Deyvid Emanuel et al. vHULK, a new tool for bacteriophage host prediction based on annotated genomic features and deep neural networks. bioRxiv, p. 1-16, 2022Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1101/2020.12.06.413476. Acesso em: 02 jul. 2024.
APA
Amgarten, D. E., Iha, B. K. V., Piroupo, C. M., Da Silva, A. M., & Setubal, J. C. (2022). vHULK, a new tool for bacteriophage host prediction based on annotated genomic features and deep neural networks. bioRxiv, 1-16. doi:10.1101/2020.12.06.413476
NLM
Amgarten DE, Iha BKV, Piroupo CM, Da Silva AM, Setubal JC. vHULK, a new tool for bacteriophage host prediction based on annotated genomic features and deep neural networks [Internet]. bioRxiv. 2022 ; 1-16.[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://doi.org/10.1101/2020.12.06.413476
Vancouver
Amgarten DE, Iha BKV, Piroupo CM, Da Silva AM, Setubal JC. vHULK, a new tool for bacteriophage host prediction based on annotated genomic features and deep neural networks [Internet]. bioRxiv. 2022 ; 1-16.[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://doi.org/10.1101/2020.12.06.413476
Artigo de periodico
Isolation and characterization of vB_XciM_LucasX, a new jumbo phage that infects Xanthomonas citri and Xanthomonas fuscans (2022)
Marquioni, Vinícius ; Rossi, Fernando Pacheco Nobre ; Mendonça, Déborah Cezar; Martins, Layla Farage; Behlau, Franklin; Setubal, João Carlos ; Da Silva, Aline Maria ; Novo-Mansur, Maria Teresa Marques
Fonte: PLOS ONE. Unidades: IQ, BIOINFORMÁTICA, IFSC
Assuntos: CANCRO (DOENÇA DE PLANTA), XANTHOMONAS, FRUTAS CÍTRICAS
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ABNT
MARQUIONI, Vinícius et al. Isolation and characterization of vB_XciM_LucasX, a new jumbo phage that infects Xanthomonas citri and Xanthomonas fuscans. PLOS ONE, v. 17, n. 4, p. e0266891-1-e0266891-19 + supporting information, 2022Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0266891. Acesso em: 02 jul. 2024.
APA
Marquioni, V., Rossi, F. P. N., Mendonça, D. C., Martins, L. F., Behlau, F., Setubal, J. C., et al. (2022). Isolation and characterization of vB_XciM_LucasX, a new jumbo phage that infects Xanthomonas citri and Xanthomonas fuscans. PLOS ONE, 17( 4), e0266891-1-e0266891-19 + supporting information. doi:10.1371/journal.pone.0266891
NLM
Marquioni V, Rossi FPN, Mendonça DC, Martins LF, Behlau F, Setubal JC, Da Silva AM, Novo-Mansur MTM. Isolation and characterization of vB_XciM_LucasX, a new jumbo phage that infects Xanthomonas citri and Xanthomonas fuscans [Internet]. PLOS ONE. 2022 ; 17( 4): e0266891-1-e0266891-19 + supporting information.[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0266891
Vancouver
Marquioni V, Rossi FPN, Mendonça DC, Martins LF, Behlau F, Setubal JC, Da Silva AM, Novo-Mansur MTM. Isolation and characterization of vB_XciM_LucasX, a new jumbo phage that infects Xanthomonas citri and Xanthomonas fuscans [Internet]. PLOS ONE. 2022 ; 17( 4): e0266891-1-e0266891-19 + supporting information.[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0266891
Artigo de periodico
Comparative genomics of xylella fastidiosa explores candidate host-specificity determinants and expands the known repertoire of mobile genetic elements and immunity systems (2022)
Campos, Guillermo Uceda ; Feitosa Junior, Oséias Rodrigues ; Santiago, Caio Rafael do Nascimento; Pierry, Paulo Marques ; Zaini, Paulo A.; Santana, Wesley Oliveira de; Martins Junior, Joaquim ; Barbosa, Deibs ; Digiampietri, Luciano Antonio ; Setubal, João Carlos ; Da Silva, Aline Maria
Fonte: Microorganisms. Unidades: EACH, BIOINFORMÁTICA, IQ, FM
Assuntos: FITOPATÓGENOS, PLANTAS, GENOMAS, SURTOS DE DOENÇAS, VIRULÊNCIA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
CAMPOS, Guillermo Uceda et al. Comparative genomics of xylella fastidiosa explores candidate host-specificity determinants and expands the known repertoire of mobile genetic elements and immunity systems. Microorganisms, v. 10, n. 5, p. 914 ( 01-20), 2022Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.3390/microorganisms10050914. Acesso em: 02 jul. 2024.
APA
Campos, G. U., Feitosa Junior, O. R., Santiago, C. R. do N., Pierry, P. M., Zaini, P. A., Santana, W. O. de, et al. (2022). Comparative genomics of xylella fastidiosa explores candidate host-specificity determinants and expands the known repertoire of mobile genetic elements and immunity systems. Microorganisms, 10( 5), 914 ( 01-20). doi:10.3390/microorganisms10050914
NLM
Campos GU, Feitosa Junior OR, Santiago CR do N, Pierry PM, Zaini PA, Santana WO de, Martins Junior J, Barbosa D, Digiampietri LA, Setubal JC, Da Silva AM. Comparative genomics of xylella fastidiosa explores candidate host-specificity determinants and expands the known repertoire of mobile genetic elements and immunity systems [Internet]. Microorganisms. 2022 ; 10( 5): 914 ( 01-20).[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://doi.org/10.3390/microorganisms10050914
Vancouver
Campos GU, Feitosa Junior OR, Santiago CR do N, Pierry PM, Zaini PA, Santana WO de, Martins Junior J, Barbosa D, Digiampietri LA, Setubal JC, Da Silva AM. Comparative genomics of xylella fastidiosa explores candidate host-specificity determinants and expands the known repertoire of mobile genetic elements and immunity systems [Internet]. Microorganisms. 2022 ; 10( 5): 914 ( 01-20).[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://doi.org/10.3390/microorganisms10050914
Artigo de periodico
Genomic characterization of Bacillus safensis isolated from mine tailings in Peru and evaluation of its cyanide-degrading enzyme CynD (2022)
Arévalo, Santiago Justo ; Sifuentes, Daniela Zapata ; Portocarrero, Andrea Cuba; Reátegui, Michella Brescia; Pimente, Claudia Monge; Martins, Layla Farage; Pierry, Paulo Marques ; Piroupo, Carlos Morais; Cruz, Alcides Guerra Santa; Aguilar, Mauro Quiñones; Farah, Chuck Shaker ; Setubal, João Carlos ; Da Silva, Aline Maria
Fonte: Applied and Environmental Microbiology. Unidade: IQ
Assuntos: GENÔMICA, SEQUENCIAMENTO GENÉTICO, ENZIMAS, BACTÉRIAS GRAM-POSITIVAS
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
ARÉVALO, Santiago Justo et al. Genomic characterization of Bacillus safensis isolated from mine tailings in Peru and evaluation of its cyanide-degrading enzyme CynD. Applied and Environmental Microbiology, v. 88, n. 14, p. 1-14, 2022Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1128/aem.00916-22. Acesso em: 02 jul. 2024.
APA
Arévalo, S. J., Sifuentes, D. Z., Portocarrero, A. C., Reátegui, M. B., Pimente, C. M., Martins, L. F., et al. (2022). Genomic characterization of Bacillus safensis isolated from mine tailings in Peru and evaluation of its cyanide-degrading enzyme CynD. Applied and Environmental Microbiology, 88( 14), 1-14. doi:10.1128/aem.00916-22
NLM
Arévalo SJ, Sifuentes DZ, Portocarrero AC, Reátegui MB, Pimente CM, Martins LF, Pierry PM, Piroupo CM, Cruz AGS, Aguilar MQ, Farah CS, Setubal JC, Da Silva AM. Genomic characterization of Bacillus safensis isolated from mine tailings in Peru and evaluation of its cyanide-degrading enzyme CynD [Internet]. Applied and Environmental Microbiology. 2022 ; 88( 14): 1-14.[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://doi.org/10.1128/aem.00916-22
Vancouver
Arévalo SJ, Sifuentes DZ, Portocarrero AC, Reátegui MB, Pimente CM, Martins LF, Pierry PM, Piroupo CM, Cruz AGS, Aguilar MQ, Farah CS, Setubal JC, Da Silva AM. Genomic characterization of Bacillus safensis isolated from mine tailings in Peru and evaluation of its cyanide-degrading enzyme CynD [Internet]. Applied and Environmental Microbiology. 2022 ; 88( 14): 1-14.[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://doi.org/10.1128/aem.00916-22
Tese (Doutorado)
Diversidade taxonômica e funcional da microbiota de fezes de macacos bugios (Alouatta spp.) de cativeiro e vida livre (2022)
Franco, Raquel Riyuzo de Almeida; Setubal, João Carlos (coorient) ; Da Silva, Aline Maria (Orientador)
Unidade: BIOINFORMÁTICA
Assuntos: MICROBIOLOGIA, BUGIO, BIOINFORMÁTICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
FRANCO, Raquel Riyuzo de Almeida. Diversidade taxonômica e funcional da microbiota de fezes de macacos bugios (Alouatta spp.) de cativeiro e vida livre. 2022. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2022. Disponível em: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-14022023-130156/. Acesso em: 02 jul. 2024.
APA
Franco, R. R. de A. (2022). Diversidade taxonômica e funcional da microbiota de fezes de macacos bugios (Alouatta spp.) de cativeiro e vida livre (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-14022023-130156/
NLM
Franco RR de A. Diversidade taxonômica e funcional da microbiota de fezes de macacos bugios (Alouatta spp.) de cativeiro e vida livre [Internet]. 2022 ;[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-14022023-130156/
Vancouver
Franco RR de A. Diversidade taxonômica e funcional da microbiota de fezes de macacos bugios (Alouatta spp.) de cativeiro e vida livre [Internet]. 2022 ;[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-14022023-130156/
Curadoria
Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology - SBBq, 51/ Congress of the Brazilian Biophysical Society - LAFEBS, 46 (2022)
Costa Filho, Antonio José da (cur) ; Da Silva, Aline Maria (cur) ; Reis, Eduardo Moraes (cur) ; Barbosa, Leandro Ramos Souza (cur) ; Baptista, Maurício da Silva (cur) ; Ciancaglini, Pietro (cur) ; Garratt, Richard Charles (cur) ; Miyamoto, Sayuri (cur) ; Terra, Walter Ribeiro (cur)
Unidades: FFCLRP, IQ, IF, IFSC
Assuntos: BIOFÍSICA, BIOQUÍMICA, BIOLOGIA MOLECULAR, EVENTOS
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ABNT
Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology - SBBq, 51/ Congress of the Brazilian Biophysical Society - LAFEBS, 46. . São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq. . Acesso em: 02 jul. 2024. , 2022
APA
Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology - SBBq, 51/ Congress of the Brazilian Biophysical Society - LAFEBS, 46. (2022). Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology - SBBq, 51/ Congress of the Brazilian Biophysical Society - LAFEBS, 46. São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq.
NLM
Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology - SBBq, 51/ Congress of the Brazilian Biophysical Society - LAFEBS, 46. 2022 ;[citado 2024 jul. 02 ]
Vancouver
Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology - SBBq, 51/ Congress of the Brazilian Biophysical Society - LAFEBS, 46. 2022 ;[citado 2024 jul. 02 ]
Artigo de periodico
Cyanobacterial diversity through culture-dependent and independent approaches in Chapada das Mesas National Park, Maranhão, Brazil (2022)
Butarelli, Ana Carolina de Araújo ; Ferreira, Lucas Salomão de Sousa ; Riyuzo, Raquel; Dall'Agnol, Hivana Melo Barbosa ; Piroupo, Carlos Moraes; Da Silva, Aline Maria ; Setubal, João Carlos ; Dall'Agnol, Leonardo Teixeira
Fonte: Environmental Science and Pollution Research. Unidade: IQ
Assuntos: BIOMA, CERRADO, BIODIVERSIDADE, SEDIMENTOLOGIA
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ABNT
BUTARELLI, Ana Carolina de Araújo et al. Cyanobacterial diversity through culture-dependent and independent approaches in Chapada das Mesas National Park, Maranhão, Brazil. Environmental Science and Pollution Research, 2022Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-1254910/v1. Acesso em: 02 jul. 2024.
APA
Butarelli, A. C. de A., Ferreira, L. S. de S., Riyuzo, R., Dall'Agnol, H. M. B., Piroupo, C. M., Da Silva, A. M., et al. (2022). Cyanobacterial diversity through culture-dependent and independent approaches in Chapada das Mesas National Park, Maranhão, Brazil. Environmental Science and Pollution Research. doi:10.21203/rs.3.rs-1254910/v1
NLM
Butarelli AC de A, Ferreira LS de S, Riyuzo R, Dall'Agnol HMB, Piroupo CM, Da Silva AM, Setubal JC, Dall'Agnol LT. Cyanobacterial diversity through culture-dependent and independent approaches in Chapada das Mesas National Park, Maranhão, Brazil [Internet]. Environmental Science and Pollution Research. 2022 ;[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-1254910/v1
Vancouver
Butarelli AC de A, Ferreira LS de S, Riyuzo R, Dall'Agnol HMB, Piroupo CM, Da Silva AM, Setubal JC, Dall'Agnol LT. Cyanobacterial diversity through culture-dependent and independent approaches in Chapada das Mesas National Park, Maranhão, Brazil [Internet]. Environmental Science and Pollution Research. 2022 ;[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-1254910/v1
Trabalho de evento-resumo
Distribution, diversity, and dynamics of prokaryotic immune systems in mobile genetic elements of prokaryotic genomes and metagenomes (2022)
Campos, Guillermo Uceda ; Setubal, João Carlos ; Da Silva, Aline Maria
Fonte: Abstract Book. Nome do evento: Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology/SBBq. Unidades: IQ, BIOINFORMÁTICA
Assuntos: BACTERIÓFAGOS, GENÔMICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
CAMPOS, Guillermo Uceda e SETUBAL, João Carlos e DA SILVA, Aline Maria. Distribution, diversity, and dynamics of prokaryotic immune systems in mobile genetic elements of prokaryotic genomes and metagenomes. 2022, Anais.. São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2022. Disponível em: https://www2.sbbq.org.br/reuniao/2022/images/livro_completo.pdf. Acesso em: 02 jul. 2024.
APA
Campos, G. U., Setubal, J. C., & Da Silva, A. M. (2022). Distribution, diversity, and dynamics of prokaryotic immune systems in mobile genetic elements of prokaryotic genomes and metagenomes. In Abstract Book. São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. Recuperado de https://www2.sbbq.org.br/reuniao/2022/images/livro_completo.pdf
NLM
Campos GU, Setubal JC, Da Silva AM. Distribution, diversity, and dynamics of prokaryotic immune systems in mobile genetic elements of prokaryotic genomes and metagenomes [Internet]. Abstract Book. 2022 ;[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://www2.sbbq.org.br/reuniao/2022/images/livro_completo.pdf
Vancouver
Campos GU, Setubal JC, Da Silva AM. Distribution, diversity, and dynamics of prokaryotic immune systems in mobile genetic elements of prokaryotic genomes and metagenomes [Internet]. Abstract Book. 2022 ;[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://www2.sbbq.org.br/reuniao/2022/images/livro_completo.pdf
Trabalho de evento-resumo
Bacterial and fungal interactions in leaves, rhizosphere and roots of soybean and maize based on co-occurrence networks (2022)
Campos, Guillermo Uceda ; Rossmann, Maike ; Thomas, Andrew Maltez ; Guima, Suzana Eiko Sato ; Martins, Layla Farage; Da Silva, Aline Maria ; Setubal, João Carlos
Fonte: Abstract Book. Nome do evento: Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology/SBBq. Unidades: IQ, BIOINFORMÁTICA
Assuntos: RIZOSFERA, BACTÉRIAS, FUNGOS
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
CAMPOS, Guillermo Uceda et al. Bacterial and fungal interactions in leaves, rhizosphere and roots of soybean and maize based on co-occurrence networks. 2022, Anais.. São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2022. Disponível em: https://www2.sbbq.org.br/reuniao/2022/images/livro_completo.pdf. Acesso em: 02 jul. 2024.
APA
Campos, G. U., Rossmann, M., Thomas, A. M., Guima, S. E. S., Martins, L. F., Da Silva, A. M., & Setubal, J. C. (2022). Bacterial and fungal interactions in leaves, rhizosphere and roots of soybean and maize based on co-occurrence networks. In Abstract Book. São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. Recuperado de https://www2.sbbq.org.br/reuniao/2022/images/livro_completo.pdf
NLM
Campos GU, Rossmann M, Thomas AM, Guima SES, Martins LF, Da Silva AM, Setubal JC. Bacterial and fungal interactions in leaves, rhizosphere and roots of soybean and maize based on co-occurrence networks [Internet]. Abstract Book. 2022 ;[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://www2.sbbq.org.br/reuniao/2022/images/livro_completo.pdf
Vancouver
Campos GU, Rossmann M, Thomas AM, Guima SES, Martins LF, Da Silva AM, Setubal JC. Bacterial and fungal interactions in leaves, rhizosphere and roots of soybean and maize based on co-occurrence networks [Internet]. Abstract Book. 2022 ;[citado 2024 jul. 02 ] Available from: https://www2.sbbq.org.br/reuniao/2022/images/livro_completo.pdf

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